La phylogénie : une aide à la physiologie

Présentation au sujet: "La phylogénie : une aide à la physiologie"— Transcription de la présentation:

1 La phylogénie : une aide à la physiologie
Philippe Monget INRA Physiologie de la Reproduction et des Comportements

2 Gène d’hyperprolificité BMP-15

3 Cambridge : S77F and Q239STOP
Ovarian Follicular population in hyperprolific Inverdale, Hanna, Cambridge and Lacaune ewes Inverdale : V31D Hanna : Q23STOP Cambridge : S77F and Q239STOP Lacaune : C53Y Heterozygous ewes BMP15 +/- Ovulation rate = 3 BMP15 Partial loss of function (50%) Wild type ewes +/- Ovulation rate = 1 BMP15 Homozygous ewes BMP15 -/- Sterile BMP15 Complete loss of function

4 Invalidation of oocyte-expressed BMP-15 in the mouse
+/+ +/- -/- …different from BMP-15 -/- ewes

5 A qualitative or quantitative role of BMP-15 in the regulation of ovulation rate in vertebrates ?
BMP-15 -/-: sterile BMP-15 -/-: fertile BMP-15 (defect of processing?) BMP-15 Ovulation rate ? 15-25 ?

6 BMP BMPs ubiquistes BMPs ovocytaires BMP5 BMP6 BMP2 BMP4 GDF7 BMP15
BMP15 de zebrafish

7 La fécondation

8 Fécondation in vitro : différence porc/cheval
Pas de pénétration Polyspermie --> Etude comparée de la fécondation

9 ? Fixation des spermatozoïdes sur la zone pellucide
de l’ovocyte et réaction acrosomique Protéines de la zone pellucide

10 Clarification de la nomenclature des gènes ZP chez les mammifères

11 Clarification de la nomenclature des gènes ZP
chez les mammifères ZPA ZPC ZPB ZP1 ZP2 ZP3 ZP3A ZP4 ZPA ZPC ZP1 ZP2 ZP3 ZPA ZPC ZPB ZP2 ZP3 ZP3B ZP4 ZPA ZPC ZPB ZP1 ZP2 ZP3a ZP3b ZP4 ZP3

12 ZPC/ZP3 ZP3 Trichosurus vulpecula AAC28736
ZPC/ZP3 Sus scrofa NM_213893 ZPC/ZP3 Bos taurus NM_173974 ZPC/ZP3 Canis familiaris NM_ ZPC/ZP3 Felis catus NM_ ZPC/ZP3 Callithrix sp. S71825 ZPC Macaca fascicularis AY222644 ZPC/ZP3 Macaca radiata X82639 ZPC/ZP3 Homo sapiens NM_007155 ZPC/ZP3 Oryctolagus cuniculus U05782 ZP3 Rattus norvegicus NM_053762 ZPC/ZP3 Mus musculus NM_011776 97,90,99 69,57,90 93,83,99 100,*,* 86,*,* 49,*,* 95,*,* 99,97,100 99,*,* 53,*,70 ZPC/ZP3 Vulpes vulpes AY598032 ZPC Mustela erminea AY648050 ZPC Mustela putorius furo AY702973 ZP3 Mesocricetus auratus A60503 ZP3 Microtus brandti AF304487 ZP3 Lagurus lagurus AF515621 ZPC Notomys alexis AY078054 ZPC Pseudomys australis AY078055 ZP3 Rattus rattus diardii AY338396 ZP3 Mus sp. AAB24273 100,100,100 41,61,98 99,92,99 99,99,99 100,99,96 80,65,94 99,95,97 100,100, 97 99,98,94 ZPC/ZP3

13 ZPD/ ZP1 ZPB/ ZP4 ZPA/ZP2 DMBT1 Canis familiaris
DMBT1 Sus scrofa NM_ Similar to DMBT1 Bos taurus DMBT1 Mus musculus AB005909 Similar to DMBT1 Homo sapiens XM_940472 Similar to Cuzd1 Canis familiaris XM_544054 Transmembrane protein UO-44D Homo sapiens AAP15458 ERG1 Rattus norvegicus AF167170 Cuzd1 Rattus norvegicus BC090345 Cuzd1 Mus musculus NM_008411 ZP1 Mus musculus NM_009580 ZPD/ ZP1 ZPB/ ZP4 ZP1 Rattus norvegicus NM_053509 ZP1 Homo sapiens NM_207341 ZP1 Pan troglodytes XM_522022 ZPB/ZP4 Homo sapiens NM_021186 ZPB/ZP4 Pan troglodytes XM_525105 ZPB/ZP4 Macaca radiata Y10381 ZPB Macaca fascicularis AY222647 ZPB Papio cynocephalus AY222646 ZPB/ZP4 Macaca radiata Y10381 ZPB/ZP4 Callithrix jacchus Y10822 ZPB/ZP4 Bos taurus NM_173975 ZPB/ZP4 Sus scrofa NM_214045 ZPB/ZP4 Oryctolagus cuniculus M58160 ZPB Canis familiaris AY573930 ZPB Mustela erminea AY779766 ZPB/ZP4 Felis catus NM_ ZPB/ZP4 Rattus norvegicus NM_172330 ZPB Trichosurus vulpecula AF263013 ZPA Trichosurus vulpecula AF263014 ZPA/ZP2 ZPA Mesocricetus auratus AY876920 ZPA/ZP2 Rattus norvegicus NM_031150 ZPA/ZP2 Mus musculus NM_011775 ZPA/ZP2 Oryctolagus cuniculus L12167 ZPA/ZP2 Felis catus NM_ ZPA/ZP2 Canis familiaris NM_ ZPA/ZP2 Vulpes vulpes AY598031 ZPA/ZP2 Bos taurus NM_173973 ZPA/ZP2 Sus scrofa NM_213848 ZP2 Callithrix jacchus Y10767 ZPA/ZP2 Macaca radiata Y10690 ZPA/ZP2 Macaca fascicularis AY222645 ZPA/ZP2 Pan troglodytes XM_510869 ZPA/ZP2 Homo sapiens NM_003460

14 Clarification de la nomenclature des gènes ZP
chez les mammifères Chien Bovin Porc Chat Lapin Homme Chimpanzé Rat Souris ZPA/ZP2 ZPC/ZP3 ZPD/ZP1 ZPA/ZP2 ZPB/ZP4 ZPD/ZP1 ZPC/ZP3 ZPA/ZP2 ZPB/ZP4 ZPC/ZP3

15 Pseudogène ZP4 de souris

16 Exprimée dans l’oviducte et l’endomètre !
DMBT1 Canis familiaris DMBT1 Sus scrofa NM_ Similar to DMBT1 Bos taurus DMBT1 Mus musculus AB005909 CUZ/ ZP Exprimée dans l’oviducte et l’endomètre ! Similar to DMBT1 Homo sapiens XM_940472 Similar to Cuzd1 Canis familiaris XM_544054 Transmembrane protein UO-44D Homo sapiens AAP15458 ERG1 Rattus norvegicus AF167170 Cuzd1 Rattus norvegicus BC090345 Cuzd1 Mus musculus NM_008411 ZP1 Mus musculus NM_009580 ZPD/ ZP1 ZPA/ZP2 ZPB/ ZP4 ZP1 Rattus norvegicus NM_053509 ZP1 Homo sapiens NM_207341 ZP1 Pan troglodytes XM_522022 ZPB/ZP4 Homo sapiens NM_021186 ZPB/ZP4 Pan troglodytes XM_525105 ZPB/ZP4 Macaca radiata Y10381 ZPB Macaca fascicularis AY222647 ZPB Papio cynocephalus AY222646 ZPB/ZP4 Macaca radiata Y10381 ZPB/ZP4 Callithrix jacchus Y10822 ZPB/ZP4 Bos taurus NM_173975 ZPB/ZP4 Sus scrofa NM_214045 ZPB/ZP4 Oryctolagus cuniculus M58160 ZPB Canis familiaris AY573930 ZPB Mustela erminea AY779766 ZPB/ZP4 Felis catus NM_ ZPB/ZP4 Rattus norvegicus NM_172330 ZPB Trichosurus vulpecula AF263013 ZPA Trichosurus vulpecula AF263014 ZPA Mesocricetus auratus AY876920 ZPA/ZP2 Rattus norvegicus NM_031150 ZPA/ZP2 Mus musculus NM_011775 ZPA/ZP2 Oryctolagus cuniculus L12167 ZPA/ZP2 Felis catus NM_ ZPA/ZP2 Canis familiaris NM_ ZPA/ZP2 Vulpes vulpes AY598031 ZPA/ZP2 Bos taurus NM_173973 ZPA/ZP2 Sus scrofa NM_213848 ZP2 Callithrix jacchus Y10767 ZPA/ZP2 Macaca radiata Y10690 ZPA/ZP2 Macaca fascicularis AY222645 ZPA/ZP2 Pan troglodytes XM_510869 ZPA/ZP2 Homo sapiens NM_003460

17 Une nouvelle zp qui vient de l’oviducte ???
ZPA/ZP2 ZPC/ZP3 ZPD/ZP1 Clarification de la nomenclature des gènes ZP chez les mammifères: Une nouvelle zp qui vient de l’oviducte ??? CUZ/ZP Cellules épithéliales tubaires

18 Une famille de gènes en pleine expansion :
Les oogénésines

19 Oogenesin-1 ?? Oogenesin-2 Oogenesin-4 Mm Mm.25370 Oogenesin-3 50 kb Pramel 1 Mm.26222 Mm Mm.28722 Mm.31283 Tissue of expression Spermatogonia Oocyte Oocyte Oocyte Oocyte Oocyte Oocyte Methodology RT-PCR In situ hybridization In silico + + + + + + +

20 RT-PCR A B C Oogenesin-2 Oogenesin-3 Oogenesin-4 Actin Oogenesin-2
O T M Lu Sp Br Li K Sk H St G - A Oogenesin-2 Oogenesin-3 Oogenesin-4 Actin O T M Lu Sp Br Li K Sk H B Oogenesin-2 Oogenesin-3 Oogenesin-4 O T C Oogenesin-4 RT-PCR

21 Perspectives 2007 Coupe du monde de rugby en France