BACTERIES et INFECTIONS ORL

Name: BACTERIES et INFECTIONS ORL
Uploaded: 2017-08-26T14:14:04+00:00
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Description: BACTERIES et INFECTIONS ORL

BACTERIES et INFECTIONS ORL
Streptocoque du groupe A Corynebacterium diphteriae D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice
Streptocoque A Pasteur 1879 dans un pus d’abcès (chapelet) Dick 1924 scarlatine Lancefield classification antigénique A à T (groupable /non groupable) complète et/ou remplace la classification basée sur l’hémolyse 1936 sulfamides: fièvre puerpérale post partum Bactérie du genre Streptococcus, famille des Streptococcaceae Cocci à Gram positif,catalase négative, à métabolisme anaérobie D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Habitat-Pouvoir pathogène
Streptocoques: nombreuses espèces Parasite pour espèce humaine(A,C,G) Commensaux des muqueuses(B, D ) Bactéries pyogènes Streptocoque ß hémolytique du groupe A de Lancefield ou Streptococcus pyogenes Réaction immunologique de l’hôte => taux élevé d’ anticorps spécifiques et d’autoanticorps D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Les maladies Angine rouge ou érythémato-pultacée due à S.A , C, G.(ß-hémolytique) Fièvre °C,dysphagie (inflammation amygdalienne et péri-amygdalienne), adénopathie satellite, céphalées et asthénie. Autres infections aigues: Cutanées- Muqueuses(impétigo-érysipèle) Septicémiques(secondaires à une plaie ou infection locale: fièvre puerpérale, endocardite, méningite) Scarlatine: Diffusion d’une toxine érythrogène à partir du foyer angineux( IDR de Dick) Syndrome de choc toxique + défaillance viscérale multiple TSLS Affections auto-immunes (S.A) dues à la parenté antigénique entre paroi du streptocoque et certains tissus humains : R.A.A.- néphrite - chorée de Sydenham D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Angine érythémato-pultacée impétigo D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Morphologie: Cocci de taille et forme irrégulières groupés en chaînettes plus ou moins longues, immobiles, acapsulés et asporulés. D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Culture: germes exigeants, milieux au sang frais ou sérum bouillon: dépôt en mie de pain Solide: petite colonie grisâtre, translucide entourée d’un halo clair(ß-hémolyse) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Caractères biochimiques: métabolisme anaérobie aéro-tolérant, absence de catalase Structure antigènique: polyoside C (classification de Lancefield) Protéine M antigène de paroi de S.A(résistance à la phagocytose) Ac anti M = immunité durable Substances élaborées: Hémolysines O et S(streptolysines)Ac= ASLO dans les affections chroniques(RAA) >200 UI/ml Streptokinase=80U/ml- streptodornase Hyaluronidase(infections cutanées) Protéase(dégrade C5A) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Diagnostic bactériologique direct
Mise en évidence du germe à partir du prélèvement de gorge (flore oro-pharyngée) Examen microscopique: cocci Gram + en chaînettes Culture sur milieu au sang: ß- hémolyse Groupage Lancefield(A-B-C) Sensibilité aux antibiotiques( antibiogramme) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Diagnostic bactériologique indirect
Dosage dans le sérum des anticorps = sérodiagnostic Anti- streptolysine(ASLO) taux normal<ou=200UI/ml D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Sensibilité -Traitement
Sensibilité aux antibiotiques S.pyogenes ou S. A très sensible à la penicilline G (CMI<ou= 0.01mg/L Erythromycine (20% de résistance en France) Angine aigue de l’enfant(25-40%) Angine aigue de l’adulte(10-20%) Allergie aux pénicillines ou épidémie: vérifier la sensibilité aux antibiotiques Traitement Penicilline G ou V(10 jours) Aminopénicillines-céphalosporines(6 jours) Macrolides(souche sensible)allergie aux ß-lactamines (5 jours azithromycine) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Corynebacterium diphteriae
Agent responsable de la diphtérie État endémique dans de nombreux pays Cas importés en France Bacille Gram + en massue La diphthérie en 1997 (Source: OMS) ♦ Plus de 100 cas reportés ♦ 50 à 100 cas reportés ♦ 1 à 49 cas reportés ♦ Pas de cas reportés D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Habitat-Pouvoir pathogène 1
Connu depuis l’Antiquité Bretonneau 1825 caractérise la maladie Klebs 1883 bacille dans les fausses membranes de patient atteint de croup Nombreux décès durant la première moitié du XXième siècle jusqu’en 1955 Diminution due à la vaccination massive dans les pays de niveau socio-économique élevé D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Habitat-Pouvoir pathogène 2
Propre à l’espèce humaine Transmission d’homme à homme par la salive ou contact direct à partir d’un portage cutané Exceptionnellement dans l’environnement à partir d’ excrétions oro-pharyngées humaines D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

La maladie 1 Infection du tractus respiratoire supérieur Dysphagie modérée Angine avec amygdales rouges tuméfiées recouvertes d’un enduit blanchâtre( fausses membranes pouvant obstruer le naso-pharynx) Céphalées, malaises, fièvre modérée D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

La maladie 2 Effets systémiques causés par les souches hébergeant le phage ß porteur du gène tox codant une exotoxine Myocardite Atteinte neurologique(paralysie des nerfs crâniens et périphériques Syndrome hémorragique et insuffisance rénale=>tableau de toxémie diphtérique D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Autres formes Souches non toxinogènes Infection locale( cutanée, angine,ozéne) Infection profonde( sinusite) Infection systèmique(arthrite, endocardite, septicémie) Autres espèces: C.ulcerans, C.pseudotuberculosis rarement toxinogènes et responsables chez l’homme de syndrome diphtérique(contamination par produit laitier non pasteurisé) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Diagnostic bactériologique
Recherche dans un contexte de suspicion clinique ou de portage dans l’entourage Prélèvements: à l’écouvillon (zones inflammatoires du naso- pharynx,) multiplier les prélèvements Pour les portages asymptomatiques: voile du palais et et partie postérieure du cavum Transport immédiat au laboratoire ou milieu de transport à température ambiante ou 4°C D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Examen microscopique: Bacille Gram + en massue( non différencié d’autres corynébactéries) cf la clinique Isolement et culture: Peu exigeant cultive sur TS et MH +/- sang de mouton Milieu spécifique(cytéine-tellurite,milieu de Tinsdale) colonies noires entourées d’un halo noir Milieu de Loeffler: non sélectif -croissance rapide D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Coloration de Gram Coloration d’Albert D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Corpuscules métachromatiques D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Méthodes d’identification et diagnostic différentiel
Méthodes biochimiques: Activité enzymatique: uréase-gélatinase-nitrate réductase-hydrolyse de la gélatine… Lipophilie Pigmentation Chimiotaxonomie :étude des composants de la paroi(longueur des chaînes carbonées des acides mycoliques) Méthodes génomiques(PCR) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Caractères biochimiques
Fermentation des glucides: Glucose(+)- maltose (+) Activité enzymatique:α-glucosidase(+), pyrazinamidase(-), uréase(-) 4 biotypes: gravis nitrate réductase (+), glycogène(+) mitis glycogène(-) belfanti nitrate réductase (-), glycogène(-) Intermedius = gravis mais lipophile D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Galerie API Coryne D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Autres espèces C.pseudotuberculosis Uréase (+) Glycogène(-) C.ulcerans Glycogène(+) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Toxine diphtérique Recherche de la toxine In vivo effet pathogène chez le cobaye( 2 animaux injection en sous cutanée d’une suspension de la souche à tester) , l’un reçoit un sérum antidiphtérique en I.P. , mort en 2 3 jours du cobaye non immunisé Test d’immunoprécipitation ou test d’Elek Effet cytopathogène sur cellules vero Amplification génique( gène tox) à partir du prélèvement( en cours au CNR) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Test d’Elek D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Sensibilité aux antibiotiques
Valeurs seuils identiques à celles de streptocoque Méthode diffusion en gélose (M.H. au sang) Sensible aux ß-lactamines, glycopeptides. Variable pour macrolides, tétracyclines et rifampicine Resistance à la fosfomycine D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

EE D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Traitement Diphtérie(souche toxinogène) Sérum antidiphtérique administré selon procédure (BEH n°23/98) le plus précoce possible Antibiothérapie : penicilline G (vérifier la sensibilité) ou rifampicine Infections systèmiques( non toxinogène) Association d’antibiotiques (pénicilline et aminoside) risque de tolérance bactérienne D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Recommandations vaccinales et thérapeutiques 1
Vaccination: Enfants: obligatoire avant 18 mois (3 injections à 1 mois d’intervalle. Rappels recommandés 6-11 ans, 18 ans et tout adulte voyageant en zone endémique 1 injection si la dernière est entre >5 et <10 ans 2 injections si > 10 ans et < 20 ans Revaccination complète si >20ans Obligatoire pour les professionnels de santé D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Mesures à prendre en cas de diphtérie Isolement du patient si suspicion (attente de résultat) Cas confirmé: lever l’isolement après 2 prélèvements négatifs à 24 h d’intervalle Personnel soignant: vaccination en règle et mesure d’hygiène(gants-masque) Désinfections des objets en contact avec le patient Antibiothérapie et sérothérapie D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Peu immunisante vaccination en phase de convalescence Maladie à déclaration obligatoire(DASS) Mesures préventives pour les »contacts » 7 jours précédents le début des signes:surveillance clinique, écouvillonage nasal et pharyngé, antibioprophylaxie( dose unique peni G, amoxicilline-erythromycine orale 7 à 10 jours), vaccination (1 dose) si vaccination > 1 an D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Infections de l’appareil respiratoire
Infections communautaires D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Streptococcus pneumoniae
Diplocoque à Gram positif encapsulé appartenant au genre streptococcus D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Habitat Hôte normal(commensal) du rhino-pharynx de l’homme. plus fréquent chez le jeune(40% chez les enfants en crèche) Pouvoir pathogène naturel Baisse d’immunité générale ou locale: anomalie du tractus respiratoire, intoxication( alcool), troubles circulatoires, malnutrition, splénectomie… Affections loco-régionales:bronchite, trachéo-bronchite, D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Pouvoir pathogène Pouvoir pathogène naturel: Baisse d’immunité générale ou locale: anomalie du tractus respiratoire, intoxication( alcool), troubles circulatoires, malnutrition, splénectomie… Affections loco-régionales:bronchite, trachéo-bronchite,sinusites, otites, conjonctivites, pneumonies franches lobaires aigues( 15-25% bactériémies), pleurésies. 80% des pneumonies bactériennes Affections à distance: péricardites, méningites, péritonites, arthrites. Réactions fibrineuses fréquentes =>cloisenements (pleuraux-méningés) aggravent le pronostic. D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Examen microscopique Cocci Gram positif en flamme de bougie,encapsulés groupés par paire(diplocoque), courte chaînettes. D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Culture Germe exigent: gélose au sang en anaérobiose ou CO2 Colonies lisses transparentes en « goutte de rosée » entourées d’une zone d’hémolyse α Repiquages successifs=>colonies rugueuses (perte de capsule) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Caractères biochimiques
métabolisme anaérobie aéro-tolérant Absence de catalase Lyse de capsule par bile /sels biliaires (Neufeld) Sensibilité sel de cuivre (optochine) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Caractères antigèniques
Capsule de nature polysaccharidique(84 types immunologiques) Anticorps spécifique et polysaccharide=>complexe Ag/Ac =>à l’examen microscopique gonflement de la capsule(typage sérologique) Capsule=rôle pathogène(empêche la phagocytose) Ac anticapsule=>guérison Pneumocoque non capsulé ne se différencie pas des streptocoques non groupables D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Phénomène de Griffith D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Pouvoir pathogène expérimental
Pathogène pour la souris (injection IP)=>septicémie en 24 à 48 heures Autrefois employé pour diagnostiquer Essais thérapeutiques anti-infectieux D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Mise en évidence dans les lésions: Ménigite(LCR) Pleurésie, pneumonie avec bactériémie(50%) Expectoration (contaminée par la flore oro-pharyngée), présence de pneumocoque(50%) chez de sujets sans pneumonie Qualité du prélèvement: avant traitement antibiotique, prélèvement respiratoire protégé D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Examen microscopique Diplocoques Gram positif encapsulés Culture sur gélose au sang Colonies en goutte de rosée, α hémolytique, sensible à l’optochine Identification lyse par bile et sels biliaires Aggutination de particules de latex sensibilisées(pneumotest) antigénes solubles (urine) Sérotypage D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Pneumocoque capsulé D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Sensibilité aux antibiotiques
Apparition de souches résistantes 46% R érythromycine 40% R cotimoxazole sensibilité à Pénicilline G 40% sensibilité diminuée ou résistante variable en fonction de l’âge du patient 60% R érythromycine jeune enfant 40% R érythromycine adulte Transmission croisée(crèche) consommation des antibiotiques Transfert de matériel génétique(streptocoques commensaux résistants aux antibiotiques et pneumocoque dans le rhino-pharynx D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

traitement Antibiotique de choix penicilline A (amoxicilline) vérifier la sensibilité Vaccin (23 types polysaccharidiques les plus fréquents) efficacité incomplète, Indication: sujets splénectomisés et âgés Vaccin heptavalent chez le jeune enfant administré avant 1 an , 3 injections( protection 93% ) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Haemophilus Petits bacilles polymorphes Gram négatif(coccobacille) aéroanaérobies facultatifs, immobiles, parasites obligatoires, exigeants(NAD=V et hémine=X ) Commensales des muqueuses de l’homme et animaux Température optimale de croissance 35-37°C D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Coloration de Gram Culture sur gélose chocolat D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Facteurs de croissance
Facteur V Thermolabile: NAD (nicotinamide adénine dinucléotide )ou coenzyme I ou NADP(NAD phosphate) ou coenzyme II.Coenzymesde déshydrogénase présents dans les globules rouges, tissus animaux et végétaux et la plupart des bactéries Facteur X Thermostable=hémine ou hématine (composé contenant du fer dérivé de l’hémoglobine et des enzymes de la chaîne respiratoire(cytochrome, catalase, oxydase) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Milieux de culture Necessite les facteurs de croissance selon les espéces soit X,V ou les 2 Sang frais (V intraglobulaire et NADase) ne convient pas « Sang cuit » gélose chocolat chauffé à 75°C: X et V partiellement détruit par chauffage adjonction d’ extrait de levure apporte NAD) Staphylococcus aureus produit une grande quantité de NAD(gélose au sang frais + strie de S.aureus) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

classification + (+) v - V (-) Facteur X Facteur V oxydase catalase
urèase indole H. influenzae + (+) haemolyticus v H.parainfluenzae - V (-) H.paraphrophilus H.segnis H.aphrophilus H.haemoglobinophilus H.ducreyi

Habitat- pouvoir pathogène
Muqueuses de animaux à sang chaud (mammifères ,oiseaux) avec spécificité d’hôtes Homme 4 écosystèmes: pharynx,bouche,plaque dentaire, appareil urogénital et l’intestin H.influenzae espèce la + impliquée parainfluenzae, haemolyticus, paraphrophilus,aphrophilus,haemoglobinophilus,segnis commensaux opportunistes infections ORLet chez l’immunodéprimé septicémie et endocardite H.ducreyi agent d’une affection vénérienne: le chancre mou D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Haemophilus influenzae
Commensale de l’oropharynx possède une capsule(6 types a-f) Souches capsulées de type b 95 % des pathologies invasives(enfant <5ans): méningites, septicémies, épiglottites, pneumonies, cellulites, arthrites septiques(biotypeI) Infections pulmonaires aigues de l’enfant dues à différents sérotypes( terrains fragilisés par infection virale, pollution, mauvaises conditions socio-économiques) Infections de l’adulte facteurs favorisants: traumatisme crânien, agammaglobulinémie, cancer, aloolisme,splénectomie,diabéte.souche pas toujours capsulée D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Haemophilus influenzae
Autres types capsulaires a c d e f plus rarement impliqués dans infections invasives Souches non capsulées biotype II ou III pathologies locales(sinusites-otites-poussées de bronchite chronique-surinfection de dilatation des bronches et mucoviscidose Infection virale ou tabagisme favorise colonisation=>infection D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Examen direct du produit pathologique: petit BGN Culture sur gélose chocolat + polyvitex avec bacitracine colonies blanc gris en 24 heurs Identification: uréase,ODC,indole Sérotype si capsule D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Antibiotiques-prophylaxie
Bêta-lactamines: Penicilline G: Resistance naturelle Penicilline A sensible (R acquise par ß lactamase C2G et C3G sensible Autres Fluoroquinolones-gentamycine- Erythromycine irregulier Bactrim irrégulier Vaccin Nourrisson entre 3 à12 mois (3 injection,rappel 1 an) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Bordetella Genre Bordetella => plusieurs espèces: Bordetella pertussis bacille de Bordet- Gengou agent de la coqueluche Bordetella parapertussis => coqueluche atténuée Bordetella bronchiseptica pathogéne pour le porc et chien mais aussi chez l’homme Bordetella avium coryza du dindon opportuniste chez l’homme D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Bordetella pertussis Bactériologie Morphologie: petit coccobacille Gram négatif à coloration bipolaire, forme longue filamenteuse après repiquage Immobile(sauf avium et bronchiseptica) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Cultures Aérobie stricte Température optimale35-37°C Exigence en nicotinamide, azote et soufre(BGS) Culture lente et délicate en 3-7 jours(goutelette de mercure) Hémolyse: 4 jours(phase I) 4 morphologies (phase I II III IV) Viabilité faible en dehors de l’hôte( sauf bronchiseptica) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Caractères biochimiques Non glucidolytique Utilisation d’acides aminés comme source de carbone Catalase positive Caractéres différentiels: Oxydase-nitrate réductase-uréase B.pertussis et parapertussis IF avec des anticorps marqués D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Facteurs de virulence Adhésines FHA Hémagglutinine filamenteuse PT toxine de pertussis PNR pertactine FIM Fimbriae TCF facteur de colonisation de la trachée BRK facteur de résistance au sérum Toxines TCT Toxine cytotrachéale PT AC-Hly adényl cyclase hémolysine TDN toxine dermonécrotique(mort cellulaire) D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Pouvoir pathogène:modèle animal
Strictement humaine Modèle murin pour standardiser la production de vaccin Infecté par voie IP, IC(cérébrale), IN (nasale) ,AE(aérosol) Voie IN et AE reproduisent la maladie humaine D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

La maladie Tussis quintana 1578 Coqueluche en France »chant du coq », « toux convulsivante » en Espagne, « toux des cents jours » en Chine 4 phases: Incubation silencieuse 2-3 semaines Phase catarrhale toux sèche qq jours Phase d’état(toux paroxystique et hypersécétion de mucus), expectoration, vomissement hyperleucocytose avec hyperlymphocytose, hypoglycémie jours Phase de convalescence plusieurs mois. D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

Diagnostic biologique
Diagnostic direct: Culture de l’aspiration naso –pharyngée incubée pendant 7 jours sensibilité 50-60% IF rapide manque sensibilité et spécificité PCR(séquence ADN pertussis) Diagnostic indirect Sérologie( 2 sérums à 4 semaines d’intervalle) rétrospectif

Traitement-prévention
Hospitalisation enfant<1 an(complication) Erythromycine réduit la sévérité si appliqué en début de maladie Isolement du patient (5-7jours) début du traitement Vadcins Germes entiers acellulaires D.CARLES- Bactériologie CHU - Nice

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