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Initiation à la Bibliothèque et à la recherche dans la base de données Medline/PubMed Sciences biomédicales Marie-Claude Laferrière Conseillère en documentation.

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1 Initiation à la Bibliothèque et à la recherche dans la base de données Medline/PubMed Sciences biomédicales Marie-Claude Laferrière Conseillère en documentation en sciences de la santé Janvier 2012

2 Conseillère en documentation Conseillère en sciences biomédicales Vous trouverez mes coordonnées sur le portail thématique en médecine dentaire Marie-Claude Laferrière Bibliothèque scientifique Pavillon Alexandre-Vachon Bureau 1018-C (au 1er étage, au fond du petit corridor) Téléphone: poste 7948 Courriel: Voici mes principales activités Formations individuelles et de groupe (étudiants et professeurs); mise au point de guides de recherche; création et mise à jour de pages web disciplinaires; achat et traitement des ressources liées à mes disciplines. Pour chaque discipline, la Bibliothèque désigne un conseiller ou une conseillère à la documentation (bibliothécaire). Bibliothèque de l'Université Laval2

3 3 Objectifs dapprentissage de la formation Objectif de la formation Connaitre les services offerts à la Bibliothèque et savoir chercher et repérer de la documentation scientifique de façon autonome. Au terme de la formation, vous serez en mesure de : Utiliser le catalogue Ariane 2,0 et Ariane 2,0 – Recherche darticles Comprendre un moteur de recherche complet et complexe (Medline/PubMed) Connaître les différentes fonctionnalités de PubMed, des modes dinterrogation jusquà lobtention du document Exploiter le vocabulaire contrôlé MeSH Bibliothèque de l'Université Laval

4 Plan de la présentation Visiter et connaître les services offerts à la Bibliothèque Utiliser Ariane 2,0 et Ariane 2,0 – Recherches darticles Connaître le site web de la Bibliothèque et le portail des sciences biomédicales Utiliser efficacement les opérateurs booléens Interroger une base de données - mots-clés - descripteurs Interroger Medline/Pubmed 4Bibliothèque de l'Université Laval

5 La Bibliothèque en quelques chiffres! Budget d'acquisition: plus de 11 millions de dollars et 50% de cette somme est consacrés aux ressources électroniques Plus de 5 millions de documents dans presque tous les domaines du savoir dont livres électroniques incluant les thèses et mémoires Abonnements à plus de journaux et revues, dont revues électroniques accessibles hors campus + de 1000 bases de données accessibles par le Web et un accès aux catalogues des bibliothèques universitaires du monde entier Plus de films, vidéos et DVD Bibliothèque de l'Université Laval5

6 Accès hors campus avec EZProxy Pour accéder aux ressources électroniques à partir de la maison : Il suffit de cliquer sur la ressource électronique désirée pendant la recherche documentaire. Une page dauthentification apparaîtra. Lusager devra fournir quune seule fois son identifiant de lUniversité Laval (IDUL) et son mot de passe (NIP) pour toute la durée de la session de recherche. Simple et rapide ! 6Bibliothèque de l'Université Laval

7 Site web de la Bibliothèque

8 ARIANE 2.0 8Bibliothèque de l'Université Laval

9 Ariane 2.0 cest quoi ? Ariane 2.0 contient la liste descriptive de tous les documents que la Bibliothèque possède. Un catalogue de bibliothèque permet de : vérifier la disponibilité des documents; repérer des documents par auteur, titre, sujet, etc.; indiquer leur statut et leur disponibilité. Source : commons/7/7e/Schlagwortkatalog.jpg Bibliothèque de l'Université Laval9

10 Contenu dAriane 2.0 Ce que lon trouve avec Ariane 2.0 Livres Titres de périodiques Publications gouvernementales Documents audiovisuels Mémoires et thèses Etc. Ce que lon NE trouve PAS avec Ariane 2.0 Articles de périodiques Articles de journaux Bibliothèque de l'Université Laval10

11 Caractéristiques dAriane 2.0 Quelques caractéristiques : interface développée par la Bibliothèque; interface de recherche à facettes qui permet de raffiner la recherche; suggestions automatiques dauteurs, de titres, de titres de périodiques et de sujets. Bibliothèque de l'Université Laval 11

12 Exercices: Ariane 2.0 Trouver un livre publié par lauteur « Charles Darwin » Trouver le journal « Science » Trouver un livre électronique sur la « microbiologie médicale» Trouver un livre sur les « diagnostics microbiologiques» Utilisez la facette: livres électroniques Cochez: Recherche exacte Zone auteur: Nom de famille en premier Utilisez: la suggestion ou longlet « Sujets » Bibliothèque de l'Université Laval12

13 ARIANE 2.0 – RECHERCHE DARTICLES 13Bibliothèque de l'Université Laval

14 Lautre Ariane 14Bibliothèque de l'Université Laval

15 Ariane Recherche darticles Nouvelle interface de recherche (version bêta) totalement indépendante dAriane 2.0 classique Ce que lon trouve avec Ariane – Recherche darticles: Des articles scientifiques de format électroniques uniquement. Ce que lon NE trouve PAS avec Ariane – Recherche darticles: Le contenu dAriane 2.0. Les articles de journaux (Soleil, Le Journal de Québec, La Presse, etc.) La totalité des articles que possède la bibliothèque. 15Bibliothèque de l'Université Laval

16 Ariane Recherche darticles Objectif: trouver rapidement quelques articles sur un sujet. Contrairement à, Ariane Recherche darticles garantie laccès au plein texte de votre article. Comme nous recherchons des articles; linterrogation se fait en anglais. Laccès se fait via : 16Bibliothèque de l'Université Laval

17 Ariane Recherche darticles Seule la recherche simple est disponible. Trois champs seulement sont disponibles pour la recherche: Titre, auteur: quand nous connaissons les auteurs ou le titre de larticle. Toutes les zones: recherche dans le plein texte de larticle. 17Bibliothèque de l'Université Laval

18 Exercices: Ariane 2.0 – Recherche darticles Question 1 Trouver cet article que votre professeur vous suggère de lire: Virgin, H. W., & Todd, J. A. (2011). Metagenomics and personalized medicine. Cell, 147(1), 44. Question 2 Votre professeur vous demande de trouver un article au sujet de la « métagénomique » qui a été publié dans la revue « Science ». 18Bibliothèque de l'Université Laval

19 PORTAIL THÉMATIQUE EN MÉDECINE 19Bibliothèque de l'Université Laval

20 Les portails thématiques en santé Il existe 6 portails thématiques en sciences de la santésciences de la santé Médecine Médecine dentaire Médecine sociale et préventive Réadaptation Sciences biomédicales Sciences infirmières Ce que contient chaque portail ? Une tonne de ressources propres à la discipline telle que les bases de données, périodiques électroniques, dictionnaires et encyclopédies, des associations et beaucoup plus ! 20 Bibliothèque de l'Université Laval

21 Pause-café De retour dans minutes 21Bibliothèque de l'Université Laval

22 OPÉRATEURS BOOLÉENS 22Bibliothèque de l'Université Laval ET OU SAUF

23 23 Opérateurs booléens Les opérateurs booléens définissent les relations entre des mots ou des groupes de mots. Lutilisation des opérateurs booléens en recherche documentaire est très utile afin de raffiner une requête. On peut ainsi inclure ou exclure des éléments précis de la recherche. Les opérateurs le plus couramment utilisés sont : ET (AND), OU (OR), SAUF (NOT). ET OU SAUF Bibliothèque de l'Université Laval

24 ET (AND) OU (OR) SAUF (NOT) AdulteCancer AIDS VIHSIDA Cancer Holistique Douleur Les opérateurs booléens Utilisé pour relier différents concepts entre eux. Diminue le nombre de références en précisant la recherche. Recherche les termes équivalents (synonymes) dun même concept. Utilisé pour élargir la recherche et augmenter le nombre de références. Utilisé pour exclure un ensemble de références qui « noient » la bonne information. Bibliothèque de l'Université Laval24

25 LA RECHERCHE MOTS CLÉS VS THÉSAURUS 25Bibliothèque de l'Université Laval

26 Interroger une base de données La recherche peut seffectuer de deux différentes façons: par mots-clés par descripteurs Bibliothèque de l'Université Laval26

27 Recherche… Par mots-clés : La recherche seffectue dans tous les mots ou expressions de la notice (titre, résumé, etc.) Bibliothèque de l'Université Laval27

28 Recherche … Par descripteurs : La recherche seffectue uniquement dans les mots ou les expressions inscrits dans le champ Sujet de la notice. Les mots ou les expressions inscrits dans le champ Sujet sont habituellement choisis dans une liste préétablie de termes. On parle alors de vocabulaire contrôlé. Bibliothèque de l'Université Laval28

29 Recherche par descripteurs Vocabulaire contrôlé Liste de mots appelés descripteurs, Subject Headings ou Thésaurus. Les descripteurs permettent lindexation des documents: À chaque référence sont assignés plusieurs descripteurs. Lindexation est uniforme, peu importe les mots de lauteur. Bibliothèque de l'Université Laval29

30 Différents thésaurus La plupart des bases de données publient un thésaurus. Celui-ci est souvent intégré au logiciel de la base. Exemples CINAHL = Descripteurs CINAHL Medline = MeSH (Medical Subject Headings) Embase = EMTREE Cochrane = MeSH (même que Medline) PsycINFO = Thésaurus (sous longlet « Term finder ») 30Bibliothèque de l'Université Laval

31 MEDLINE VIA PUBMED 31Bibliothèque de l'Université Laval

32 32 Présentation générale de Medline Descriptions: Medline est une base de données bibliographiques gratuite. Elle dépouille et indexe plus de revues biomédicales provenant denviron 70 pays revues biomédicales Période couverte : 1946 à aujourdhui Organisme responsable : Langues des documents: Principalement en anglais. Certains articles sont en français. Les titres, les résumés et les descripteurs sont toujours en anglais. Linterrogation doit se faire uniquement en ANGLAIS. Bibliothèque de l'Université Laval

33 33 Traduction des termes de recherche Medline ne traduit pas automatiquement les mots-clés. Les termes, ou de préférence les descripteurs du MeSH (Medical Subject Headings), doivent donc être écrits en anglais. Pour traduire un terme, il est possible dutiliser un des dictionnaires en ligne sous la rubrique « Les indispensables » du site de la Bibliothèque (ex.: Grand Dictionnaire terminologique)Les indispensables Les sites suivants sont aussi recommandés : Le Portail terminologique de Santé du répertoire CiSMeF (http://www.chu- rouen.fr/cismef/)http://www.chu- rouen.fr/cismef/ Le MeSH bilingue français-anglais de lInserm ( Bibliothèque de l'Université Laval

34 Domaines couverts Anatomie Biochimie Bio ingénierie Ergothérapie Génétique Gériatrie Immunologie Médecine clinique Médecine dentaire Médecine expérimentale Médecine fondamentale Médecine vétérinaire Microbiologie Nutrition Pharmacologie Physiologie Psychiatrie et psychologie Santé publique Soins infirmiers Système de santé Toxicologie 34Bibliothèque de l'Université Laval

35 35 Accès à la base de données Medline Medline est disponible sur plusieurs interfaces de recherche: PubMed (interface gratuite) EBSCO Host Web of Knowledge Embase Bibliothèque de l'Université Laval

36 Différence entre Medline et PubMed Medline Articles provenant de revues indexées sans toutefois couvrir un sujet en santé (ex. : astrophysique) Articles en prépublication qui ne sont pas encore indexés ou publiés (PubMed in-process) Articles datant davant lacceptation du périodique dans Medline (As supplied by publisher) Articles provenant de revues faisant partie de PubMedCentral, mais sans être inclus dans Medline Bibliothèque de l'Université Laval36

37 37 Modes dinterrogation de PubMed 1.Recherche simple « PubMed » Recherche par mots ou expressions dans toute la notice (ceci donne souvent beaucoup trop de résultats). 2.Recherche avancée « Advanced Seach » Recherche par auteur, journal, date de publication, etc. 3.Recherche avec le « MeSH Database » Recherche à partir des descripteurs du MeSH assignés à chaque article. Bibliothèque de l'Université Laval

38 38 Modes dinterrogation de PubMed 1.Recherche simple « PubMed » Recherche par mots ou expressions dans toute la notice (ceci donne souvent beaucoup trop de résultats). 2.Recherche avancée « Advanced Seach » Recherche par auteur, journal, date de publication, etc. 3.Recherche avec le « MeSH Database » Recherche à partir des descripteurs du MeSH assignés à chaque article. Bibliothèque de l'Université Laval

39 39 Recherche simple « PubMed » Règles décriture de PubMed ANDPar défaut, loutil de recherche retire les accentuations. Si vous utilisez plus dun mot, il utilise entre chacun de ceux-ci lopérateur « AND ». OR NOTVous pouvez aussi utiliser les opérateurs booléens « OR » pour rechercher des alternatives ou « NOT » pour exclure des termes (les inscrire en majuscules). On peut donc rechercher une expression en lencadrant de guillemets « ». Utilisez le symbole « * » pour tronquer les mots et ainsi repêcher lensemble des variantes dun mot. Exemple : arter* permettra de rechercher lensemble des mots ayant une racine commune : artery, arteries, arterial, arteritis, arteriole, etc. Bibliothèque de l'Université Laval

40 Raffiner votre recherche Vous pouvez utiliser « limits » pour raffiner les résultats de votre recherche. Date de publication Type darticles (Clinical Trial, Editiorial, Meta-Analysis, Practical Guidlines, Review, etc. ) Langage (French, English, Spanish, etc.) Subsets : Journal Group (Dental journals, Core clinical journals ou nursing journals) Groupes dâge (Child, Adolescent, Adult, Aged, etc. ) Etc. 40Bibliothèque de l'Université Laval

41 41 Exemple #1 Recherchons des articles sur leffet des changements climatiques sur les maladies infectieuses? Mode de recherche utilisé: Recherche simple (mot-clé) PubMed Bibliothèque de l'Université Laval Réponse: Dans la recherche simple, écrire climate change infectious diseases et cliquer sur la limite « French ». Attention ! Regardez en bas à droite la boîte « Search Details »

42 Exercices: recherche simple + limites Question A Combien trouvez-vous de revues de littérature (Review) sur Obésité morbide? 42Bibliothèque de l'Université Laval

43 43 Modes dinterrogation de PubMed 1.Recherche simple « PubMed » Recherche par mots ou expressions dans toute la notice (ceci donne souvent beaucoup trop de résultats). 2.Recherche avancée « Advanced Seach » Recherche par auteur, journal, date de publication, etc. 3.Recherche avec le « MeSH Database » Recherche à partir des descripteurs du MeSH assignés à chaque article. Bibliothèque de l'Université Laval

44 44 Exemple #2 Recherchons des articles écris par Y. Nomura publiés dans The Journal of biological chemistry. Mode de recherche utilisé: Search Builder dans Advanced Search Réponse: Dans la recherche avancée, sélectionnez le champ « Author » et écrivez « Nomura Y » puis sélectionnez le champ « Journal » et écrivez « Journal of biological chemistry ». Ensuite, cliquez sur « Search ». Bibliothèque de l'Université Laval

45 Exercices: Recherche avancée Question A Combien trouvez-vous darticles sur le Syndrome de Down dans la revue Jama? 45 Bibliothèque de l'Université Laval

46 46 Modes dinterrogation de PubMed 1.Recherche simple « PubMed » Recherche par mots ou expressions dans toute la notice (ceci donne souvent beaucoup trop de résultats). 2.Recherche avancée « Advanced Seach » Recherche par auteur, journal, date de publication, etc. 3.Recherche avec le « MeSH Database » Recherche à partir des descripteurs du MeSH assignés à chaque article. Bibliothèque de l'Université Laval

47 47 La recherche MeSH MeSH (Medical Subject Headings) est le vocabulaire contrôlé utilisé par la National Library of Medicine (NLM) pour indexer les articles dans Medline. La recherche MeSH est recommandée, car: elle utilise les termes acceptés par la base de données. elle offre des suggestions de termes, une brève description et une structure arborescente. elle permet dutiliser un ou plusieurs aspects particuliers ou qualificatifs (subheadings) pour préciser le terme choisi. elle permet de restreindre la recherche au sujet le plus important : Major Topic Headings (descripteurs avec un *). Bibliothèque de l'Université Laval

48 48 La recherche MeSH Descripteur recherchéDéfinition Permets de préciser la recherche en choisissant une ou plusieurs subdivisions du descripteur recherché. Recherche uniquement les références dont le descripteur est considéré comme sujet principal du document. Recherche uniquement le descripteur sélectionné, plutôt que tous les termes spécifiques qui apparaissent sous larborescence du descripteur recherché (mode de recherche par défaut). Bibliothèque de l'Université Laval

49 49 La recherche MeSH Termes équivalents recherchés (synonymes) Suggestions de termes à rechercher Termes + généraux Termes + spécifiques Bibliothèque de l'Université Laval

50 Exemple # 3 Recherche dun sujet Recherchons des articles en français sur le diagnostic du cancer du sein à ladolescence? Concepts: Cancer du sein Diagnostic Limites: Adolescence Article en français Mode de recherche utilisé: MeSH Database Réponse: "Breast Neoplasms/diagnosis"[Mesh] Limits: French, Adolescent: years 50Bibliothèque de l'Université Laval

51 Exemple # 4 Recherche dun sujet Recherchons des articles dont le sujet principal est lutilisation de lhormonothérapie lors de la ménopause précoce? Concepts: Hormonothérapie Ménopause précoce Mode de recherche utilisé: MeSH Database Restrict Search to Major Topic headings only. Réponse: "Menopause, Premature"[Majr] AND "Hormone Replacement Therapy"[Majr] 51Bibliothèque de l'Université Laval

52 Exercices: Recherche MeSH Questions C Combien trouvez-vous darticles en français sur le métabolisme du cancer du cerveau ? Questions D Combien trouvez-vous darticles dont le sujet majeur est les complications de lasthme chez les enfants préscolaires? Questions E Combien trouvez-vous darticles sur lutilisation dantipsychotiques pour les personnes âgées atteintes dAlzheimer? 52Bibliothèque de l'Université Laval

53 53 Obtenir le texte de larticle Le bouton permet de vérifier si un document est disponible à lUniversité Laval. Ce dernier est visible avec le « Display Settings: Abstract » ou si vous cliquez sur le titre de la notice. Si la Bibliothèque nest pas abonnée à la revue recherchée, on peut alors faire une recherche avec Google Scholar pour voir si larticle est disponible gratuitement sur le web.Google Scholar Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques (PEB) au coût de 5$.Prêt entre bibliothèques (PEB) Bibliothèque de l'Université Laval

54 54 Sauvegarde vos stratégies de recherche Avec Détails : possibilité denregistrer vos requêtes ou stratégies de recherche sous forme dURL (adresse internet) et les mettre en bookmark (signets) Avec My NCBI : service de veille de Pubmed Permets de sauvegarder nos stratégies de recherche Permets dobtenir des alertes par courriel Permets de les gérer (enlever, ajouter…) Service simple et gratuit, mais nécessité de sinscrire et de définir des codes daccès Bibliothèque de l'Université Laval

55 Pour plus dinformation! Guide développé par la Bibliothèque Capsule en format flash : Guide dutilisation - Medline rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline Guide dutilisation - Medline MeSH rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh Guide développé par PubMed Pubmed help – Guide exhaustif de la NLM Tutorial Pubmed - Excellent tutoriel de la NLM Anglais Français : The Basics of Medical Subject Headings (MeSH®) in MEDLINE®/PubMed® 55Bibliothèque de l'Université Laval

56 Nous sommes là pour vous aider ! Aide à la recherche Bibliothèque scientifique, Pavillon Alexandre-Vachon Tél.: Lundi au vendredi : 8h30 à 18h30 / Samedi: 10h00 à 17h00 Conseillère à la documentation Marie-Claude Laferrière Tél. : #7948 Courriel : Lundi au vendredi : 8h30 à 16h30 Il est préférable de prendre un rendez-vous pour vérifier ma disponibilité. Bibliothèque de l'Université Laval56

57 2 e formation Formation au logiciel de gestion de références EndNote Web Date : Demain le 10 janvier à 13h30 Où : ici au local 0022 de la Bibliothèque scientifique 57Bibliothèque de l'Université Laval


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