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Apports des SIG à lépidémiologie et à la santé publique : un survol Alain-jacques Valleron UPMC & Inserm.

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1 Apports des SIG à lépidémiologie et à la santé publique : un survol Alain-jacques Valleron UPMC & Inserm

2 Apports des SIG à lépidémiologie et à la santé publique : un survol Alain-jacques Valleron UPMC & Inserm

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4 Définition dun SIG ? In : Le serveur éducatif de l'IGN et de l'Education Nationale sur l'information géographique

5 Person, place, time Le fondement de lépidemiologie SIG pour aider à – Décrire – Expliquer – agir

6 Décrire Kriging : Carrat et col., Am J of Epidemiology, 1992

7 Am J of Epid, 1992

8 Décrire de plus en plus doutils interactifs et de bases de données disponibles

9

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11 Historique

12 Snow, Cholera,

13 Districts with water supplied by Population Deaths from Cholera Cholera death rate per 1000 population Southwark and Vauxhall Company Only 167, Lambeth Company Only 19, Both Companies 300,

14 14 Number of Fatal attacks by date of onset: Broad Street outbreak, London, 1854.

15 Snow - Farr Voir Eyler : Soz.- Präventivmed. 46 (2001) 225–232 Farr : C = C (e + a)/(e + a) – C et C sont les taux de mortalité dans deux districts daltitude e et e Valeurs observées: 177, 102,65, 34, 27, 22, 17, 7 Valeurs théoriques: 174, 99, 53, 34, 27, 22, 20, 6

16 Villermé Julia, C. and A.J. Valleron, Louis-Rene Villerme ( ), a pioneer in social epidemiology: re-analysis of his data on comparative mortality in Paris in the early 19th century. J Epidemiol Community Health, Corrélation écologique Causalité?

17 Nygard, K., et al., Association between environmental risk factors and campylobacter infections in Sweden Epidemiol Infect, (2): p

18 Krieger, N., et al. Geocoding and monitoring of US socioeconomic inequalities in mortality and cancer incidence: does the choice of area-based measure and geographic level matter?: the Public Health Disparities Geocoding Project. Am J Epidemiol, (5): p

19

20 Pour (beaucoup) plus: Greenland, S. and H. Morgenstern, Ecological bias, confounding, and effect modification. Int J Epidemiol, (1): p

21 Les sources de données modernes Innombrables bases de données environnementales informatisées (Sophie Valtat) Nouveaux outils Nouvelles méthodes

22 Sources de données satellitaires Résolution spatiale – Haute : 0.5 – 1.8 m. – Moyenne: 2 à 36 m. – Basse : >36m. Résolution temporelle Résolution spectrale Voir NNotamment:http://www.asprs.org/a/news/satellites/Satellite_Archive s_v3.pdfhttp://www.asprs.org/a/news/satellites/Satellite_Archive s_v3.pdf

23 EXEMPLE : SPOT6

24 Image product resolution: – Panchromatic: 1.5 m – Colour merge: 1.5 m – Multispectral: 8 m Spectral bands, with simultaneous panchromatic and multispectral acquisitions: – Panchromatic (450 – 745 nm) – Blue (450 – 525 nm) – Green (530 – 590 nm) – Red (625 – 695 nm) – Near-infrared (760 – 890 nm) Footprint: 60 km x 60 km – Responsive satellite tasking, with 6 tasking plans per day, per satellite – Capacity to acquire up to 3 million km 2. daily

25 CORINE LAND COVER (crédit SoES)

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27 Pesticides -> santé? – Couvert santé – couvert -> pesticides Image satellitaire Inférence sur la nature du couvert Inférence sur les produits (pesticides) utilisés

28 In Ward, Env. Health Perspectives 2000

29 Brody, J.G., et al., Using GIS and historical records to reconstruct residential exposure to large- scale pesticide application. J Expo Anal Environ Epidemiol, (1): p

30 Ward, M.H., et al., Identifying populations potentially exposed to agricultural pesticides using remote sensing and a Geographic Information System. Environ Health Perspect, (1): p

31 In Ward, Env. Health Perspectives 2000

32 Modèles de diffusion

33 Brody, J.G., et al., Using GIS and historical records to reconstruct residential exposure to large-scale pesticide application. J Expo Anal Environ Epidemiol, (1): p

34 Pollution par automobiles

35 s English, P., et al., Examining associations between childhood asthma and traffic flow using a geographic information system. Environ Health Perspect, (9): p

36 In McKone Internal report LBNL, 2008

37 Ostfeld, R.S., G.E. Glass, and F. Keesing, Spatial epidemiology: an emerging (or re-emerging) discipline. Trends Ecol Evol, (6): p

38 Ostfeld, R.S., G.E. Glass, and F. Keesing, Spatial epidemiology: an emerging (or re-emerging) discipline. Trends Ecol Evol, (6): p

39

40 Lèpre en mélanésie In Jim, Pacific Health Dialog, 2010

41 In Xiang, Envir. Research, 2000

42 In Wei et col., Am. J. Trop. Med. Hyg., 84(3), 2011, pp. 497–503

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46 SIG et maladies chroniques

47 Étude SEARCH (507 DT1, 218 Témoins): Liese, A.D., et al., Neighborhood level risk factors for type 1 diabetes in youth: the SEARCH case-control study. Int J Health Geogr, : p. 1

48 Ihrig, M.M., et col, A hospital-based case-control study of stillbirths and environmental exposure to arsenic using an atmospheric dispersion model linked to a geographical information system. Epidemiology, (3): p

49 Plans danalyse de facteurs environnementaux Niveau écologique Niveau individuel – Les variables environnementales dépendent de lindividu (pollution estimé à un point) Multiniveaux – Des variables mesurées individuellement, soit environnementales, soit par questionnaire (tabac) – ET des variables communes à des groupes dindividu Schéma cas-contrôle : le plus général

50 Questions méthodologiques récurrentes Données : – Comment estimer la trajectoire de vie – Comment estimer les « vraies » expositions? – Qualité du géocodage? Distinguer les cas où pas de résultats (donc problème de puissance) de ceux où il y a des résultats (un biais peut il les expliquer?) Analyse : – Autocorrélation spatiale – Modèles multiniveaux

51 Autocorrélation spatiale ^ Moran, P. A. P. (1950). "Notes on Continuous Stochastic Phenomena". Biometrika 37 (1): 17– 23.Moran, P. A. P. (1950). "Notes on Continuous Stochastic Phenomena". Biometrika 37 (1): 17– 23.

52 Qualité du géocodage Peut être critique. `Nombreux travaux – Bonner, 2003 Comparaison GPS et géocodage (ArcView 3.2, DynaMap) 79% < 100m. 3% > 800m. Bonner, M.R., et al., Positional accuracy of geocoded addresses in epidemiologic research. Epidemiology, (4): p

53 Journaux spécialisés Health and Place IF=? Intl Journal of Health geographics IF=? Transactions in GISIF=? Environmental Health Pespectives IF=7


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