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Groupe « Résistance Pays du Sud » Réunion de lAC12-ANRS Paris, 29 Février 2008.

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1 Groupe « Résistance Pays du Sud » Réunion de lAC12-ANRS Paris, 29 Février 2008

2 Sénégal (C. Toure-Kane) Côte dIvoire (TA. Toni, D. Joulia) Cameroun (L. Vergne, A. Agokheng) Burkina Faso (F. Rouet) Thaïlande (N. Ngo) Vietnam (L. Xuan) Cambodge (E. Nerrienet) Necker (ML. Chaix) Montpellier (M. Peeters) Bichat (D. Descamps, F. Brun-Vezinet) Bordeaux (B. Masquelier, H. Fleury) Rouen (JC. Plantier) Coordination: ML.Chaix, M.Peeters MEB: A. Ayouba Création: Février 2005

3 4 projets avaient été définis 1. Contrôle de Qualité pour les laboratoires participants identiques à celui des labos nord (pré- requis pour les autres études) 2. Etudier les résistances du VIH-1 aux ARV chez les personnes naïves de traitement, en Afrique et en Asie (ANRS 12134) 3. Évaluer la faisabilité détude des résistances sur du matériel sanguin prélevé sur papier filtre (en cours) 4. Mettre en place les procédures pour létude des résistances chez les personnes traitées, dans un contexte daccès élargi aux ARV (dépôt projet CSS6)

4 Contrôle de qualité Envoi et réception en Décembre Janvier 2008 selon les sites Date de fin de réception des résultats (fin février) –Cambodge, Vietnam Analyse D. Costagliola (Mars) Conditionne la participation aux autres étdes du groupe

5 Projet ANRS Méthode générique développée par lOMS: HIVDR-TS ( surveillance de résistance par la méthode de seuil) –Femmes enceintes –Première grossesse –Âgées de de 15 à 24 ans –Naïves de traitement ARV –Récemment infectées –N=60 à inclure en moins de 6 mois Adaptation en fonction des pays Techniques biologiques –Plasma –RT PCR et séquençage –Analyses et interprétations selon: ANRS, Schaffer B list, Stanford et Rega –Saisie dans base de donnés Access®

6 Résultats 1. Population étudiée PAYSnFemmesHommes Cameroon (OMS)52 0 Burkina Faso (Kesho Bora, CD4 > 500 et/ou 15-4 ans) 51 0 Thailand (PHPT-4, CD4 > 500 et/ou 15-4 ans) 56 0 Cambodia (CD4 > 500 et/ou 15-4 ans) Vietnam (CD4 > 500 et/ou 15-4 ans) pays ont terminé létude: N=280

7 Résultats 2. caractéristiques de la population étudiée Age Nombre de Grossesses CD4 CV

8 Connaissance statut VIH CountrynMedian (months)IQR Burkina Faso Cambodia Cameroon52ND Thailand Vietnam

9 Cambodia (n=58) 95% 5% Thailand (n=56) 94% 4%2% Viet Nam (N=63) 100% CRF01 B AE/B Burkina Faso (n=51) Cameroon (n=52) 68% 10% 6% 4% 8% CRF02 CRF06 Other Subtypes A* D CRF11 G

10 Fréquence des mutations de résistance CountryNumber of Sequences (RT and PR) Number of samples with resistant viruses (%) 95% Confidence Interval Burkina Faso510 (0) Cambodia581 (1.7) Cameroon521(1.9) Thailand560 (0) Vietnam632 (3.2)

11 Caractéristiques des échantillons résistants Sample IDCountryGenderAgeCD4 cells/µL VL (Log cp/mL) HIV-1 subtype Scored mutations KC (RT) Cambodi a F AEK101KQ, K103N, M184V CYN0632 (RT) Camero on F20525NDCRF02K103N R26 (RT)VietnamF AEG190A R40 (PR)VietnamF AEM46I

12 Sénégal-Côte dIvoire PaysSénégalCôte dIvoire InclusionsN=48 F:44 N=47 F:47 Période dinclusion05/06/07-04/12/07 Amplification RT-Protéase 3627 Necker Age (n=35)30 (23-35) CD4 (n=36)641 ( ) VL (n=26)4.0 ( )

13 Conclusions Applicabilité de HIVDR-TS limitée car: Critères très stricts – pour lâge –Le nombre de grossesses –Le temps dinclusion Visites de 32 laboratoires (7 laboratoires accrédités) –4 spécialisés (Montpellier, Madrid, Ottawa et Utrecht) –2 régionaux (Fort de France et Burnett Institute, Sydney) –1 national (NARI, Pune, Inde) Fréquence de mutations de résistance inférieure à 5% pour les 5 pays ayant terminé le projet Cas particuliers Cameroun: seul pays à avoir réalisé le projet avec les critères HIVDR-TS Difficultés de recrutement (Côte dIvoire, Sénégal)

14 Projet Pilote Papier filtre Technique: JC Plantier amplification / sequencing Protease and RT separate Buffer viruses elution RNA extraction Qiagen spot 20 to 50 µl of plasma or serum S&S903 ou 3MM CHR®

15 Projet pilote papier buvard: où en est-on? PaysProjet faitDPSRésultats BurkinaNon (colis décongelé à larrivée) CambodgeOui (10) (10) > (5) 88% RT + 20% Prot + CamerounEn cours Côte dIvoireNon SénégalOui Protocole modifié ThaïlandeOui (5) (10) > (5) 1 Prot + 3 RT +, 4 Prot + 4 RT+ Prot + VietnamOui (5) (10) > (5) Pas damplif > RT + Prot -

16 Expériences papier filtre (Marjorie Monleau, Martine Peeters, IRD) extraction Qiagen : mauvais résultat extraction Biomérieux > Abbott pour quantification et amplification. Mais différences avec plasma < 1 log conservation à TA : OK jusquà 1 mois (sauf pour faible CV) conservation à 37°C : OK jusquà 2 semaines (sauf pour faible CV) Finir de tester (mesure CV et amplification PCR) la conservation des spots, sur papier 903, dans le temps selon les conditions : t°ambiante, sec et 37°C, humide Selon résultats, tester autres papiers : 3MM, FTA cards Essai DPS (DBS ?) avec plusieurs technologies pour la mesure de la CV

17 Projet: Patients traités Refus AO 15 sept 07 Dépôt AO 16 mars 08 (M Peeters, A Ayouba) Lobjectif primaire est: –Evaluation de léchec virologique et résistances aux ARVs chez les patients VIH+ pris en charge dans les programmes et structures nationaux au Burkina-Faso, Cameroun, Côte dIvoire, Sénégal, Thaïlande, Togo et Vietnam –Patients en échec de 1° ligne de traitement –Coupe transversale à M12 et à M24 –Nécessité de recruter 300 patients par site et par point (soit 600 patients traités)

18 Projets en cours et perspectives CQ distribué par le CNR (Bichat) automne 2008 Finalisation du protocole détude des résistances sur papier filtre (Rouen, Montpellier) et transfert sur sites Projet « Patients traités » –A soumettre à lAO du 15 mars Analyse du polymorphisme de lintégrase (Vietnam, Cambodge, Thaïlande, Burkina Faso, Cameroun) à la suite du projet en lien avec le groupe Nord Analyse du polymorphisme de lenveloppe (Vietnam, Cambodge, Thaïlande, Burkina Faso, Cameroun) à la suite du projet 12134


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