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Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle Mignon E., Moinet B., Moons V. 2eme doc en médecine VT Année.

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1 Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle Mignon E., Moinet B., Moons V. 2eme doc en médecine VT Année

2 Description Robe beige clair à noir. Tache blanche sur le ventre plus ou moins étendue. Poils courts. Train avant plus massif que l'arrière. Quatre pattes terminées par des sabots fendus en corne sombre. Bosse musculo adipeuse à l'avant du garrot. Tête fine à front large (chez les mâles) surmontée d'une paire de corne en forme de lyre ou de coupe à base massive, surplombant de petites oreilles à l'horizontale. Fanon et bosse plus développés chez le mâle que la femelle. Longue queue à toupet développé qui touche le sol. Description Robe beige clair à noir. Tache blanche sur le ventre plus ou moins étendue. Poils courts. Train avant plus massif que l'arrière. Quatre pattes terminées par des sabots fendus en corne sombre. Bosse musculo adipeuse à l'avant du garrot. Tête fine à front large (chez les mâles) surmontée d'une paire de corne en forme de lyre ou de coupe à base massive, surplombant de petites oreilles à l'horizontale. Fanon et bosse plus développés chez le mâle que la femelle. Longue queue à toupet développé qui touche le sol.

3 Race indigène dAmérique du Sud Race indigène dAmérique du Sud Taille:1.25m Taille:1.25m Population semi sauvage Population semi sauvage

4 Introduction Limportance de la diversité génétique: Limportance de la diversité génétique: Amélioration des races sélectionnées Amélioration des races sélectionnées Facilité d adaptation rapide aux changements Facilité d adaptation rapide aux changements

5 Mais…. La sélection artificielle:diminue la variation génétique: Mais…. La sélection artificielle:diminue la variation génétique: Sélection pour traits économiques (viande,lait) Sélection pour traits économiques (viande,lait) Conduit vers une population génétiquement uniforme par sélection dindividus reproducteurs (IA et transfert dembryon) Conduit vers une population génétiquement uniforme par sélection dindividus reproducteurs (IA et transfert dembryon)

6 Donc la sélection artificielle: Donc la sélection artificielle: Utilisation intensive danimaux délites Utilisation intensive danimaux délites Reproduction assistée Reproduction assistée Diminue la taille de la population effective des races domestiques commerciales Diminue la taille de la population effective des races domestiques commerciales

7 Ex:holstein: et pop effective=1000 malgré la pop Ex:holstein: et pop effective=1000 malgré la pop La diversité génétique du bétail est compromise à cause des stratégies de management (il y a diminution pop effective de la plupart des races domestiques) La diversité génétique du bétail est compromise à cause des stratégies de management (il y a diminution pop effective de la plupart des races domestiques)

8 Races indigènes(créole) Races indigènes(créole) Diminution de la sélection artificielle et donc, on a de la sélection naturelle: Diminution de la sélection artificielle et donc, on a de la sélection naturelle: Haute variabilité phénotypique Haute variabilité phénotypique Augmentation fitness sous condition naturelle Augmentation fitness sous condition naturelle

9 ACC (Argentinean Creole cattle) Où? Dans des lieux inadéquats pour les races commerciales Où? Dans des lieux inadéquats pour les races commerciales Comment? Distribuée en pop semi isolée avec un petit nombre dindividu par troupeau,isolation géographique,… Comment? Distribuée en pop semi isolée avec un petit nombre dindividu par troupeau,isolation géographique,…

10 Csq? Sélection naturelle Csq? Sélection naturelle Adaptation locale résultant du haut taux de diversité phénotypique: Adaptation locale résultant du haut taux de diversité phénotypique: Couleurs +++ Couleurs +++ Longévité Longévité Fertilité Fertilité Résistance à certaines maladies endémiques Résistance à certaines maladies endémiques Tique à bofilus microplus,vecteur commun de nombreux pathogènesTique à bofilus microplus,vecteur commun de nombreux pathogènes

11 Etude Évaluation de la structure pop génétique des ACC comparé avec les holsteins Évaluation de la structure pop génétique des ACC comparé avec les holsteins Utilisation de marqueurs génétiques: Utilisation de marqueurs génétiques: 3 gènes impliqués dans la production de lait (αs1-caséin, k-caséin, prolactine) 3 gènes impliqués dans la production de lait (αs1-caséin, k-caséin, prolactine) 1 gène impliqué dans la réponse immune de lorganisme contre les pathogènes (BOLA-DRB3) 1 gène impliqué dans la réponse immune de lorganisme contre les pathogènes (BOLA-DRB3)

12 Hypothèse? Est-ce que le taux de diversité génétique chez ACC est différent de celui existant dans la race Holstein? Quel motif de diversité génétique existe-t-il à lintérieur et entre les pop de ACC?

13 Méthodes et matériels Échantillons de sang chez 339 animaux provenant de 9 pop de ACC Échantillons de sang chez 339 animaux provenant de 9 pop de ACC Sélection dindividu ne partageant pas des ancêtres communs jusque 2 générations Sélection dindividu ne partageant pas des ancêtres communs jusque 2 générations Animaux venant dhabitats différents Animaux venant dhabitats différents Forêts subtropicales humides Forêts subtropicales humides Steppes Steppes Prairies Prairies Forêts tempérées Forêts tempérées Holsteins dArgentine: 3 populations Holsteins dArgentine: 3 populations

14 Extraction dADN Isolé des lymphocytes Isolé des lymphocytes Marqueurs génétiques utilisés: Marqueurs génétiques utilisés: αs1-caséin αs1-caséin K-caséin K-caséin Prolactine Prolactine BOLA-DRB3 BOLA-DRB3 => Amplifiés par électrophorèses sur gel de polyacrylamide et visualisé sous U.V.

15 Mesure de la variabilité génétique: Mesure de la variabilité génétique: GENEPOP GENEPOP ARLEQUIN ARLEQUIN Le taux de variabilité génétique estimé par Le taux de variabilité génétique estimé par A:diversité allèlique A:diversité allèlique He:hétérozigotes attendus He:hétérozigotes attendus Analyse statistique des résulats Analyse statistique des résulats

16 Résultats 91.9 à 94.7% de la variance totale observée est expliquée par des différences à lintérieur de la pop ACC 91.9 à 94.7% de la variance totale observée est expliquée par des différences à lintérieur de la pop ACC 5.3 à 8.1% sont le résultat de différences entre population ACC 5.3 à 8.1% sont le résultat de différences entre population ACC

17 Pour BOLA-DRB3 le nombre dallèle et la fréquence de distribution a lint pop ACC est différent de celui observé dans élevages domestiques Pour BOLA-DRB3 le nombre dallèle et la fréquence de distribution a lint pop ACC est différent de celui observé dans élevages domestiques Les différents troupeaux holstein présentent les mêmes allèles avec une fréquence similaire Les différents troupeaux holstein présentent les mêmes allèles avec une fréquence similaire Tandis que pop ACC présente 39 à 74% du nombre total dallèle caractéristique pour cette race (variation de la diversité allèlique) Tandis que pop ACC présente 39 à 74% du nombre total dallèle caractéristique pour cette race (variation de la diversité allèlique)

18 Le nombre moyen d alléle partagé entre pop ACC est significativement + petit que celui partagé dans la pop holstein Le nombre moyen d alléle partagé entre pop ACC est significativement + petit que celui partagé dans la pop holstein BOLA-DRB3 des ACC na jamais été détecté dans les races Européennes hautement sélectionnées( importé d Afrique) BOLA-DRB3 des ACC na jamais été détecté dans les races Européennes hautement sélectionnées( importé d Afrique)

19 Conclusion: ACC a une maintenance dun haut taux de diversité génétique et de structure de population ACC a une maintenance dun haut taux de diversité génétique et de structure de population ACC montrent un + haut taux de différenciation génétique que holstein ACC montrent un + haut taux de différenciation génétique que holstein

20 Discussion: ACC: haut taux de diversité génétique ACC: haut taux de diversité génétique Cette diversité génétique peut être expliquée par 2 processus: Cette diversité génétique peut être expliquée par 2 processus: La sélection naturelle a favorisé des allèles particulières ou des combinaisons allèliques particulières. De plus des environnements fort différents(forêt- plaine) ont facilité ce processus La sélection naturelle a favorisé des allèles particulières ou des combinaisons allèliques particulières. De plus des environnements fort différents(forêt- plaine) ont facilité ce processus

21 La structure de pop ACC et le peu de flux génétique (comparativement à la holstein) a prévenu lhomogéinisation génétique parmi la pop locale ACC La structure de pop ACC et le peu de flux génétique (comparativement à la holstein) a prévenu lhomogéinisation génétique parmi la pop locale ACC Chez holstein, cette homogéinisation est due IA, transfert dembryon, sélection danimaux délite, production massive,… Chez holstein, cette homogéinisation est due IA, transfert dembryon, sélection danimaux délite, production massive,…

22 Bibliographie: Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle; G. giovambattista,M.V. Ripoli, P. Peral-Garcia, J.L. Bouzat; 2001 International Society for Animal Genetics,Animals Genitics,32,p Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle; G. giovambattista,M.V. Ripoli, P. Peral-Garcia, J.L. Bouzat; 2001 International Society for Animal Genetics,Animals Genitics,32,p Amélioration génétique des productions animales,tome 1- 2,P. Leroy, J. Detilleux, F. Farnir Amélioration génétique des productions animales,tome 1- 2,P. Leroy, J. Detilleux, F. Farnir Documents internet (ruminants domestiques des caraibes, bos sp faune et flore des antilles, ressources génétique des animaux,… Documents internet (ruminants domestiques des caraibes, bos sp faune et flore des antilles, ressources génétique des animaux,… Les ruminants domestiques des caraibes: le point sur les ressources génétiques et leur exploitation, INRA prod animal 2001, Les ruminants domestiques des caraibes: le point sur les ressources génétiques et leur exploitation, INRA prod animal 2001,


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