Information scientifique BICH 4033 Séminaire avancé en biochimie 2009 1 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique.

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1 Information scientifique BICH 4033 Séminaire avancé en biochimie 2009 1 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique

2 Recherche bibliographique Trouver l'information permettant de comprendre et rédiger le travail 22009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique

3 STRATEGIE SUGGEREE Prendre connaissance du sujet o Manuel de cours o Article de vulgarisation (review) Scientific American, La Recherche, etc. o Sites web info de base pour comprendre le sujet figures (introduction séminaire ou travail écrit) mots clé (pour faire la recherche bibliographique) 32009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique

4 STRATEGIE SUGGEREE - suite Approfondir le sujet o Articles de synthèse Annual Rev. Biochem Trends Biochem Science info pour aller plus en profondeur comprendre articles originaux (primaires) mots clé 42009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique

5 STRATEGIE SUGGEREE - suite Repérer les références originales (primaires) o Notées lors des phases précédentes o Recherche dans les banques de données SciRUs, Pubmed info servant à rédiger le travail et présentation figures ( Googles - image) 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique5

6 Références originales (primaires) o définition Article de recherche ou une idée, une observation, un fait, etc. a été mentionné pour la première fois = référence originale o importance Permettre au lecteur de retracer et évaluer linfo et son origine Souligner la contribution du/des auteur/s 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique6

7 BANQUES DE DONNEES o Sources générales journaux spécifiques éditeurs de journaux spécifiques o Banques informatisées Documents physiques (écrit, CD, etc.) Web <= plus faciles à employer et à consulter 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique7

8 BANQUES DE DONNEES INFORMATISEES - suite o Recherche sujet (sans/avec combinaison) auteur institution journal restriction: années, langue 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique8

9 Banques plus employées: SCIRUS SCI R US o http://www.scirus.com/ http://www.scirus.com/ o combine 3 principaux: Pubmed + Science Direct (Elsevier) + o 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique9

10 SCIRUS: recherche simple o choix des sources (journaux scient vs web vs sites scient. spécialisés) o sujet, auteur, o expression (guillemets), AND, OR o triage par date ou pertinence o "refine o "save result" 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique10

11 SCIRUS: recherche avancée o sujet (sans/avec combinaison) o auteur o journal o années 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique11

12 SCIRUS: documents repérés o Article scientifique o Pubmed ou science direct o pdf o enregistrer image 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique12

13 Recherche darticles de synthèse o Sources Annual Review of… Trends in… Certains journaux primaires (JBC, Cell,….) o Repérage Site de la revue elle-même (Ann. Rev.) Science Direct (Trends in…, 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique13

14 Plagiat o Voir le réglement de lUniversité o copier-coller o Simple traduction intégrale 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique14

15 Citation o Nécessité de citation o Citation intégrale vs mention o Limites o concensus scientifique 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique15

16 Citation: aspect légal et moral droits d'auteur et copyright © (C) "fair use" universités et institutions de "haut savoir" => recherche et enseignement libertés non accessibles aux institutions commerciales ou privées (but lucratif ou non) pas de distribution à l'extérieur ou pour des fins commerciales 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique16

17 o Usage individuel non commercial académique o permissions 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique17

18 Emploi dune illustration tableau,image, photo d'un article scientifique "non commercial" (électronique ou papier) => mention tableau ou image d'une source sans copyright © => mention tableau ou image d'une source publique avec mention de © => mention tableau ou image d'une source privée avec © commercial => permission (avec/sans $$$) 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique18

19 Citations et références o les faits doivent être appuyés par la littérature: références primaires (publication dans des revues arbitrées) o au fur et à mesure o les citations doivent se rapporter à la section référence o pas de notes infrapaginales (footnotes) 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique19

20 Citations et références Types o Intégrale: le texte est cité tel quel Facile à identifier taille et styles des caractères, marges Peu employée en sciences fondamentales Vs o paraphrase 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique20

21 Citations et références Citation intégrale – exemple Daprès Scaggs et al The association of TPR with some RNAs is promoted by its interaction with the mRNA-binding protein Nab2P. Ce type de régulation sest cependant révélé restreint à certains types cellulaires transformés en culture. 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique21

22 Citation intégrale vs périphrase Autre exemple La principale objection de Garawick est qu " Il est difficile de distinguer le prépondérant du conditionel dans l'analyse cette forme hautement complexe du comporement socio-affectif » Garawick 2004 Ceci a toujours poussé les chercheurs vers un paradigme de type structural, d'autant plus... ========= Puisqu'il est difficile de distinguer le prépondérant du conditionnel (Garawick, 2004), les chercheurs ont surtout employé un paradigme de type structural dans l'analyse du comportement socio-affectif….. 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique22

23 Citation et références Liste des références o Liste de références non pas une bibliographie o références originales (primaires) o nom de la revue: employer les abréviations correctes o format consistant o faire les citations dans le texte 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique23

24 Format numérique o avantage: simple à faire, peu de place o inconvénient: il faut tout renuméroter si on veut rajouter une citation à la dernière minute o citation dams le texte 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique24

25 Format numérique - exemple Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (3) et possèdent deux sous-unités identiques (3,4). Référence dans la liste : 1) K. Zolber (1995)………. 2) U. Premolli, G. von Rastapovitch et T. Kwan (2004)… 3) P. Delbert et A. Schulz (2002)...... 4) A Schulz et A Capp (2007)… 5) Z. Alberts, P. Minard, Z. Palmer et K. Zolber (1999)… 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique25

26 Format alphabétique o avantage: pas besoin de tout renuméroter si on veut rajouter une citation à la dernière minute o inconvénient: un peu plus complexe à faire, plus de place 1 auteur: citer auteur + année 2 auteurs: cite les deux auteurs avec "... &... " (+ année) 3 et plus: cite premier auteur + " et al." 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique26

27 Format alphabétique - exemple Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (Delbert et Schulz (1992) et possèdent deux sous-unités identiques (Delbert et Schulz, 2002; Schulz et Capp, 2000) Liste de s références: Z. Alberts, P. Minard et K. Zolber (1999)…. B. Bernard, D. Delbert et E. Emilio (2003)… P. Delbert et A. Schulz (2002)...... A Schulz et A Capp (1990)… 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique27

28 Format alpha numérique o avantage: peu de place, renuméroter partiellement si on veut rajouter une citation à la dernière minute, o inconvénient: un peu plus complexe à faire, renuméroter partiellement si on veut rajouter une citation à la dernière minute 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique28

29 Format alpha-numérique (exemple) Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (5) et possèdent deux sous-unités identiques (5,23) Liste des références: 4)..... 5) P. Delbert et A. Schulz (1992)... 22)…….. 23) A Schulz et A Capp (1990)… 24)....... 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique29

30 Citation et références dans ce cours o T ous les auteurs, titre complet de l'article, pages inclusives o Dans le format suivant: JA Sumner, KPS Turner, J Walker (2005) Effect of trimethylammonium on puromycin-induced dissociation of rat brain ribosomes, J. Biochem. 78:7895-99. 2009Séminaire de biochimie - recherche bibliographique30