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Travail de 2ème doctorat Martins Rita Margueritte Aurélien Mahler Elodie.

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2 Travail de 2ème doctorat Martins Rita Margueritte Aurélien Mahler Elodie

3 Intérêts de lutilisation des indicateurs de santé pour la sélection génétique des saumons

4 Plan: 1.Introduction 2.Index de santé proposés: Evaluation par autopsie Evaluation par autopsie Activité du lysozyme plasmatique Activité du lysozyme plasmatique Fréquence de linfection par R.Salmoninarum Fréquence de linfection par R.Salmoninarum 3.Evaluation des index Tests de survie Tests de survie Taux de croissance et taille Taux de croissance et taille 4.Résultats 5.Discussion6.Conclusion

5 1. Introduction: Les 3 indicateurs de santé : Les 3 indicateurs de santé : Activité du lysozyme plasmatique (A.P.L.) Activité du lysozyme plasmatique (A.P.L.) Détection de Renibacterium salmoninarium engendrant la Bacterial Kidney Disease (BDK) Détection de Renibacterium salmoninarium engendrant la Bacterial Kidney Disease (BDK) Lévaluation de lindex de santé basée sur lautopsie (HAIA) Lévaluation de lindex de santé basée sur lautopsie (HAIA)

6 Croisements-test: Croisements-test: W: souche sauvage W: souche sauvage D: souche domestique (YIAL) D: souche domestique (YIAL) FemelleMâleWWWW DDWW WWDD DDDD

7 4 types de descendants: WW Homozygote sauvage WW Homozygote sauvage DD Homozygote domestique DD Homozygote domestique WD WD DW DW Hybrides

8 2 buts des croisements: Estimation de lhéritabilité des index de santé. Estimation de lhéritabilité des index de santé. Recherche de la corrélation entre les index de santé et les performances. Recherche de la corrélation entre les index de santé et les performances.

9 2. Index de santé proposés 2. Index de santé proposés 1) Evaluation à lautopsie 1) Evaluation à lautopsie Examens qualitatif de différents organes Examens qualitatif de différents organes Chaque organe est noté selon léchelle suivante: Chaque organe est noté selon léchelle suivante: - 0 : aucune anormalité - 0 : aucune anormalité - 30 : anormalités modérées - 30 : anormalités modérées - 60 : anormalités sévères - 60 : anormalités sévères Test de chi-carré pour évaluer les différences entre scores de santé selon les familles de poissons. Test de chi-carré pour évaluer les différences entre scores de santé selon les familles de poissons.

10 2) Activité du lysozyme plasmatique Utilisation de la technique sur « lysoplate » Utilisation de la technique sur « lysoplate » - Dépôt de 6 échantillons de plasma de poisson - Dépôt de 6 échantillons de plasma de poisson - Dépôt dun échantillon dune solution étalon contenant du lysozyme de blanc dœuf - Dépôt dun échantillon dune solution étalon contenant du lysozyme de blanc dœuf Diamètre de la zone de lyse autour de chaque échantillon. Diamètre de la zone de lyse autour de chaque échantillon. ANOVA 1 ANOVA 1 Estimation de lhéritabilité de lactivité lysozyme Estimation de lhéritabilité de lactivité lysozyme

11 3) Fréquence de linfection à R. salmoninarum Extraction de lADN de lhomogénat des reins Extraction de lADN de lhomogénat des reins PCR dun fragment de 501 pb du gène p57 de R. salmoninarum PCR dun fragment de 501 pb du gène p57 de R. salmoninarum Visualisation de lADN amplifié sur gel dagarose Visualisation de lADN amplifié sur gel dagarose Comparaison à des témoins infectés et sains Comparaison à des témoins infectés et sains ANOVA 1 ANOVA 1 Estimation de lhéritabilité de la fréquence dinfection Estimation de lhéritabilité de la fréquence dinfection

12 3. Evaluation des index Survie des différents croisements : à une vibriose « naturelle » à une vibriose « naturelle » à un pathogène inoculé ( V. anguillarum) à un pathogène inoculé ( V. anguillarum) Injection intrapéritonéale de 0.1 ml dune solution contenant V. anguillarum comparée à celle dun placébo Injection intrapéritonéale de 0.1 ml dune solution contenant V. anguillarum comparée à celle dun placébo Evaluation de la résistance à la maladie. Evaluation de la résistance à la maladie. Anova Anova

13 Performances des poissons Taux de croissance : évaluation du poids à 8 mois dintervalle Taux de croissance : évaluation du poids à 8 mois dintervalle Taille en fonction de lâge : Taille en fonction de lâge : - taille à 420 jours post-fertilisation - taille à 420 jours post-fertilisation - taille à 615 jours post-fertilisation - taille à 615 jours post-fertilisation Anova Anova

14 Analyse par régression linéaire But = voir lutilité des indicateurs de santé pour prédire les performances familiales But = voir lutilité des indicateurs de santé pour prédire les performances familiales Régression pour chaque indicateur de santé potentiel par rapport au : Régression pour chaque indicateur de santé potentiel par rapport au : - taux de survie - taux de survie après linfection naturelle à Vibrio après linfection naturelle à Vibrio après inoculation de V.anguillarum après inoculation de V.anguillarum - taux de croissance et à la taille des poissons - taux de croissance et à la taille des poissons

15 4.Résultats A.L.P (activité du lysozyme plasmatique): est la plus élevée chez les WW A.L.P (activité du lysozyme plasmatique): est la plus élevée chez les WW

16 H.A.I.(évaluation de létat de santé): 91,2% des saumons ont un score de 0 Taux de survie: DD 92,4% ; DW et WD taux intermediaires par rapport aux lignés pures. Taux de croissance (taille-âge): á 420j _ WW» WD=DW» DD á 620j _ WW = WD » DW Composante héritable paternelle pour A.P.L. WW : h2= 0,17+/-0,04 DD : h2= -0,12+/-0,33

17 5.Discussion Santé du poisson Santé du poisson Index de santé Index de santé Composante paternelle héritable de lA.P.L. Composante paternelle héritable de lA.P.L. Lusage de la technique PCR pour détecter Renibacterium salmoninarum Lusage de la technique PCR pour détecter Renibacterium salmoninarum

18 6.Conclusion Association : A.P.L. élevée avec BKD + Sont des bons indicateurs de la santé chez le poisson Association : A.P.L. élevée avec BKD + Sont des bons indicateurs de la santé chez le poisson Augmentation du nombre des IS ont amélioré la resolution de cet étude... Augmentation du nombre des IS ont amélioré la resolution de cet étude... Pour trouver des correlations genétiques entre IS et traits performants on conseille de tenir compte des traits generalisés: croissance et survie. Pour trouver des correlations genétiques entre IS et traits performants on conseille de tenir compte des traits generalisés: croissance et survie.

19 Bibliographie « Utility of genetically based healt indicators for selection purposes in captive-reared chinook salmon, Oncorhynchus tschawytscha, Walbaum », Rachel M. Johnson et al.Aquaculture Research, 2003, 34, « Utility of genetically based healt indicators for selection purposes in captive-reared chinook salmon, Oncorhynchus tschawytscha, Walbaum », Rachel M. Johnson et al.Aquaculture Research, 2003, 34,


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