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Structure et Fonction des Protéines 2 3 crédits 24 heures de cours – Amphi 2 – 12 janvier-> 4 mars 8 heures de TP – Bio Cell : 8 / 26 mars – Bioch : 29.

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1 Structure et Fonction des Protéines 2 3 crédits 24 heures de cours – Amphi 2 – 12 janvier-> 4 mars 8 heures de TP – Bio Cell : 8 / 26 mars – Bioch : 29 mars 23 avril Responsable – Jean-Pierre Duneau –

2 Structure et Fonction des Protéines 2 3 crédits 24 heures de cours (12 jan-> 4 mars) – I Modifications post-traductionnelles des protéines Pr. Assou El-Battari 14 heures Les Mardi à 14h00 + jeudi 4/03 à 8h00 – II Relation Structure-Dynamique-fonction Jean-Pierre Duneau 10 heures Les Jeudi à 8h sauf le 28/01 -> Mercredi 27/01

3 Maturation structurale et fonctionnelle des protéines 1- Régulation de la traduction des protéines. Rappels 2- Modifications co- et post-traductionnelles La glycosylation 2.1: Les glucides (Rappel) 2.2: La N-glycosylation (modification co-traductionnelle) 2.3: La O-glycosylation (modification post-traductionnelle) 3- Formation des protéoglycanes et glycosaminoglycanes Synthèse de l'héparine et de l'acide hyaluronique 4- Anchrage GPI des protéines membranaires (Glypiation) 5- Autres modifications co- et post-traductionnelles 5.1: Formation des ponts disulfures 5.2: Clivage protéolytique. Exemple des facteurs de coagulation 5.3: Amidation, acylation, sulfatation, phosphorylation

4 1- Régulation de la traduction des protéines. Rappels

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26 GlcNAc -PP-Dol GlcNAc 1- 4GlcNAc -PP-Dol Man 1 - 4GlcNAc 1- 4GlcNAc -PP-Dol UDP-GlcNAc UMP Dolicholphosphate N-acétylglucosamine phosphotransférase UDP-GlcNAc UDP N-acétylglucosaminyl diphosphodolichol N-acétylglucosaminyltransférase GDP Dolichol diphosphochitobiose mannosyltransférase GDP-Man 4GDP Glycolipide -mannosyltransférases 4(GDP-Man) CYTOPLASME PP-Dol 6 Man 1 - 4GlcNAc 1 - 4GlcNAc -PP-Dol 3 Man 1 Man 1 - 2Man 1 Man 1 – 2Man 1 Dol-P-Man glycolipide -mannosyltransférase 6 Man 1 - 4GlcNAc 1 - 4GlcNAc -PP-Dol 3 6 Man 1 3 Glc 1 - 2Glc 1 - 3Glc 1 - 3Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 Man 1 - 2Man 1 Glycolipide -glucosyltransférase RETICULUM Flippase

27 P-Dol GlcNAc -PP-Dol GlcNAc 1- 4GlcNAc -PP-Dol Man 1 - 4GlcNAc 1- 4GlcNAc -PP-Dol 6 Man 1 - 4GlcNAc 1 - 4GlcNAc -PP-Dol 3 Man 1 Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 6 Man 1 - 4GlcNAc 1 - 4GlcNAc -PP-Dol 3 6 Man 1 3 Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 Man 1 – 2Man 1 Man 1 - 2Man 1 6 Man 1 - 4GlcNAc 1 - 4GlcNAc -PP-Dol 3 6 Man 1 3 Glc 1 - 2Glc 1 - 3Glc 1 - 3Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 Man 1 - 2Man 1 6 Man 1 - 4GlcNAc 1 - 4GlcNAc -Asn.peptide 3 6 Man 1 3 Glc 1 - 2Glc 1 - 3Glc 1 - 3Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 Man 1 - 2Man 1 6 Man 1 - R 3 6 Man 1 3 Glc 1 - 3Man 1 - 2Man 1 -2Man 1 Man 1 - 2Man 1 6 Man 1 - R 3 6 Man 1 3 Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 Man 1 - 2Man 1 6 Man 1 - R 3 6 Man 1 3 Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 Man 1 - 2Man 1 Man 1 UDP-GlcNAc UMP Dolicholphosphate N-acétylglucosamine phosphotransférase UDP-GlcNAc UDP N-acétylglucosaminyl diphosphodolichol N-acétylglucosaminyltransférase GDP Dolichol diphosphochitobiose mannosyltransférase GDP-Man 4GDP Glycolipide -mannosyltransférases 4(GDP-Man) 4Dol-P Dol-P-Man glycolipide -mannosyltransférase 4(Man -P-Dol) 3Dol-P Glycolipide -glucosyltransférase 3(Glc -P-Dol) PP-Dol oligosaccharidyltransférase Peptide-(Asn-X-Ser/Thr) 1 Glc Mannosyl-oligosaccharide -glucosidase I -glucosidase II UDP-GlcUDP Glc UDP-Glc: 1,3glucosyltransférase -glucosidase II 1 Man Mannosyl-oligosaccharide 1,2- -mannosidase IA cytoplasme lumière Figure 1 : Biosynthèse des N-glycannes dans le RE R RE

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33 P ERp57 (disulphide isomerase) protein folding on/off calnexin glucosyl- transferase -glucosidase II -glucosidase I & II P Glc Man Glc other chaperones P G II P cx ER Golgi P EDEM proteasome Sec61 mannosidase ERGIC-53

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39 6 4Man 1 - 4GlcNAc 1 - 4GlcNAc 1 - Asn Man 1 3 GlcNAc Man 1 3 GlcNAc 1 GnT V GnT VI GnT II GnT III GnT IV GnT I

40 6 Man 1 - R 3 6 Man 1 3 Man 1 6 Man 1 R 3 Man 1 6 Man 1 - R 3 6 Man 1 3 GlcNAc 1-2Man 1 Man 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 - R,R 3 6 Man 1 3 GlcNAc 1-2Man 1 Man 1 6 4GlcNAc 1- 4GlcNAc -Asn-peptide Fuc 1 6 Man 1 - R,R 3 Man 1 GlcNAc 1-2Man 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 - R,R 3 Man 1 GlcNAc 1-2Man 1 6 Man 1 - R, R 3 GlcNAc 1-2Man 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 - R,R 3 GlcNAc 1-2Man 1 6 Man 1 R,R 3 6 Man 1 2 GlcNAc 1-2Man 1 GlcNAc 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 - R,R 3 6 Man 1 2 GlcNAc 1-2Man 1 GlcNAc 1 6 Man 1 - R,R 3 4 Man 1 2 GlcNAc 1- 2Man 1 GlcNAc 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 - R,R 3 4 Man 1 2 GlcNAc 1-2Man 1 GlcNAc 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 - R,R 3 4 Man 1 2 GlcNAc 1 6 Man 1 2 GlcNAc 1 6 Man 1 - R,R 3 4 Man 1 2 GlcNAc 1 6 Man 1 2 GlcNAc 1 6 Man 1 - R,R 3 4 Man 1 2 GlcNAc 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 2 GlcNAc 1 6 GlcNAc 1 - 4Man 1 - R,R 3 4 Man 1 2 GlcNAc 1 6 GlcNAcb1 - 4Man 1 2 GlcNAc 1 R GnT III GnT V GnT IV GnT VI GnT IV GnT V Mannosyl-oligosaccharide1,3-1,6- -mannosidase II GnT II GnT I Glycoprotéine-6- -L-fucosyltransférase Mannosyl-oligosaccharide1,3-1,6- -mannosidase III GnT I Figure 4 : Action des GnTs dans la biosynthèse des N-glycannes. R= 4GlcNAc 1 -4GlcNAc -Asn.peptide, R = 6 Man 1 - R 3 6 Man 1 3 Man 1 - 2Man 1 - 2Man 1 Man 1 - 2Man 1 Man 1 Mannosyl-oligosaccharide 1,2- -mannosidase IB GnT IV 6 Man 1 - R,R 3 4 Man 1 2 Man 1 GlcNAc 1 6 4GlcNAc 1- 4GlcNAc -Asn-peptide. Fuc 1

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