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Projet Génie Logiciel & UML, Bases de Données & Interfaces

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Présentation au sujet: "Projet Génie Logiciel & UML, Bases de Données & Interfaces"— Transcription de la présentation:

1 Projet Génie Logiciel & UML, Bases de Données & Interfaces
CAMPAN Amandine DUMOUSSEAU Marine PIHAN Emilie GB5 Option BIMB

2 Création du système d’information d’un laboratoire de biologie : sujet, contexte et limites

3 Objectifs Créer une base de données : stocker les expériences, gérer les accès aux résultats Créer une interface web : requêtes sur la base de données, affichage des résultats Créer 3 interfaces pour 3 types d’expériences : visualiser les résultats spécifiques

4 Contexte et limitations
Expérience : Expérimentateurs = auteurs - Pas toujours publiée - Un seul type de système - Un antécédent (unique) ou aucun Expérience E Expérience A Expérience B Expérience C Expérience D

5 Contexte et limitations
Accès aux expériences et aux résultats : Expériences dans la base de données terminées => toujours un résultat (celles en cours ne sont pas dans la base de données) Personnel du laboratoire : pas de limites d’accès si authentifié Public extérieur : accès limité aux expériences publiques

6 Contexte et limitations
Autres : Interface permettant d’ajouter une expérience à la base de données non prise en charge Bibliographie : lien vers l’article disponible en ligne Création et suppression d’un compte non gérées Membre du laboratoire : appartient à une seule équipe

7 Implémentation : base de données et interfaces

8 Schéma relationnel

9 Interfaces Mise en page : feuille CSS Programmation procédurale
Programmation orientée objet : Classe Resultat : récupère et affiche la partie commune des résultats

10 Démonstration

11 Plan Introduction au site : accueil, personnel, contact
Recherche rapide : ID = 3, utilisateur public Recherche rapide : ID = 2, utilisateur public et membre du laboratoire (connexion/déconnexion), liens Recherche avancée et consultation des résultats

12 Premier type de résultat : Spectrométrie de masse
Marine Dumousseau

13 Représentation du résultat
01/06/09 Représentation du résultat Différentes représentations : solution de l'image Spectre Graphique Tableaux 13

14 Limites Données complémentaires
01/06/09 Limites Données complémentaires Pouvoir combiner les données brutes avec des données extérieures (tableaux et graphiques) 14

15 01/06/09 Schéma de la base 1 1 1 n 15

16 Interfaces Programmation orientée objet :
01/06/09 Interfaces Programmation orientée objet : Classe Resultat_Marine : hérite de la classe Résultat. Récupère et affiche les résultats de type spectrométrie de masse Classe Technique_Marine : récupère et affiche les détails de la technique 16

17 01/06/09 Démonstration Cas de consultation des détails des résultats de spectrométrie de masse Cas de consultation des détails concernant le type de spectrométrie de masse utilisée 17

18 Second type de résultat : Figure
Emilie Pihan

19 BD 19

20 GL/UML Classe Resultat_Emilie: - héritage de la classe Resultat
- nouveaux attributs : --> intitulé --> figure --> légende 20

21 Troisième type de résultat : Histogramme
Amandine Campan

22 Choix Résultats quantitatifs : représentation en histogramme
exemples : tests de viabilité cellulaire, profils d’expression (sRNAs) par puces à ADN … Figure : Tests de viabilité cellulaire chez différentes souches de Staphylococcus aureus

23 Base de données Stockage des données quantitatives (pas de l’image) pour correspondre au mieux à la réalité Création d’une table : Histogramme (Id_Experience : int(11), Legende : varchar(20), Valeur : float)

24 Interface POO, héritage
Resultat Resume Interpretation Id_Experience Type ResultatGraphique Valeur Légende Id_Experience POO, héritage Requête SQL => listes des valeurs et des légendes Utilisation de la librairie graphique « Artichow » (http://www.artichow.org/) : classe BarPlot (histogrammes)

25 Interface Création de l’image du graphique par un fichier PHP « indépendant » (<img src='graphiqueAmandine.php' alt='Graphique'/>) Affichage de l’histogramme que si valeurs dans BD, sinon message d’erreur Mise en page : ajout de 2 divisions dans le fichier CSS (histogramme et légende)

26 Démonstration Résultats expérience 35 Résultats expérience 36

27 Merci de votre attention …


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