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2-D DIGE: Decyder v6.5 software analysis. Architecture de Decyder v6.5.

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1 2-D DIGE: Decyder v6.5 software analysis

2 Architecture de Decyder v6.5

3 Cy2 Cy3Cy5 Standard Extrait 2 Extrait 1 co-analyse des données issus des 3 images Transfert des découpes de spot sur les 3 images indépendantes Co-détection des spots Quantification précise: soustraction du bruit de fond et quantification des spots détection des spots sur limage fusion Un gel, 3 images

4 Standard interne et quantification des spots extrait 2 (Cy5) extrait 1 (Cy3) Gel 1 extrait 3 (Cy3) extrait 4 (Cy5) Gel 2 Standard (Cy2) sans standard interne: mesure de labondance dans chacune des images avec standard interne avec standard interne: mesure de labondance par paire de gel pour une même aire

5 Internal standard and 2 samples per gel Gel 1 Gel 2 Gel 3 Cy2Cy5 Standard Cy2 Standard Cy2 Cy3 extrait 1 extrait 3 extrait 5 Cy3 extrait 2 Cy5 extrait 4 Cy5 extrait 6 Co-détection Intra-gel + Quantification Intra-gel : Differential In-gel Analysis

6 Standard interne: matching inter-gel et normalisation de labondance des spots extrait 2 (Cy5) extrait 1 (Cy3) Gel 1 extrait 3 (Cy3) extrait 4 (Cy5) Gel 2 Standard (Cy2) sans standard interne avec standard interne - Matching des spots - Normalisation de labondance par rapport à chaque spot du standard Standard (Cy2)

7 Inter-gel matching Gel 1 Cy2Cy5 Standard Cy3 extrait 1extrait 2 Internal standard and 2 samples per gel Gel 2 Standard Cy2 extrait 3 Cy3Cy5 extrait 4 Cy2 Standard extrait 5 Cy3Cy5 extrait 6 : Biological Variation Analysis Master Gel 3 Protein difference ratios


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