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Distribution dans la colonne deau dun nouveau clade très diversifié de Diplonemides deaux profondes TARIN Charlotte RIBEREAU Charlène M1 BEM – centre docéanologie.

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1 Distribution dans la colonne deau dun nouveau clade très diversifié de Diplonemides deaux profondes TARIN Charlotte RIBEREAU Charlène M1 BEM – centre docéanologie de Marseille Rhynchopus amitus Won Je Lee

2 Pan-oceanic distribution of new highly diverse clades of deep-sea diplonemids E. Lara, D. Moreira, A. Vereschaka, P. López-Garcia Environmental Microbiology (2009) Hypothèses : En quoi lorigine géographique de ces organismes influence la distribution des phylotypes? Existe-t-il une stratification des différents phylotypes des diplonemides le long de la colonne deau? Introduction

3 Etude du taxon Diplonemea : -Clade dhétérotrophes undulipodiés -Règne des Discicristates Daprès des phylogénies moléculaires : 2 espèces connues : Diplonema et Rhynchopus : petit, libre, phagotrophe Classiquement trouvés : eau profonde Introduction Fig. 1 : Diplonema ambulator (Won-Je Lee) Fig. 2 : Rhynchopus amitus (Won-Je Lee) Fig. 3 : Arbre replaçant les Diplonemides au sein des Euglénobiontes

4 Echantillons eau de mer : Collecte dorganismes en Mer de Marmara par filtration Mesures de salinité, de température et de concentration en O2 Prélèvements à des profondeurs différentes de 15 à 1250 m Récupération de séquences ADN dans banques de données pour Océan Pacifique, Océan atlantique Echantillons eau douce (étang suboxique, tourbière) Banques de données Matériels et Méthodes Fig. 4 : Différents sites doù proviennent les échantillons deau de mer

5 Détermination d amorces taxon-spécifique aux Diplonemides Récupération de toutes séquences de Diplonemides disponibles sur GenBank Obtention damplicons par PCR Clonage des amplicons Comparaison des gènes ARNr 18S -1 ère analyse phylogénétique (ML) : Séquences de Diplonemides (nouvelles séquences + séquences bassin de Cariaco) + Euglénoïdes + Kinétoplastides Arbre raciné par les Euglénoïdes Matériels et Méthodes

6 -2 ème analyse phylogénétique (ML) : Diplonemides (collectés + toute les séquences présentes dans banque de données) Arbre raciné avec 5 séquences de Kinétoplastides -3 ème analyse : Stratification dans la colonne deau? Recherche de Diplonemides dans eau de surface (Marmara + Atlantique Sud) (NJ), et dans toute la colonne deau (Marmara) Corrélation facteurs physico-chimiques et fréquences des Diplonemides Matériels et Méthodes

7 I.Nouveaux clades de Diplonemides dans locéan mondial 1 ère analyse : les Diplonemides forment-ils un groupe monophylétique? Résultats et discussion : 1 ère analyse - Séquences deau douce non obtenues - Monophylétique - 2 nouveaux clades : DSPD I et II - DSPD II le plus basal - Groupe Cariaco mal soutenu : attraction des longues branches? Fig. 5 : Arbre phylogénétique de lARNr 18S retraçant la position des nouveaux clades de Diplonemides au sein des Euglénobiontes, en Maximum de vraisemblance. Valeurs de bootstrap aux nœuds.

8 2 ème analyse : Résoudre les phylogénies internes aux Diplonemides Résultats et discussion : 2 ème analyse - DSPD I et DSPD II ensembles - Diplonema Paraphylétique - Rhyncopus Monophylétique Fig. 6 : Arbre phylogénétique de lARNr 18S retraçant les relations entre les séquences au sein des Diplonemides, en Maximum de vraisemblance. Valeurs de bootstrap aux nœuds.

9 Répartition géographique Diplonema/Rhynchopus : benthique DSPD I et II : pélagique profond Large distribution géographique des Diplonemides Ex : Ma 115_D1_13 Discussion : 1 ère et 2 ème analyses Fig. 7 : Carte représentant la localisation de la Mer de Marmara

10 Peu de barrières géographiques, dispersion facilitée par circulation océanique Coexistence dune grande variété de phylotypes dans un même environnement 2 hypothèses : -Ressources différentes utilisées par Diplonemides pélagiques (spécialisation + pas de compétition) -Ressources surexploitées contrôle par paramètres physico-chimiques et biologiques (prédation, parasitisme) Hypothèses à confirmer car environnement milieu profond moins fluctuant que celui des eaux de surface Discussion : 1 ère et 2 ème analyses

11 II.Stratification des Diplonemides dans la colonne deau 3 ème analyse : Mer de Marmara uniquement Moins de diversité en surface quen profondeur Stratification due aux conditions physico-chimiques: Chemocline 25m Branche basale de Diplonemides de surface Résultats : 3 ème analyse Fig. 8 : Analyse basée sur la composition des phylotypes de diplonemides (valeurs de jackknife au nœuds) Fig. 9 : Proportions relatives des 3 phylotypes les plus communs dans la Mer de Marmara à 6 profondeurs différentes

12 Mêmes phylotypes trouvés en Mer Méditerranée + Marmara que dans lAtlantique (Nord et Sud) Effets modérés de la température et la salinité Lumière + pression ont plus dinfluence sur la stratification Organismes parasites ou broûteurs (non photosynthétiques) : Stratification influencée par les hôtes potentiels ou lalimentation Discussion : 3 ème analyse

13 Confirmation détudes précédentes : amorces taxon-spécifique révèle une grande diversité pour différents clades deucaryotes Découverte de 2 nouveaux clades deau profonde: DSPD I / DSPD II Stratification très marquée dans la colonne deau Coexistence spatiale de Diplonemides de phylotypes très proches Conclusion


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