13H H15 : SIG et STIC en Santé INSERM CNRS

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1 13H30 - 14H15 : SIG et STIC en Santé INSERM CNRS
Laurent Toubiana INSERM U444 « Epidémiologie et Sciences de l’Information » Faculté de Médecine Saint Antoine 27, rue Chaligny 75571 Paris

2 STIC en Santé INSERM/CNRS
Aide à la décision et optimisation de l’offre de soin pour l’insuffisance rénale terminale. Système d’Information Géographique en Santé : Approche spatio-temporelle des déterminants de santé.

3 STIC en Santé INSERM/CNRS
Grenoble Du 12-13 Février 2003 au 21-22 Décembre 2004 22 mois

4 Réseau collaboratif Projet STIC Santé INSERM/CNRS
Rappel : Réseau collaboratif Laurent Toubiana INSERM U444 Paris Paul Landais LBIM SIMS-REIN Hôpital Necker Paris Réseau collaboratif Projet STIC Santé INSERM/CNRS Michel Simonet TIMC-CNRS Grenoble Christian Jacquelinet Etabl. Français des Greffes Paris Christophe Tuffery ESRI-France Paris Philippe Mossé LEST – CNRS Aix en Provence

5 Objectifs Répondre aux besoins de représentations, d’analyses et de prédictions nécessaires à la prise de décision Répondre à la question de l’adéquation de l’offre à la demande de soins. Améliorer la maîtrise des coûts et d’anticiper les évolutions du système de soin.

6 Une architecture n-tiers
REIN (Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie) clients universels données Le retour d’Information Datamart REIN SIG Outils tableaux de bord Base d’évènements VUES Entrepôt Analyses statistiques Base d’identité serveur web dynamique

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8 Support cartographique et Système d’Information Géographique
Données La représentation cartographique au centre de l’interface du système d’information

9 MapoFlash : Une boîte à outils cartographique Web

10 MapoFlash : Accueil

11 MapoFlash : chargement de données

12 MapoFlash : représentation de données

13 MapoFlash : Manipulation cartes

14 MapoFlash : échelles et couleurs

15 MapoFlash : Krigeage

16 Intégration du module de cartographie interactive sur le site SentiWeb

17 Intégration du module de cartographie interactive sur le site SentiWeb

18 PaGeom : Annuaire cartographique

19 Intégration du module de cartographie interactive sur le site SarsNet

20 GripSite : Epidémiologie expérimentale des syndromes grippaux

21 GripSite : Epidémiologie expérimentale des syndromes grippaux

22 MetaSurv : Création de plateformes de surveillance incluant un SIG interactif

23 MetaSurv  La surveillance des maladies transmissibles émergentes nécessite la mise en place rapide d’outils efficaces pour la collecte de données, le retour d’information pour l’aide à la décision en cas de crise Le projet MetaSurv : un outil de création rapide de plateforme de surveillance à la disposition de non‑spécialistes de l’informatique. Nous avons vécus dans une actualité récente plusieurs événements de nature dramatique concernant la santé publique. Parallèlement, nous avons assisté plus ou moins consciemment à un phénomène de compétition, une véritable « course de vitesse », entre l’évènement lui-même et l’information sur l’évènement afin de mettre en place les mesures visant à l’enrayer. Il ne s’agit pas ici d’aborder des questions théoriques sur la dynamique des fluide dans les réseaux complexes, bien que la question soit intéressante et nous y travaillons par ailleurs, mais bien de rendre compte de l’introduction des Nouvelles Technologie de l’Information et de la Communication pour l’aide à la décision en santé. C’est dans ce cadre que nous présentons le programme de travail que j’ai intitulé MetaSurv. MetaSurv à pour objectif de diffuser auprès d’un large public a priori non spécialiste de l’informatique, les moyens de mettre en place en des délais record, des systèmes de surveillance complet allant du recueil de l’information à la redistribution a grande échelle d’analyses sur cette information.

24 MetaSurv : 2 Aspects Principaux du projet
La souplesse d’adaptation du système à de nouvelles surveillances comportant : la possibilité de mettre en place de nouvelles surveillances de pathologie sans effort de développement important. la possibilité « cloner » le système pour créer rapidement de nouveaux systèmes complets de surveillance. La restitution graphique et cartographique interactive des données observées. Est-il encore nécessaire d’affirmer que, dès son origine en 1984, l’équipe du réseau Sentinelles à toujours su « surfer » sur la vague de l’innovation technologique ?

25 MetaSurv : Initialisation de la plateforme
Nous appelons « Administrateur » la personne qui met en place et gère un réseau de surveillance. Le statut d’administrateur ouvre tous les droits de gestion du site tant du point de vue de la création des surveillances que de celui de l’animation du réseau de collaborateurs de surveillance.

26 MetaSurv : Mise en place des surveillances
Pour créer une nouvelle surveillance, il suffit de remplir quelques champs : 1) Le nom de la pathologie 2) L’espace sur lequel opère la surveillance (Monde, pays, ou tout autre lieu d’intérêt) 3) Un texte qui sera affiché pendant la saisie des cas. Validation Les tables de la bases de données relatives à cette nouvelle maladie sont automatiquement crées. Il faut maintenant définir les variables à surveiller

27 MetaSurv : Mise en place des surveillances Etape 2 :création des variables
Créer les champs relatifs aux variables à surveiller est très facile il suffit de renseigner : 1) Le nom de la variable 2) Le type de cette variable (numérique liste, radiobox texte date…) 3) le cas échéant des valeur de contrôle du champ Cette procédure est itérative tant qu’il y a de nouvelles variables pour la surveillance de cette maladie C’est tout : La nouvelle surveillance est disponible.

28 MetaSurv : Inscriptions et création du réseau

29 MetaSurv : Fonction d’animation du réseau
Serveur de News Forum Fiches personnelles Partage de document Statistiques de connexion Aide contextuelle

30 Visualisations : Graphiques interactifs

31 SCEPID : Remerciements
Tous mes remerciements aux étudiants qui au cours de leur stage se sont relayés depuis un an pour la réalisation de ce projet : Alexandre Herer (UTT) Elodie Dusch (MST-ISASH) Romain Rousselin (UTT) Carole Chapoy (UTT) Gaetan Bonnard (UTC) Stéphane Moreau(UTC)

32 Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM »
Revues à comité de lecture Toubiana L, Richard JB, Landais P. A Geographical Information System for End-Stage Renal Disease : the SIGNe. Nephrol Dial Transplant 2004 (in press) Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Stud Health Technol Inform 2003;95: Landais P. Supply of care and prevention. Presse Med Feb 2; 31(4): Landais P. Epidemiology of care demand. Presse Med Feb 2; 31(4): Autres communications Richard JB, Toubiana L, Ben Said M, Le Mignot L, Jais JP, Mugnier C, Landais P. Projet SIGNe : Intégration d’un Système d’Information Géographique pour la Néphrologie Congrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S122 Ben Said M, Mugnier C, , Le Mignot L, Richard JB, Jais JP, Le Bihan C, Toubiana L, Landais P. Multi sources InformationSystem and Epidemiologic Follow-up of Chronic DiseasesCongrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S122 Flahault A., Vibert JF, Thomas G, Toubiana L, Hanslik T, Boelle PY, Dorleans Y, Blanchon T, Viboud C, Vergu I, Alvarez F, Le Menac’h A., Legrand J, Sarter H, Jacob S, Carrat F, Massari V, Le Pont, Gropetis G, Valleron AJ, Le réseau Sentinelles : 20ans d’expérience en France. Congrès ADELF (15-17 septembre 2004) Rev Epidemiol Santé Publique, 2004, 52 :1S37. Duny Y, Landais P, Ben Saïd M,de Cornelissen F, Marty L, Daurès JP. Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Résultats du contrôle de qualité du réseau R.E.I.N en Languedoc-Roussillon. ADELF Bordeaux, septembre 2004. Le Mignot L, Mugnier C, Ben saïd M, Jais J-P, Richard J-B, Le Bihan C, Landais P. Dédoublonnage d'identités dans des bases web dynamiques multi-sources. ADELF Bordeaux, septembre 2004. Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a Multi-Source Information System for end-stage renal disease. MEDINFO. San Francisco, september 2004. Richard J-B, Toubiana L, Ben saïd M, Le Mignot L, Jais J-P, Mugnier C, Landais P. GIS Integration in Nephrology : a SIGNe. European Congress of Epidemiology. Porto Portugal September Journal of Epidemiology and Community Health Aug; vol 58; A47-A48 Ben saïd M, Mugnier C, Le Mignot L, Richard J-B, Jais J-P, Landais P. Multi Sources Information System and Epidemiologic Follow-up of Chronic Disease. European Congress of Epidemiology. Porto Portugal September 2004. Le Mignot L, Mugnier C, Ben saïd M, Jais J-P, Richard J-B, Le Bihan C, Landais P. A patient identification web server for avoiding doublons in web dynamic databases. Porto Portugal September 2004. Toubiana L, Herer A, Rousselin R, Chapoy C ,Dusch E, Flahault A MetaSurv : Un outil téléchargeable pour la création rapide de plateformes de surveillance sur Internet incluant un système d’information géographique interactif. Congrès MEDEC mars 2004 Paris

33 Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM » (suite)
Autres communications (suite) Crépey P, FP Alvarez, M Barthélémy, L Toubiana. Étude de la variabilité d'un modèle de réseau "scale-free" de taille finie. 1ère Conférence Internationale de la SFTB, Marrakech, Maroc (21-25 mai 2004). Alvarez FP, P Crépey, L Toubiana, M Barthélémy. Dynamique de la propagation d'une maladie infectieuse sur un réseau "scale free" à liens fluctuants. 1ère Conférence Internationale de la SFTB, Marrakech, Maroc (21-25 mai 2004). Simonet M, Toubiana L, Simonet A, Ben Saïd M , Landais P Ontology and Geographical Information System for End-Stage Renal Disease: the SIGNe. COSIT’03 Conference on Spatial InformationTheory September2003,  Ittingen, Switzerland Toubiana L "Utilisation des SIG et des NTIC en Epidémiologie" Colloque RISE Réseau International Santé Environnement (INVS) ‑ Bierville (16-17 mai 2003) Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. A dynamic Web application within an n-tier architecture: a Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Medical Informatics in Europe. Saint Malo, 2003. Toubiana L "Système d’Information Géographique en Santé pour l’Insuffisance Rénale Terminale" 15eme rencontres Européennes de la Géomatique « Le GeoEvenement 2003 » ‑ Paris (4, 5, 6 mars 2003) Guillon D, Landais P. for the working Group. A multi-source information system for End-Stage Renal Disease. EDTA registry meeting Berlin 2003. Ben Saïd M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Mugnier C, Taupin P, Jais JP, Simonet M, Landais P. Interface web dynamique et architecture n-tier pour l’insuffisance rénale terminale. E-Colloque® Interrégional 3ème édition Télémédecine 2002, septembre 2002. Landais P, pour le groupe SIMS REIN. Un Système d’Information Multi-Sources pour l’Insuffisance Rénale terminale. Colloque Technologies pour la santé. Ministère de la Recherche et de la Technologie. Paris, Juin 2002. Guillon D, Ben Saïd M, Gaspoz F, Simonet A, Jacquelinet C, Mugnier C, Simonet M, Landais P. Fusion d’un environnement de développement : du client à l’entrepôt de données. 1ères Journées de l’Information Médicale et de Santé – Stratégie Qualité Paris, mai 2002 Landais P, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Ben Saïd M, Mugnier C, Simonet M et le groupe Un Système d’Information Multi-sources pour le Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Colloque AIM. Paris, 2001. Toubiana L, "Système d’Information Géographique et Internet pour la surveillance des épidémie " SIG2002 Conférence Francophone ESRI ‑ Issy-les-Moulineaux (2-3 octobre 2002) Toubiana L, Flahault A, Vibert JF, Valleron AJ "A customizable internet-based system with geographic representation for health surveillance" IEA XVI World Congress of Epidemiology, Montreal, Canada (18-22 Aout 2002) Tuckwell HC, Hanslik T, Flahault A, Toubiana L, Valleron AJ "Neisseria Meningitidis: Dynamical Models for its Evolution and Control under Various Vaccination Schedules" IEA XVI World Congress of Epidemiology, Montreal, Canada (18-22 Aout 2002) Massari V, Toubiana L "A significant decrease in volontary HIV testing in general population in France" AIDS2002 XIV International AIDS Conference, Barcelone Spain (7-12 Juillet 2002) Landais P. Evolution of the care procedures for end-stage renal disease. Colloque Franco-allemand. La greffe en Strasbourg, 24 juin 2002. Toubiana L, "Intégration de la Géostatistique au SIG : de nouveaux horizons pour l'Information Géographique. L’exemple du Réseau SENTINELLE - INSERM " 14eme rencontres Européennes de la Géomatique « Le GeoEvenement 2002 » ‑ Paris (9-11 avril 2002)

34 Annexe 1 : Publications relatives au projet Initiative « STIC Santé INSERM » (suite)
Mémoires d'étudiant Gaetan Bonnard "MapoFlash : Développement d'un système d'information géographique interactif sur le Web" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Compiègne - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004 Stéphane Moreau "MetaSurv : Développement d'un site de surveillance épidémiologique paramétrable en technologie Flash." Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Compiègne - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004 Carole Chapoy "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2004 Romain Rousselin "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003 Benoist J, Poulain C, Lobo D, Klepper C, Crémieu H, Labescat AL."Développement d’un algorithme de lissage par potentiel fondée sur les voisinages spatiaux de portée variable sous Matlab » Mémoire de stage du certificat de biostatistiques et modélisation de la Maîtrise des sciences Biologiques et Médicales Université Pierre et Marie Curie – Paris VI (Dir. Toubiana L) 2003 Dutsch E "Implémentation d’algorithmes d’analyse spatiale et de leur représentation graphique en technologie interactive « swf » sur internet" Mémoire de stage de MST Informatique et Statistique Appliquée aux Sciences de l’Homme, Université René Descarte, Paris V - 3 mois (Dir. Toubiana L) 2003 Diouf ML "Approche spatio-temporelle des déterminants de santé, aide à la décision et optimisation des l’offre de soin : le cas de l’insuffisance rénale terminale dans la région du Limousin" DESS Geomarketing université de Créteil - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003 Nguyen Sothavy " Création d’un portail Web sur les ressources documentaires concernant les thèmes « Géographie de la Santé » et «Epidémiologie et Environnement » en France et dans le monde. " Mémoire de stage de DESS en sciences de l'information et de la documentation spécialisée de L'Institut National des Techniques de la Documentation - 2 mois (Dir. Toubiana L) 2003 Herer A "Réalisation d’un système d’information paramétrable pour le recueil épidémiologique sur internet et cartographie dynamique interactive" Mémoire de stage d’ingénieur Université Technologique de Troyes - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2003 Grech G "Système d’Information Géographique sur Internet pour la surveillance des épidémies" Mémoire de stage de DESS de Géomatique de l’Université d’Orléans - 6 mois (Dir. Toubiana L) 2002 Elluard M, Miel M, Piel B "Effet spatial de la mortalité au USA" Mémoire de stage du certificat de biostatistiques et modélisation de la Maîtrise des sciences Biologiques et Médicales Université Pierre et Marie Curie – Paris VI (Dir. Toubiana L) 2002 Livres Hiesse C, Jacquelinet C, Landais P. Insuffisance rénale chronique. Traité de Santé Publique. F. Bourdillon, G. Brücker, D. Tabuteau Edit. Med Sciences Flammarion Publ. Paris pp Toubiana L, Viboud C. Flahault A. Valleron AjV. Geography and Health Edition INSERM , Paris 2003 Landais P, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Ben Saïd M, Mugnier C, Simonet M et le groupe Un Système d’Information Multi-sources pour le Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). AIM 2001.

35 Développements à venir
Développer l’interface entre Data Warehouse du système d’information REIN (Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie) et un SIG-Internet. Proposer des simulations et envisager des scénarios d’optimisation Offre/Demande de soins.

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