La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

Paraclinique de génétique « Paramètres génétiques pour la résistance à la souche vaccinale de Salmonella abortusovis, Rv6 » Marie Lejong Katinka van Golen.

Présentations similaires


Présentation au sujet: "Paraclinique de génétique « Paramètres génétiques pour la résistance à la souche vaccinale de Salmonella abortusovis, Rv6 » Marie Lejong Katinka van Golen."— Transcription de la présentation:

1 Paraclinique de génétique « Paramètres génétiques pour la résistance à la souche vaccinale de Salmonella abortusovis, Rv6 » Marie Lejong Katinka van Golen 2 ème Doc

2 Objectifs 1) Étude de la susceptibilité à salmonella abortusovis chez le mouton 2) Étude du contrôle génétique de la réponse à l’infection (héritabilités et corrélations génétiques)  quel(s) critère(s) sélectionner pour augmenter la résistance à S. abortusovis

3 Matériel Population « Inra401 » de 1216 agneaux Issue de 30 pères Lignée développée à.p.d. 2 races: Berrichon du Cher et Romanov Souche vaccinale (atténuée) de S.abortusovis: souche Rv6 Lieu: Institut National de la Recherche Agronomique en France Année: 2002

4 Protocole expérimental J0 Prise de poids: W t0 (objectif M:38kg et F:32kg) Prise de sang: IgG1 0 et IgM 0 Inoculation IV: 10 8 bactéries de la souche vaccinale Rv6 J7 Prise de poids: W t7 Prise de sang: IgG1 7 et IgM 7

5 Protocole expérimental J10: Abattage et échantillonnage ( rate/nœuds lymphatiques) Enumération bactérienne BgS: n bactéries/g de rate BgS01: absence/présence de bactéries dans la rate BgRN: n bactéries/g de NL préscapulaire droit BgLN: idem nœud lymphatique gauche Poids des organes Wt s poids de la rate Wt ln/rn poids des NL Wtr s : poids relatif de la rate: Wt s /W t0 Perte de poids entre J0 et J7: loss-Wt

6 Modèles 1)Analyse des variables continues: le modèle gaussien:  effets fixes significatifs  effets fixes choisis dans le modèle final: P<0,05

7 Modèles 2) Analyse de la variable binaire: le modèle seuil « présence ou absence de salmonella abortusovis dans un gramme de rate ».

8 Signification des effets testés variableVariance expliquée sexe poids Age type Nais/tétée ssgroupe père IgM 0 Var IgM Log IgG1 0 LogVaIgG1 0 0.35 0.17 0.13 0.22 NS + NS +++ + ++ NS ++ + +++ + +++ LogBgLN LogBgRN LogBgS 0.10 0.11 0.05 ++ NS + +++ NS +++ + LogW t LN LogW t RN LogW t S LogW tr S 0.17 0.18 0.30 0.18 +++ NS +++ NS +++ NS +++ ++ +++ LogLossW t 0.11 +++ + ++ NS ++ BgS01 - + - NS +

9 Modèles Estimation de l’héritabilité et des corrélations phénotypiques et génétiques: le modèle mixte linéaire: Y kl =X kl.β+ε Y: variable aléatoire dépendante X: variable explicative β: effets fixes ε : erreur corrélée

10 Log IgG1 0 Log VarIgG1 0 IgM 0 Var IgM Log LN Log BgRN Log BgS Log LN Log WtRN Log WtrS Log LossWt Log IgG1 0 0.14 ±0.04 -0.53-0.17-0.06-0.050.19-0.110.490.480.270.12 Log VarIgG1 -0.100.30 ±0.03 0.110.550.160.120.110.280.450.270.24 IgM 0 0.130.040.64 ±0.03 -0.1200.09-0.60-0.12 0.25-0.38 VarIgM-0.010.33-0.090.37 ±0.02 0.290.250.130.140.160.310.45 LogBgLN0.030.090.040.180.22 ±0.03 O.930.560.010.060.260.41 LogBgRN0.040.06-0.020.190.530.27 ±0.03 0.51-0.060.070.380.20 LogBgS-0.020.07-0.040.190.160.170.06 ±0.01 -0.34-0.120.01O.58 LogWtLN-0.040.010.05-0.030.250.100.020.33 ±0.04 0.890.080.06 LogWtRN-0.010.050.04-0.010.160.260.040.520.26 ±0.03 0.240.16 LogWtrS-0.02-0.010.130.060.010.040.010.070.100.54 ±0.03 0.24 LogLossWt-0.03O.16-0.070.400.060.090.25-0.14-0.17-0.140.10 ±0.02 Héritabilités, corrélations génétiques et phénotypiques

11 Applications Objectif: une plus grande résistance des moutons face à salmonella abortusovis. En pratique: utilisation de IgM 0 comme critère de sélection?? Remarques Effet maternel??? Recherches à approfondir avant sélection!

12 Log IgG1 0 Log VarIgG1 0 IgM 0 Var IgM Log LN Log BgRN Log BgS Log LN Log WtRN Log WtrS Log LossWt Log IgG1 0 0.14 ±0.04 -0.53-0.17-0.06-0.050.19-0.110.490.480.270.12 Log VarIgG1 -0.100.30 ±0.03 0.110.550.160.120.110.280.450.270.24 IgM 0 0.130.040.64 ±0.03 -0.1200.09-0.60-0.12 0.25-0.38 VarIgM-0.010.33-0.090.37 ±0.02 0.290.250.130.140.160.310.45 LogBgLN0.030.090.040.180.22 ±0.03 O.930.560.010.060.260.41 LogBgRN0.040.06-0.020.190.530.27 ±0.03 0.51-0.060.070.380.20 LogBgS-0.020.07-0.040.190.160.170.06 ±0.01 -0.34-0.120.01O.58 LogWtLN-0.040.010.05-0.030.250.100.020.33 ±0.04 0.890.080.06 LogWtRN-0.010.050.04-0.010.160.260.040.520.26 ±0.03 0.240.16 LogWtrS-0.02-0.010.130.060.010.040.010.070.100.54 ±0.03 0.24 LogLossWt-0.03O.16-0.070.400.060.090.25-0.14-0.17-0.140.10 ±0.02 Héritabilités, corrélations génétiques et phénotypiques

13 Merci


Télécharger ppt "Paraclinique de génétique « Paramètres génétiques pour la résistance à la souche vaccinale de Salmonella abortusovis, Rv6 » Marie Lejong Katinka van Golen."

Présentations similaires


Annonces Google