Présenté par Amine Ghozlane Internship 05 march 2008 Skjaerven L., Jonassen I. et Reuter N. Juillet 2007 – Bioinformatics and

Présenté par Amine Ghozlane Internship 05 march 2008 Skjaerven L., Jonassen I. et Reuter N. Juillet 2007 – Bioinformatics Webnm@ and TMM@

Introduction 3 types de mouvements – Rotation – Translation – Slide 4 paramètres structuraux ont une influence sur ces mouvements ANOVA :

Normal mode analysis – Domaines des protéines ayant des mouvements de basse fréquence – Protéine divisée en bloc de 6 acides aminés – Peut représenter 80-90% des changements conformationnel globaux

Minimisation de l’énergie potentielle (obtenir la conformation la plus stable) Calcul de la matrice hessienne (dérivée seconde de l’énergie potentielle) Diagonalisation de la matrice hessienne Modèle atome…

Tmm@ : – Rotation et translation

Rotation Translation of Blocks

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