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JCR IFSI 2011-091 Principes de linvestigation dune épidémie Adapté de : Desenclos JC, Vaillant V, Delarocque Astagneau E, Campèse C, Che D, Coignard B,

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Présentation au sujet: "JCR IFSI 2011-091 Principes de linvestigation dune épidémie Adapté de : Desenclos JC, Vaillant V, Delarocque Astagneau E, Campèse C, Che D, Coignard B,"— Transcription de la présentation:

1 JCR IFSI Principes de linvestigation dune épidémie Adapté de : Desenclos JC, Vaillant V, Delarocque Astagneau E, Campèse C, Che D, Coignard B, et al. Les principes de linvestigation dune épidémie dans une finalité de santé publique. Med Mal Inf 2007;37:77-94 JC. REVEIL, N. TOUSSAINT, V. PIGEOT, O. PICHENOT CH Charleville-Mézières

2 JCR IFSI Epidémie : survenue en excès de cas, par rapport à la situation habituelle, dune maladie donnée, en un lieu et une période de temps donnés. connaître le niveau de base habituel de lincidence de la maladie définir la période et le lieu définir la nature de la maladie : définition des cas Définition dune épidémie NB : cas en excès = pas obligatoirement dorigine infectieuse (carences, intoxications, intentionnelles, sociogéniques…)

3 JCR IFSI Epidémies dorigine infectieuses : 2 situations Epidémies par transmission de personne à personne : grippe, SRASS, rougeole, SARM… Chercher et maîtriser les facteurs qui favorise le passage dune personne à lautre : isolement, mesures barrières, hygiène des mains, prophylaxie par antiinfectieux ou vaccination… Epidémies de source commune contaminée : aliment, aérosol… Identifier la source et le véhicule de transmission : retrait et arrêt de production dun aliment, dun produit de santé… Ces deux modalités impliquent des analyses et des mesures de maîtrise différentes mais elle peuvent être associées ou se succéder…

4 JCR IFSI Modes de transmission des agents infectieux Transmission : interaction entre lagent infectieux, lenvironnement et lhôte Transmission directe : transfert de lagent infectieux, sans élément intermédiaire, dun hôte infectieux à une porte dentrée dun hôte sensible (toucher, gouttelettes pharyngées, rapport sexuel…) Transmission indirecte : intervention dun élément intermédiaire au niveau duquel lagent se multiplie ou pas. - véhicule contaminé : eau, aliment, main, matériel, produit biologique.. - vecteur vivant : transport mécanique simple ou cycle plus ou moins complexe de maturation (parasites) Transmission aérienne : acquisition le plus souvent par voie respiratoire. - partie sèche, après évaporation, des gouttelettes de Pflügge (BK) - poussières environnementales (spores fongiques, virus Puumala)

5 JCR IFSI Approche méthodologique Trois directions complémentaires et interactive : enquête épidémiologique, enquête environnementale, enquête microbiologique Etapes de linvestigation : 1.Confirmer lexistence de lépidémie (puis Alerter) 2.Définir la maladie (définition des cas) 3.Répertorier les cas 4.Décrire les cas en termes de temps, lieux, personnes (courbe épidémique) 5.Etablir des hypothèses quant au mode de survenue 6.Tester ces hypothèses 7.Conduire une enquête environnementale adaptée 8.Mettre en œuvre les analyses microbiologiques nécessaires 9.Mettre en œuvre les mesures de contrôle et de prévention 10.Rédiger un rapport dinvestigation (REX) Démarche évolutive et déductive, ordre des étapes variable

6 JCR IFSI Confirmer lexistence dune épidémie Précocité +++, signalements +++, outils de surveillances Exemple de détection statistique, CNR Salmonelles,

7 JCR IFSI Comparaisons des taux des indicateurs épidémiologiques A.b. multiR en Réanimation Mars à Décembre 2002 A.b. multiR en Court Séjour Mars à Décembre 2002 A.b. multiR sur le total CH Mars 2002 à Décembre 2003 SARM acquis en Court Séjour au cours de l année 2003 Taux d attaque /100 ED Taux d incidence /1000 JH 6,1 4,2 0,03 0,06 0,05 0,07 0,25 0,44

8 JCR IFSI Détection de 2 épidémies distinctes et concomitantes de listérioses par typage moléculaire avec véhicules alimentaires différents : - épidémie 1 = rillettes - épidémie 2 = langue de porc en gelée CNR Listeria, Confirmer lexistence dune épidémie

9 JCR IFSI Définir la maladie épidémique Caractéristiques cliniques, biologiques, de lieu, de temps, de personne Souvent définition des cas avec trois niveaux de sensibilité et spécificité : - cas possible – cas probable – cas confirmé - important pour prendre rapidement des mesures sans attendre la confirmation des cas (ex: SRASS) Prendre en compte les formes asymptomatiques : dépistage (BMR, HVC, HVA) Rechercher les cas Dépend de la nature de la maladie et du lieu de survenue : - revue de dossiers, contacts avec les soignants, ville, pays, instituts de surveillance nationaux et internationaux (ex : legionelles) - échantillonnage, réseaux sentinelles - enquêtes séro-épidémiologiques

10 JCR IFSI Décrire les cas Étape essentielle et indispensable : - décrire la population touchée - estimer le taux dattaque - permet de repérer les variations selon les caractéristiques démographiques et de lieu - permet dorienter les investigations ultérieures et les mesures de maîtrise à mettre en œuvre - permet de générer des hypothèses sur la survenue et le développement e lépidémie Parfois cette étape est suffisante pour identifier le mode de transmission et contrôler lépidémie

11 JCR IFSI Caractéristiques de temps Source commune prolongée et intermittente : légionelloses dans le Pas-de-Calais à partir dune tour aéro-réfrigérante industrielle, Nov 2003-Jan 2004

12 JCR IFSI Caractéristiques de temps Source commune ponctuelle : TIAC à norovirus. Distribution des cas selon la période dincubation

13 JCR IFSI Caractéristiques de temps SRASS : cas à lhôpital français de Hanoï, février-mars 2003 La courbe épidémique permet destimer la période dincubation médiane ( 1 er pic : 3 à 10 j après hospitalisation du cas index, médiane 7j)

14 JCR IFSI Caractéristiques de temps Source alimentaire commune prolongée : salmonellose Paratyphi B (lysoype 1 var 3) France, juillet-décembre 1993 Pas daugmentation des autres sous-types (intérêt du lysotypage)

15 JCR IFSI Caractéristiques de temps Transmission de personne à personne : gastroentérites, SSR Distribution irrégulière sur une période bien supérieure à la période dincubation, recrudescences limitées de cas sur des périodes de 2 à 3 jours (incubation des GEI virales)

16 JCR IFSI Caractéristiques de temps Épidémie nosocomiale dhépatite C par transmission manuportée de patient à patient prolongée par le personnel soignant dans une unité dhémodialyse Intérêt de la surveillance et du signalement

17 JCR IFSI Caractéristiques de temps Source commune ponctuelle : épidémie dhépatites A liée à la fréquentation dune pataugeoire. Les cas ont fréquenté la pataugeoire avec le patient source qui était contagieux (signes cliniques le lendemain)

18 JCR IFSI Exemple d évolution dans le temps

19 JCR IFSI Exemple d évolution dans le temps

20 JCR IFSI Caractéristiques de lieu Épidémie communautaire de légionellose : représentation géographique des cas selon la zone de résidence, de travail ou de déplacement. Rennes 2000

21 JCR IFSI Répartition géographique des cas de légionellose lors de lépidémie de Harnes (Pas -de-Calais)

22 JCR IFSI Épidémie dinfections et de colonisations à A. baumannii BLSE dans la région NORD PAS de CALAIS en 2001 et 2003 Alerte diffusée par le C-CLIN Paris Nord en octobre 2003 Alerte diffusée au niveau national par lInVS via les 5 C-CLIN Etablissements ayant signalé des cas dA. baumannii multirésistant davril à octobre 03 11/2003 : 19 établissements Epidémie d Acinetobacter baumanii BLSE

23 JCR IFSI Le clone A.baumannii bla VEB-1 était déjà présent au CH de …….. lors de lépidémie de 2002 à partir du service de Réanimation. VEB-1 + VEB-1 - Epidémie d Acinetobacter baumanii BLSE

24 JCR IFSI Epidémie de SARM dans un établissement

25 JCR IFSI Caractéristiques de lieu Épidémie de GEI dans une maison de retraite : progression dans le temps de chambre à chambre suggérant une transmission de personne à personne par le personnel soignant Épidémie de Fièvre Q, vallée de Chamonix 2002 : taux dattaque plus élevé dans les lieux ou quartiers fréquentés par des élevages de moutons ou sur le trajet de la transhumance (élevages contaminés par Coxiella burnetti) Épidémies dorigine alimentaire : la répartition géographique des cas oriente vers un source à distribution locale, régionale, nationale ou internationale…

26 JCR IFSI Caractéristiques de personne Épidémie de méningites à méningocoque W135, après le pèlerinage à La Mecque, France, Diffusion limitée dans la population, dabord auprès des contact, puis extinction de lépidémie. Épidémie de fièvre typhoïde à Paris, 2004 : employé dune boulangerie servant sandwichs et salades porteur chronique de Salmonella typhi

27 JCR IFSI Epidémie communautaire de GEI à rotavirus et surveillance des cas nosocomiaux Surveillance des IN à rotavirus patients semaines 2006 Répartition temporelle des cas dinfections communautaires et nosocomiales à rotavirus en 2006

28 JCR IFSI Établir des hypothèses et les tester Enquête cas-témoins lors dune épidémie de trichinellose : Cas et témoins selon la consommation de viande dans les 3 semaines avant le début de la maladie. Charente-Maritime, décembre 1993 Lhypothèse « cheval » navait pas été jugée crédible initialement par les parasitologues

29 JCR IFSI Établir des hypothèses et les tester Enquête de cohorte rétrospective lors dune TIAC : Taux dattaque de GEI selon la consommation dhuitres provenant dun lieu spécifique, dans une maison de retraite, Paris, décembre 2002.

30 JCR IFSI Enquête environnementale, analyse microbiologique et typage de lagent responsable vérifier chaine alimentaire, conditions de conservation, traçabilité, nécessité de compétences spécifiques (services vétérinaires). ex : poudre de lait pour nourrissons contaminée par Enterobacter sakasakii, épidémie de syndrome hémolytique et urémique lié à des steacks hachés contaminés à E.coli O157 recherche dune source de légionelles, modélisation de la diffusion de lagent (>6km dans lépidémie du Pas-de-Calais !) établir la clonalité dune épidémie, typages moléculaires (bactéries), parfois approches phylogéniques et séquençage (HVC)

31 JCR IFSI Réa Réa Réa Réa Réa Réa Réa MG Pne Ger Réa Réa Epidémie de SARM dans un service : identité des pulsotypes

32 JCR IFSI Mesures de contrôle et de prévention prendre en compte de manière réactive et régulière les résultats de lenquête importance des relations entre équipe investigatrice et les décideurs de lorganisation avec les interfaces institutionnelles : à lhôpital, prévenir le chef de service, de pôle, le président du Clin, le Directeur, le Directeur des soins. Prévoir une éventuelle cellule de crise. information des patients (obligatoire si épidémie nosocomiale), du public si risque alimentaire établir des recommandations (ex : double filtre au niveau des capteurs de pression en hémodialyse, double nettoyage des endoscopes)

33 JCR IFSI Les contraintes lors de linvestigation dune épidémie souvent contexte difficile, environnement social, institutionnel, médiatique et politique, il faut « faire avec » pressions plus ou moins importantes des multiples intervenants, professionnels de santé, responsables détablissement, autorités sanitaires une épidémie est souvent révélatrice de dysfonctionnements anciens…ce qui peut susciter des controverses…. nécessité dune approche rigoureuse, dun personnel légitime au plan institutionnel, et dune communication transparente et mesurée vers les professionnels et le public difficultés liées à la nature rétrospective de lenquête : les informations ont été recueillies dans les dossiers à des fins cliniques et non épidémiologiques, mais il faut cependant conduire linvestigation dans lespoir den tirer un bénéfice.

34 JCR IFSI Importance de la surveillance et de sa capacité de détection Dans la situation 1 de détection et réponse tardives, limpact est limité Dans la situation 2 de détection et réponse précoce, limpact est important Situation 1 Situation 2

35 JCR IFSI Autres exemples dépidémies

36 JCR IFSI Épidémie dhépatite A dans les Côtes dArmor le : CIRE Ouest alertée par la Ddass 22 de 8 cas dhépatite A déclarés depuis mi-août. à la date du : 84 cas confirmés, résidant ou ayant résidé dans le département depuis début juillet. 46 : autre département; 3 : étranger lieu de résidence ou de séjour : secteur Lannion-Paimpol 42 hommes, 39 femmes ; âges : 4-82, médiane : 42 symptômes : du au 04-09; pic : 06 au source de contamination ponctuelle : du 4 au ictère dans 73 cas sur 80 documentés, 25 hospitalisés, évolution favorable pour tous

37 JCR IFSI Investigation épidémio sur 81 cas : absence de séjour hors métropole, de contact avec collectivité denfant, de restaurant et de zones de baignade communs. Contamination par eau de distribution exclue. Conso dau moins une espèce de coquillage pour 99% des cas; 83% des coquillages crus (huîtres, amandes, palourdes, praires), 77% des huîtres et 51% des moules. Sur les 26 touristes interrogés : 100% des huîtres et 58% des moules Coquillages consommés au domicile ou au restaurant mais origine commune probable des huîtres (en cours) 2 cas avec début des signes après le considérés comme secondaires Conclusion provisoire : épidémie liée à la consommation de coquillages entre le 4 et le 21 juillet, en particulier dhuîtres provenant de la baie de Paimpol

38 JCR IFSI Distribution hebdomadaire des cas dhépatite A par date de début des signes Côtes dArmor, juillet-septembre 2007 N=81

39 JCR IFSI FHSR : le point de lInVS au : nombre des cas légèrement supérieur à celui des années non épidémiques. 66 cas identifiés, 53 hommes, âges : ans médiane : 35,5 Afssa : pas augmentation de la population des campagnols roussâtres dans les Ardennes pendant lhiver

40 JCR IFSI

41 JCR IFSI

42 JCR IFSI Epidémie de Choléra au Sénégal Incidence/semaine, district de Touba Novembre Avril 2005

43 JCR IFSI Cas cumulés notifiés de choléra au Sénégal de Octobre 2004 au 12 Avril 2005

44 JCR IFSI Epidémie de Salmonelloses en France à S.agona Janvier-Avril 2005

45 JCR IFSI Cas de diarrhée à S.agona en fonction du département de résidence

46 JCR IFSI

47 JCR IFSI

48 JCR IFSI Diarrhées aiguës France entière

49 JCR IFSI Diarrhées aiguës, France fin 2010-début 2011 S S S S S

50 JCR IFSI Diarrhées aiguës France entière

51 JCR IFSI Grippe

52 JCR IFSI Grippe

53 JCR IFSI Syndromes grippaux, France fin 2010-début 2011 S S S S S

54 JCR IFSI Conclusion amélioration des connaissances scientifiques (ex : légionelles Pas-de-calais) champ large de méthodes incluant la dimension clinique, épidémiologique, environnementale, microbiologique et comportementale. le terme « épidémie » est parfois employé par excès pour caractériser un problème infectieux pas nécessairement menaçant sil est géré de manière réactive et rationnelle. constante évolution des agents infectieux et de leurs interactions avec lhomme : il y a toujours à apprendre ! anticiper et gérer les risques par la veille et la surveillance épidémiologique, mais aussi par linvestigation approfondie des épidémies.


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