Le musée comprend des pièces de Syracuse datant de la préhistoire à la période grecque et romaine provenant des fouilles de la ville et d'autres sites en Sicile.
Le rez-de-chaussée est divisé en 3 zones (ABC), tandis que le corps central (zone 1) est consacrée à l'histoire du musée et sont présentés brièvement les matériaux exposés aux différents secteurs.
Sur le terrain, consacrée à la préhistoire (Paléolithique supérieur de l'âge de fer), avec une exposition de roches et de fossiles qui témoignent des différentes formes d'animaux dans Quaternaire. Il est précédé par une section qui présente les caractéristiques géologiques de la Méditerranée et la zone Iblea
Dans la zone B, qui se consacre à les colonies grecques de Sicile et de la mer Ionienne Doric période, vous pouvez identifier l'emplacement des colonies grecques en Sicile et dans leurs villes d'origine. Elles sont également exposées: une statue de marbre de Kouros de tête Leontinoi (Lentini) au début du cinquième siècle avant JC Les conclusions de la colonie de Megara Doric Hyblaea, statuettes votives de Déméter et Kore et une gorgone, une tête d'Auguste provenant de Centuripe.
Aussi sur écran est la Vénus Anadiomene aussi connu sous le nom de Venus Landolina de l'archéologie qu'il a découvert en 1804 à Syracuse, appelé merveilleux "pour l'excellence du modèle, l'exquise traitement du nu, d'une incroyable vivacité et de la morbidité de Bernabò Brea.
Dans la zone C de l'exposition sont présentés sous- colonies de Syracuse: Akrai (664 BC), Kasmenai (644 BC), Camarina (598 BC), Eloro. Ainsi que les conclusions d'autres centres de l'est de la Sicile et de Gela et Agrigente.
Le domaine D, placé à l'avant-plan, a été ouvert en 2006 et contient des objets datant de hellénistique et romaine. Intérieur de celui-ci contient certains des plus célèbres pièces du musée: la Vénus Landolina et le sarcophage de Adelfia, en plus d'une sélection de pièces de numismatique du cabinet sur la Piazza Duomo.