INFSO-RI Enabling Grids for E-sciencE L’activité EGEE au CINES Nicole Audiffren, Adeline Eynard et Gérard Gil Réunion de la fédération Française EGEE, Marseille 24 mars 2005

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 2 Le CINES Missions –le calcul numérique intensif –l’exploitation des bases de données d’information et de documentation, notamment celles utilisées dans le secteur des bibliothèques –expertise et formation en matière de réseaux informatiques nationaux et internationaux et en matière de technologies associées effectifs : 46 personnes (enseignement supérieur et CNRS) Centre Informatique National de l’Enseignement Supérieur (EPA)

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 3 Les moyens de calcul SGI Origin 3800 –768 processeurs MIPS R14000 (500MHz) ( ) –384 Go de mémoire –Puissance crête : 768 GFlops –Réseau d’interconnexion Numalink –1,5 To d’espace disque rapide partagé

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 4 Les moyens de calcul IBM/Cluster P1600 –9 nœuds de 32 processeurs power4, 32/64 Go de mémoire –Puissance crête : 1,85 Tflops –Réseau d’interconnexion HPS –4,5 To d’espace disque rapide partagé IBM/SP3 –29 nœuds de 16 processeurs power3, 16 Go de mémoire –Puissance crête : 0,7 Tflops –Réseau d’interconnexion SPS –4,6 To d’espace disque rapide partagé

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 5 Les moyens de stockage SERVEUR DE FICHIERS – Cluster de 2 machines SGI – 34 To utiles (Hitachi) – destiné aux fichiers scientifiques ( NFS) – système de gestion hiérarchique (DMF) – sauvegarde quotidienne Librairie automatisée StorageTek 9 lecteurs 5500 cartouches (20 Go et 200 Go)

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 6 SA1 au CINES Les machines « dédiées EGEE » –Nœud d’administration : DELL 1850 (Bi xeon, 2 Go) –User Interface: DELL 1850 (Bi xeon, 1 Go) –Storage Element : DELL 2800 (Bi xeon, 1Go, 4*146 Go disque) –Computing Element :DELL 1850 (Bi xeon, 1 Go) –2 Working Nodes : HP DL 145 (Bi Opteron, 1 Go)

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 7 SA1 au CINES Les machines « dédiées EGEE » –Base logicielle actuelle  LCG  Quattor 1.0  Scientific Linux 3.0.3

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 8 SA1 au CINES Les machines « dédiées EGEE » –Base logicielle actuelle  LCG  Quattor 1.0  Scientific Linux –État de déploiement :  En cours d’installation  Difficultés rencontrées : Découverte LCG en novembre 2004 Évolution rapide des environnements Problèmes techniques : Quattor, Kickstart, dhcp, PXE, …

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 9 SA1 au CINES Objectif dans le cadre SA1 « Étude de faisabilité de l’intégration de ressources de calcul parallèle et de stockage sur la grille » Contrainte « Cœxistence avec une production classique »

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 10 SA1 au CINES Phases de mise en œuvre 1)Installation des machines et services EGEE, et validation du fonctionnement avec les WNs dédiés 2)Expérimentation du déploiement de WN sur un cluster LINUX 3)Expérimentation du déploiement de WN sur IBM P1600 4)Étude de l’intégration d’un environnement de production classique dans la grille

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 11 SA1 au CINES ENKI ZEUS UI SE CE IBM/P1600 HP/DL145 Torque LoadLeveler RedHat / ROCKS AIX / CSM SL / QUATTOR Espace de stockage RENATER WN

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 12 NA4 au CINES Portage de l’application biomédicale GATE (plateforme de simulation Monte Carlo pour la planification de traitements par radiothérapie et curiethérapie) sur les machines du CINES : –Sur SGI et IBM –Difficultés rencontrées :  GATE fait appel à plusieurs programmes ou librairies qui ne sont plus supportés sur les systèmes IRIX et AIX  Sur SGI : surtout des problèmes de makefiles erronés  Sur IBM : le compilateur xlC tolère peu d’écarts par rapport à la norme ANSI : plus de modification de code nécessaires –Aujourd’hui, GATE fonctionne sur les 3 supercalculateurs

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 13 NA4 au CINES Tests de GATE –Comparaison du temps d’exécution d’un job sur un PC avec le temps total moyen pris pour faire passer ce job en dix morceaux à différentes heures de la journée sur IBM SP4

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 14 NA4 au CINES Interprétation des résultats : –Les machines du CINES sont en production : temps d’attente non négligeable, variable suivant les heures. –Pas d’échange de message : ne profite pas du plus gros avantage des machines

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 15 NA4 au CINES SiMRI3D, un simulateur d’IRM utilisant MPI développé au CREATIS, a été porté sur la machine SGI Tests réalisés sur 9 et sur 65 processeurs

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 16 NA4 au CINES Une simulation a pu être faite sur une image de taille 128^3 grâce au nombre de processeurs disponibles au CINES On aurait un temps de calcul inférieur pour le même nombre de processeurs sur IBM SP4 (portage en cours) Recherche d’autres applications intéressées par des essais au CINES et utilisant MPI –Premier contact avec l’IPGP –Si d’autres applications sont intéressées, nous contacter

Enabling Grids for E-sciencE INFSO-RI EGEE France - 24 mars CINES 17 Contacts NA4 : SA1 :