Au sujet de la classification PB2 Yves Deschomets
Des classifications
Les hommes ont classé les plantes dés l’antiquité . Cela était nécessaire : plantes aromatiques plantes médicinales La classification des animaux est venue beaucoup plus tard
Linné, Suédois, est le père de la classification dite classique Il pensait que les espèces végétales et animales avaient été créés par Dieu et ne s’étaient pas transformées au cours du temps. (théorie du fixisme) 1702-1778 Il a classé les espèces selon des critères morphologiques.
Nous lui devons la nomenclature binominale : chaque espèce est nommée par un binom en latin => un nom de genre suivi d’une spécificité Il a utilisé le latin qui était considéré comme une langue noble Le poulpe => Octopus vulgaris
Octopus vulgaris La classification comportait 7 échelons 7 est un nombre parfait selon la bible. Règne : Animal Embranchement : Mollusques Classe : Céphalopodes Ordre : Octopodes Famille : Octopodidés Genre : Octopus Spécification : vulgaris Octopus vulgaris Il répartit les êtres vivants en deux 2 règnes Végétal Animal
Une échelle En 1760 Charles Bonnet , naturaliste Suisse, faisait une classification en forme d’échelle Cela marquait l’idée que les différents éléments étaient une graduation dont le sommet était l’homme
Un arbre au XIX siècle (animaux) L’homme était toujours au sommet Mammifères Vertébrés Invertébrés Unicellulaires
Division en 2 : Végétaux / Animaux Linné séparait les êtres vivants en 2 règnes. Division en 2 : Végétaux / Animaux
Division en 2 : Unicellulaire / Pluricellulaires Le 1er microscope Il était impossible de faire entrer les organismes unicellulaires dans la division végétal / animal Division en 2 : Unicellulaire / Pluricellulaires
Division en 2 : Procaryotes / Eucaryotes Puis vers le milieu du XX ème siècle les scientifiques grâce au microscope électronique découvrent : La cellule procaryote « qui vient avant les eucaryotes » La cellule eucaryote « noyau vrai » matériel génétique noyau 0,2–2,0 µm 10–100 µm le matériel génétique est libre dans la cellule. les chromosomes sont contenus dans un noyau. Division en 2 : Procaryotes / Eucaryotes
Ces 3 divisions en 2 = > Des scientifiques proposent un monde du vivant à 5 règnes Ils se nourrissent par absorption Organismes pluricellulaires Eucaryotes Organismes unicellulaires Procaryotes Et les virus ? Ce sont les bactéries
Il y a débat Cependant, selon de nombreuses définitions : Le vivant est une entité matérielle réalisant les fonctions de relation, nutrition, reproduction. Les virus ne seraient pas des êtres vivants. Ils ont besoin de la machinerie de la cellule hôte pour se reproduire.
les bactéries (Eubactéries) les Archéobactéries appelées aussi Archées 1950 = >les scientifiques divisaient les êtres vivants en 2 : les Eucaryotes - les Procaryotes Carl Woese (microbiologiste américain) a étudié la parenté des êtres vivants Il a mis en évidence en 1970 que les Procaryotes devaient être divisés en 2 les bactéries (Eubactéries) les Archéobactéries appelées aussi Archées 1928 - 2012
Les Archées ont autant de de différences entre les Bactéries qu’avec les Eucaryotes Il y a donc 3 domaines du vivant. Tous les êtres vivants ont un ancêtre commun. Il est appelé LUCA . En français : Le dernier ancêtre commun universel.
Le buisson du vivant La représentation la plus logique espèces actuelles cellule originelle LUCA les 3 lignées cellulaires espèces éteintes L’homme est au même niveau que n’importe quelle espèce
La cladistique
Elle montre l'évolution des espèces La cladistique a été présentée dans les années 1950 par Willi Henning (Allemand, il a étudié les insectes) 1913-1976 Cette théorie cherche à établir les relations de parenté entre les différentes espèces en regardant la génétique Elle montre l'évolution des espèces
Cet ancêtre est marqué par une innovation évolutive Elle est composée de taxons ou clade qui regroupent toutes les espèces qui sont issus d’un même ancêtre. Cet ancêtre est marqué par une innovation évolutive Elle se présente sous forme de diagramme. B A Généralement , c’est celui là C
La cladistique Les groupe C et D sont dits groupes frères groupe A Innovation évolutive a groupe C ancêtre commun b groupe D Les groupe C et D sont dits groupes frères Il y a 2 clades les groupes C et D avec leur ancêtre b Les groupes A, C et D avec leur ancêtre a
Ce membre dit « chiridien » est homologue Ici le membre muni de doigts est semblable chez touts les tétrapodes. Il est hérité d’un ancêtre commun : le premier tétrapode. Ce membre dit « chiridien » est homologue Les tétrapodes forment avec leur ancêtre commun un groupe monophylétique. grenouille lézard oiseau homme chat baleine chauve-souris Bla bla bla bla
Les ailes des insectes et des oiseaux ont une fonction identique Celles des insectes sont une expansion du tégument Celles des oiseaux sont soutenues par des membres chiridiens Elles sont apparues à 2 moments de l’évolution. Elles sont analogues
Les sauropsides regroupent les animaux qui pondent des œufs Une partie des reptiles Les oiseaux Autre partie des reptiles Les sauropsides regroupent les animaux qui pondent des œufs Les reptiles ne regroupent pas tous les descendants d’un ancêtre commun. => Les reptiles sont un groupe paraphylétique. : les reptiles et les oiseaux.
Nous revenons à LUCA et aux 3 lignées cellulaires Les scientifiques ont découvert que les Archées et les Eucaryotes, répliquaient l’ADN de la même façon et utilisaient des protéines homologues pour compacter l’ADN. La plupart pensent que se sont 2 groupes frères Eubactéries 3,5 milliards d’années LUCA Archées ??? 3,5 à 3,8 milliards d’années Eucaryotes 2,1 milliard d’années
Construction des arbres N1 et N2 Nous nous limiterons aux taxons dont nous pouvons voir des espèces en plongée. (photographiées par DORIS).
ARBRE N1 Végétaux Éponges Cnidaires Vers plats Annélides Mollusques Eucaryotes Cnidaires Vers plats Métazoaires Annélides Mollusques Vrais Métazoaires Bouche en premier Bryozoaires Arthropodes Bilatéraux Échinodermes Urochordés Bouche en second Poissons Cartilagineux Chordés ARBRE N1 Vertébrés Poissons Osseux Animaux osseux Mammifères Reptiles
ARBRE N2 Algues vertes Plantes à fleurs Algues rouges Algues brunes 900 ma Algues vertes Plantes à fleurs 125 ma Lignée verte Algues rouges 590 ma Algues brunes Lignée brune 700 ma Eucaryotes Diatomées Desmosponges Hexatinellides Calcisponges 680 ma Métazoaires Cnidaires Radiaires Cténophores Protostomiens Bilatéraux Deutorestomiens
Les lophotrochozoaires ARBRE N2 Protostomiens Lophophore ou larve trochophore Les lophotrochozoaires
bande de cils locomoteurs et les animaux possédant un lophophore. Les scientifiques regroupent les animaux présentant une larve trochophore forme de toupie bande de cils locomoteurs et les animaux possédant un lophophore. Bande de cils locomoteurs
Protostomiens Les spiraliens ARBRE N2 Le plan de division des cellules est oblique Lophophore ou larve trochophore Les spiraliens
Les plans de division sont horizontal et vertical Les cellules divisées se trouvent décalées Le plan de division est obliques Les spiraliens
Protostomiens ARBRE N2 Entoproctes Le plan de division des cellules est oblique Lophophore ou larve trochophore
Les entoproctes Ils vivent en colonie, sur des stolons Les individus sont formés d’un pied et d’un calice muni d’une couronne de tentacules La bouche et l’anus sont situés dans le calice (d’où le nom) Entoproctes d'Europe Les individus mesurent 1 à 5 mm
Protostomiens Lophophorates Cutilates ARBRE N2 Entoproctes Mésenchyme Plathelminthes Nemertes Le plan de division des cellules est oblique Mollusques Lophophore ou larve trochophore Siponcles Annélides Bryozoaires Lophophore Brachiopodes Phoronidiens Lophophorates cuticule Arthropodes Cutilates
Echinodermes Urochordés Céphalocordés ARBRE N2 innovation évolutive chorde bandes de muscles sur les côtés innovation évolutive ARBRE N2 DEUTEROSTOMIENS
Céphalocordés Une corde persiste toute leur vie. Ils ne possèdent ni de tête, ni crâne ni nageoires Ils vivent dans des eaux peu profondes enfouis dans le sédiment Ce sont des animaux filtreurs 5 et 7 cm de long
ARBRE N2 Echinodermes Urochordés Céphalocordés Myxinoïdes chorde Céphalocordés bandes de muscles sur les côtés Myxinoïdes crâne innovation évolutive ARBRE N2 DEUTEROSTOMIENS
Myxinoïdes Allure vermiforme, avec une seule nageoire caudale Possède un crane Sont dépourvus de mâchoires et de vertèbres La bouche comprend des plaques munies de dents qu’ils peuvent projeter en avant. Se nourrissent de poissons malade ou morts.
ARBRE N2 Echinodermes Urochordés Céphalocordés Myxinoïdes Lamproies chorde Céphalocordés bandes de muscles sur les côtés Myxinoïdes crâne Lamproies vertèbres innovation évolutive ARBRE N2 DEUTEROSTOMIENS
Lamproies Ce sont des vertébrés dépourvus de mâchoires La tête est munie d’une ventouse entourant la bouche qui possède des dents qui permettent la succion du sang des victimes lamproie marine 80 cm de long en moyenne La lamproie ne provoque pas la mort de l'hôte qu'elle quitte pour un autre au bout de quelques jours. Elle possède des orifices branchiaux, une ou deux nageoires dorsales, et une nageoire caudale
ARBRE N2 Echinodermes Urochordés Céphalocordés Myxinoïdes Lamproies chorde Céphalocordés bandes de muscles sur les côtés Myxinoïdes crâne Lamproies Poissons cartilagineux vertèbres mâchoires innovation évolutive ARBRE N2 DEUTEROSTOMIENS
ARBRE N2 Echinodermes Urochordés Céphalocordés Myxinoïdes Lamproies chorde Céphalocordés bandes de muscles sur les côtés Myxinoïdes crâne Lamproies Poissons cartilagineux vertèbres nageoires avec rayons mâchoires Poissons osseux innovation évolutive os véritable ARBRE N2 DEUTEROSTOMIENS
ARBRE N2 Echinodermes Urochordés Céphalocordés Myxinoïdes Lamproies chorde Céphalocordés bandes de muscles sur les côtés Myxinoïdes crâne Lamproies Poissons cartilagineux vertèbres nageoires avec rayons mâchoires Poissons osseux innovation évolutive Coelacanthes os véritable ARBRE N2 nageoires attachées par un seul élément DEUTEROSTOMIENS
Coelacanthes Nageoires charnues. Les nageoires pectorales et anales se rattachent au corps par des appendices carnées Ils possèdent une poche de gaz qui pourrait être le vestige de poumon ancestral.
ARBRE N2 Echinodermes Urochordés Céphalocordés Myxinoïdes Lamproies chorde Céphalocordés bandes de muscles sur les côtés Myxinoïdes crâne Lamproies Poissons cartilagineux vertèbres nageoires avec rayons mâchoires Poissons osseux innovation évolutive Coelacanthes os véritable Dipneustes ARBRE N2 nageoires attachées par un seul élément poumons avec alvéoles DEUTEROSTOMIENS
Coelacanthes Dipneustes ils possèdent des poumons fonctionnels en plus des branchies habituelles. Ils vivent dans les fleuves ou marécages tropicaux. Ils creusent un terrier dans la vase en début de saison sèche, et sécrètent un mucus qui les enferme dans un cocon.
ARBRE N2 Echinodermes Urochordés Céphalocordés Myxinoïdes Lamproies chorde Céphalocordés bandes de muscles sur les côtés Myxinoïdes crâne Lamproies Poissons cartilagineux vertèbres nageoires avec rayons mâchoires Poissons osseux innovation évolutive Coelacanthes os véritable Dipneustes ARBRE N2 nageoires attachées par un seul élément Tétrapodes poumons avec alvéoles DEUTEROSTOMIENS