Véret Caroline Wacheux Emilie Wagmans Marie-Christine 2ième doctorat L'héritabilité de l'ostéochondrose disséquante chez les chevaux Maremmana Véret Caroline Wacheux Emilie Wagmans Marie-Christine 2ième doctorat 13/11/2018

Plan 1 I Introduction II Matériel et méthodes III Résultats IV Discussion V Commentaire 1 13/11/2018

2 Introduction Le cheval de Maremmana L’ostéochondrose disséquante La littérature présente de nombreuses études sur l’héritabilité de l’OCD. Les biais Le but de cette étude est d’estimer l’héritabilité de l’OCD sur base de radiographies dans la population des chevaux Maremmana et d’évaluer les effets de cette estimation sur la fréquence de cette maladie sous différentes stratégies de sélection. 2

3 Matériel et méthode 350 chevaux issus de 75 étalons L ’évaluation clinique inclus les examens radio des articulations  On peut relever la présence d’OCD à six endroits différents Les vues radiologiques  3

Matériel et méthode (suite) Les méthodes : Si le cheval est atteint d’OCD on lui attribue la valeur 1, sinon la valeur 0. L’analyse a été réalisée sur base d’un modèle mixte :  yijk = m + sexi + yearj + b(INB)ijk + b(TBP)ijk + horsek + eijk on recherchera essentiellement la valeur d’élevage “ horsek ” Deux modèles sont utilisées :le modèle TM sur base d’un modèle binaire (0 ou 1) et Le modèle AM basé sur une échelle d’observations Comparaison des deux modèles Evaluation des différentes stratégies de sélection 4

Calcul de l ’héritabilité Les valeurs d’élevage individuelles permettent de déterminer la variance génétique additive pour la population. Variance environnementale /Variance génétique /Variance résiduelle  = variance totale = variance phénotypique L’héritabilité = variance génétique additive/variance phénotypique. (pour la population) 5

6 Résultats Signes radiographiques d’OCD : Concerne 58 animaux (16.6%), Fréquences des lésions selon leur localisation : Localisation Nbre de poulains affectés Fréquence (%) Nbre d’étalons LTRF 18 5.1 15 DIRT 29 8.3 16 LMT 2 0.6 2 MMT 1 0.3 1 SRM 3 0.8 3 DMPP 7 2 7 6

Resultats (suite) Coefficient de consanguinité: 0.034  0.028  son augmentation accroît la prédisposition à l’OCD Pourcentage de sang pur-sang: 21.73  8.41  son augmentation diminue le nombre d’animaux affectés Calcul de l ’héritabilité AM TM Modèle sexe et année 0.130.216 0.080.227 Modèle mixte complet 0.140.0225 0.090.240 7

Resultats (suite) Comparaison des méthodes % d’animaux Linéaire Rangées 3 0.96 0.82 5 0.93 0.74 10 0.89 0.67 Total 0.90 0.93 Les corrélations linéaires étant proches de 1, les deux méthodes sont donc équivalentes. 8

Resultats (suite) Mais il y a une diminution de la variance phénotypique des descendants en réponse à la sélection dans le modèle AM. Variance environnementales/Variance génétique/Variance résiduelle La somme de ces 3 variances donne la variance phénotypique. La variance génétique est donc proportionnellement plus élevée dans le modèle AM, l’héritabilité y sera surestimée par rapport à TM.

Resultats (suite) Evaluation des réponses à la sélection Fréquences d’OCD après 5 générations : Sélection h2 = 0.14 h2 = 0.09 Contre mâles et femelles 1.8% 2% Contre mâles 5.8% 6.1% Contre mâles et 5.5% 5.9% grand mères paternelles

Discussion L’incidence est représentative de la population des chevaux Maremmana. La méthode AM considérant chaque lésion comme distincte convergeait toujours vers une variance génétique additive de 0. De plus la faible quantité de données ne permet pas d’établir des corrélations entre les différents sites de lésions. En revanche la méthode MATVEC nécessite d’ordonner les valeurs de départ.

Discussion Les résultats de l’héritabilité estimée se rapprochent des valeurs les plus basses trouvées dans la littérature Le résultats révèlent aussi que le sexe a un très petit effet sur la variable animal alors que l’effet de l’année de naissance surestime la variance génétique additive. Les différentes stratégies de sélection influent sur la fréquence des animaux atteints. Il faudra régulièrement recalculer l’héritabilité car cette dernière variera avec la diminution de la prévalence d’OCD.

Commentaire Les deux méthodes utilisées ici ont montré leurs faiblesses. Etude sur une race de chevaux beaucoup plus représentée ? Etude avec des étalons ayant une descendance bien plus abondante ( plus de liens génétiques ) ? Etude portant sur l’hérédité éventuelle de la localisation et du grade des lésions ( mesures discrètes graduelles) ? De plus de nombreux effets environnementaux auraient pu être pris en compte Enfin, il serait intéressant d’évaluer la corrélation existant entre les lésions radiologiques d’OCD et la performance.

Commentaire (suite) Le gène de l’ostéochondrose est en cours de dépistage à partir d’une population de trotteurs français, utilisant la stratégie de gène candidat positionnel. Or l’état de la carte génomique actuelle ne permet pas une analyse moléculaire de caractères multifactoriels tels que l’ostéochondrose. Ces recherches permettraient à terme l’utilisation de marqueurs génétiques pour dépister les individus porteurs de cette tare.