Lecointre et Le Guyader, 2006 (39 €)

Les 10 règnes d'Eucaryotes, les 2 règnes d'Archées Bactéries L'arbre du vivant Les 10 règnes d'Eucaryotes, les 2 règnes d'Archées et les 5 règnes de Bactéries D'après Wolfe-Simon et al. (2005)

Position des Mimivirus dans l’arbre du Vivant Arbre phylogénétique construit à partir des séquences de 7 protéines universellement conservées dans les organismes cellulaires, et toutes présentes chez Mimivirus D’après Raoult et al., 2004.

L'appareil cinétique d'une Bactérie Salmonella typhimurium MotAB = moteur basal C rod  sens de la rotation D'après Morgan et Khan (2001)

L'appareil cinétique des Eucaryotes : undulipodium et cinétosome 200 nm Microtubules (tubuline) Prolongement du plasmalemme undulipodium Cinétosome (granule basal) D'après Margulis et Schwattz (1985)

Différences entre Bactéries et Archées Caractéristique Bactéries Archées (Eucaryotes) Peptidoglycane dans la paroi cellulaire Présent Absent (absent) Muréine dans la paroi cellulaire Présente Absente (absente) Lipides membranaires Hydrocarbu-res linéaires Hydrocarbu-res ramifiés (hydrocarbu-res linéaires) ARN polymérase 1 sorte Plusieurs sortes (plusieurs sortes) Acide aminé initiateur début synthèse protéines Formyl-méthionine Méthionine (Méthionine) Introns Absents Rares (présents) Réponse à streptomycine et chloramphénicol (synthèse protéines) Inhibée Non inhibée (non inhibée) Histone associée à DNA Non Oui

Les spectres d'absor-ption des pigments photosynthétiques Chlorophylle b Les spectres d'absor-ption des pigments photosynthétiques Béta carotène Phyco-érythrine Chloro-phylla a Bactério-chloro-phylle Longueur d'onde Infra-rouge Bleu Vert Rouge Spectre visible

La chlorophylle a En vert : les 4 cycles pyrol En bleu : le phytol Mg OCH3 La chlorophylle a En vert : les 4 cycles pyrol En bleu : le phytol D'après Jeffrey (1989)

Une cellule de Cyanobactérie Paroi cellulaire : contient de la muréine (polymère d'acide di-amino-pimélique, d'acide muramique, etc.) caractéristique des Bactéries Plasmalemme Thylakoïde : Chloro-phylles, xanthophyl-les Cytoplasme Phycobilisomes : Phycoérythrine, phycocyanine, allo-phycocyanine ADN proca-ryo-tique Cyanamylon (proche du glycogène ; polysaccharide ; produit de la photosynthèse) Ribo-some 70S Globule lipidique Airosome (vacuole gazeuse) Granule structuré (réserves protéiques) Carboxysome : enzymes photosynthèse

Spectre d'absorption de la lumière des pigments photosynthétiques Coefficient d'absorption de la lumière (%) Longueur d'onde (nm) 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 400 700 500 600 Spectre d'absorption de la lumière des pigments photosynthétiques Phycoérythrine (phycobiline). N'absorbe pas dans le rouge Chlorophylle a : deux pics d'absorption. Le bleu et le jaune sont peu absorbés Phycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu Allophycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu D'après Gantt (1990). Noter qu'il s'agit en fait d'une Rhodobionte

Bilan en azote de l’océan mondial D’après Kolber (2006)

LES 10 RÈGNES D’EUCARYOTES D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Cours C.F. Boudouresque 2010 Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Glauco-cysto-biontes Cercobiontes ALVÉOLÉS Charo-phycées Phytomyxea Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Viridiplantae Ciliés Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Retaria Actinophryda Chromalvéolés Radio-laires Prasinophycées Labyrinthulobiontes RHIZARIA Oobiontes Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa AMOEBOBIONTES Cryptobiontes Euglé-noïdes Unichontes Microsporidies Eugléno-biontes Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Diplo-monadines Retorta-mona-dines Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes OPISTHOCHONTES EXCAVATES DISCICRISTATES

Bichontes = les 8 autres règnes Ce que la tradition (au sens large) a nommé ‘végétaux’ : un ensemble polyphylétique Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries (‘algues bleues’), Actinobactéries et Planctobactéries Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Glauco-cysto-biontes Cercobiontes ALVÉOLÉS Charo-phycées Phytomyxea Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Viridiplantae Ciliés Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Chromalvéolés Radio-laires Retaria Actinophryda Prasinophycées Labyrinthulobiontes RHIZARIA Oobiontes Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa AMOEBOBIONTES Cryptobiontes Euglé-noïdes Unichontes Microsporidies Eugléno-biontes Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Diplo-monadines Retorta-mona-dines Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes OPISTHOCHONTES EXCAVATES DISCICRISTATES

Ce que la tradition a nommé ‘Algues’ : un ensemble polyphylétique Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries, D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Glauco-cysto-biontes Cercobiontes ALVÉOLÉS Charo-phycées Phytomyxea Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Viridiplantae Ciliés Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Retaria Actinophryda Chromalvéolés Radio-laires Prasinophycées Labyrinthulobiontes RHIZARIA Oobiontes Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa AMOEBOBIONTES Cryptobiontes Euglé-noïdes Unichontes Microsporidies Eugléno-biontes Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Diplo-monadines Retorta-mona-dines Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes OPISTHOCHONTES EXCAVATES DISCICRISTATES

Ce que la tradition a nommé ‘champignons’ Il manque ici les Procaryotes : Planctobactéries et Actinobactéries D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Glauco-cysto-biontes Cercobiontes ALVÉOLÉS Charo-phycées Phytomyxea Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Viridiplantae Ciliés Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Retaria Actinophryda Chromalvéolés Radio-laires Prasinophycées Labyrinthulobiontes RHIZARIA Oobiontes Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa AMOEBOBIONTES Cryptobiontes Euglé-noïdes Unichontes Microsporidies Eugléno-biontes Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Diplo-monadines Retorta-mona-dines Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes OPISTHOCHONTES EXCAVATES DISCICRISTATES

Bichontes = les 8 autres règnes Ce que la tradition a nommé ‘algues’ (en vert) et ‘protozoaires’ (en jaune) En bleu : taxons revendiqués par les ‘botanistes’ et les ‘zoologistes’ D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010) Bichontes = les 8 autres règnes ARCHAEPLASTIDIA (= PLANTAE) Euglyphides Embryo-biontes Chlorarach-niobiontes Rhodo-biontes Dinobiontes Streptobiontes Glauco-cysto-biontes Cercobiontes ALVÉOLÉS Charo-phycées Phytomyxea Ellobiopsidés Haplo-sporidies Apicomplexes Viridiplantae Ciliés Chloro-phycées Forami-nifères Centro-helida STRAMÉNOPILES Chlorobiontes Retaria Actinophryda Chromalvéolés Radio-laires Prasinophycées Labyrinthulobiontes RHIZARIA Oobiontes Chromobiontes Mycétobiontes Archamaeba Haptobiontes Lobosa AMOEBOBIONTES Cryptobiontes Euglé-noïdes Unichontes Microsporidies Eugléno-biontes Para-basalia Kinéto-plastides Fungi Choanoflagellés Diplo-monadines Retorta-mona-dines Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Oxymo-nadines Métazoaires (= animaux) Percolobiontes OPISTHOCHONTES EXCAVATES DISCICRISTATES