LE B. A. BA de la bactériologie : Qu’est ce que la bactériologie? Dr O. BELLON Centre hospitalier du pays d’Aix septembre 2011

Les micro-organismes Microbiologie : étude des micro-organismes Bactériologie : étude des bactéries Virologie, mycologie, parasitologie…… Centré sur la bactériologie mais aussi sur les autres micro-organismes…

Définitions générales Êtres vivants Petite taille Microscopes Ubiquitaires Animaux environnement Limitation du cours Bactéries Virus champignons

Les bactéries Besoins culturaux Classifications Eau Aliments Chaleur Atmosphère Classifications

Les bactéries Atmosphère Aérobies Anaérobies Microaérophiles Besoin d’oxygène Anaérobies Oxygène toxique Microaérophiles Mettre des exemples de bactéries aérobies et anaérobies avec les pathologies correspondantes ….

Les bactéries Température Explication Mésophiles Cryophiles (froid) Thermophiles (chaleur) Explication Des pathologies observées Des modes de dissémination (Yersinia, Legionella) Des modes de contamination (Listeria)

Les bactéries Nourriture Eau Nécessaires à la croissance Cystéine et légionelle Favorable à la croissance Glucose : assez mais pas trop…… Eau

Les bactéries Structure UNICELLULAIRE procaryotes Microscope optique Cytoplasme Entouré d’une membrane cytoplasmique Protégé par la paroi : support de l’affinité tinctoriale (gram) Contenant Chromosome circulaire : noyau sans membrane nucléaire Plasmides Éléments figurés Éléments inconstants Capsule Spore flagelles Après cette dia mettre un schéma de bactérie

Coloration de Gram : BGN

Coloration de ZIELH

Les bactéries Structure La capsule Facteur de virulence Protection contre la phagocytose Support antigénique Pneumocoque

Eléments facultatifs : capsule

Les bactéries Structure La spore Forme de résistance Chaleur Pression Rayonnements Produits chimiques : alcool entre autre Pas à l’eau de Javel Sporulation lors de conditions défavorables Germination lors de conditions favorables Clostridium : gangrène, C. difficile

Eléments facultatifs : spore

Les bactéries Structure Les flagelles Les pili sexuels Support de la mobilité Support antigènique Les pili sexuels Conjugaison Recombinants génétiques

Eléments facultatifs : flagelles

Les bactéries Culture Étuves Milieux de culture Atmosphère Multiplication E.coli : rapide B.K. : lent

Les virus Unicellulaires ACARYOTES Parasites stricts Un seul acide nucléique en général Structure particulaire spécifique Ultrafiltrables Microscope électronique

Les virus Parasites stricts reproduction à partir de son matériel génétique détournement du système de la cellule parasitée Réplication Ne pousse pas sur les milieux habituels de la bactériologie

Les virus Stucture un seul acide nucléique protégé dans une capside ou ADN ou ARN protégé dans une capside support de la classification morphologique cubique hélicoidale double

Virus : cubique

Virus : helicoidal

Virus : mixte (bactériophage)

Les champignons Entre le règne végétal et le règne animal Mycètes Eucaryotes Uni ou pluricellulaires Présence de bétaglucanes et chitine Paroi constituée d’ergostérol Deux grands groupes Levures Champignons filamenteux

candida

Champignons filamenteux

Caractéristiques des MO Entérobactéries : BGN du tube digestif Enterobacter : un des genres parmi les entérobactéries Entérocoque : CGP du tube digestif. Staphylocoque : aspect en grappe de raisin, h stafulh Colibacille : le bacille du colon Méningocoque : responsable de méningites…. Vibrion : BGN en virgule

Modes de vie des MO Commensaux : vis en commun sans produire de maladie Pathogènes Entraînent une maladie Nécessite des conditions particulières pour exprimer la pathogénicité Notions de flores

Ce qu’on vient de voir Les bactéries: Leur morphologie Leur anatomie Bacilles Coques Gram zielh Leur anatomie À partir de là j’ai ajouté des dia de « révisions »…. À voir, si on les valide, je m’arrangerai pour les mettre sous format Word dans les présentations papier

Mise en évidence des MO Les voir : diagnostic direct Examen direct Culture Antigènes solubles Biologie moléculaire Voir les réactions spécifiques de l’organisme : diagnostic indirect Recherche d’anticorps Attention cette intervention se fait le 2° jour dans la rubrique « On ne trouve que ce que l’on cherche »

Informations données par l’examen direct

Mise en évidence des MO Examen direct Rapide Préciser ce que l’on cherche : colorations spéciales Germe mort ou vivant…… Nécessite un nombre important de germe présent……

Mise en évidence des MO Culture Milieux spécifiques Atmosphères spécifiques Le germe DOIT être VIVANT à l’ensemmencement

Mise en évidence des MO

Mise en évidence des MO Recherche d’antigènes solubles de fragments de bactéries - par des méthodes immunologiques - pour certaines bactéries À demander spécifiquement

Mise en évidence des MO Nouvelles techniques de biologie moléculaire PCR……. PCR spécifiques Attention aux inhibiteurs +++++ Prix…….

Mise en évidence des MO Typages Sérotypages Biologie moléculaire pour certaines bactéries seulement Pyocyanique Salmonelle Carte d’identité complète Biologie moléculaire Étude de fragments Séquençage

Mise en évidence des MO Sérologie Mise en évidence des anticorps Préciser lesquels +++++ Attention à la cinétique de production Latence (légionelles) Taux Différentes classes d’immunoglobulines IGM IGG…

Mise en évidence des MO Attention Demander spécifiquement ce que l’on veut Prescription médicale Obligatoire Précise Concise Centrée sur la clinique Respectant la chronologie de l’infection et de son évolution Bien prélever et bien transporter

Intérêt pour les hygiénistes Connaître les conditions favorables de développement et de multiplication des germes Comprendre Les noms, les examens, les diagnostics, les délais nécessaires etc… Pour pouvoir discuter avec les autres membres de l’équipe de soin.