Thermodynamique statistique biomoléculaire GBM2620

Slides:



Advertisements
Présentations similaires
Thermodynamique Renseignements pratiques ( ):
Advertisements

Bernard Rousseau Laboratoire de Chimie Physique
Fonctions de partition
Fonctions d’états thermodynamiques
Mécanique Statistique
Interaction purement mécanique entre systèmes macroscopiques Vu : ? paramètre externe Considérons un seul paramètre externe pour simplifier Nombre détats.
La thermodynamique statistique
Thermodynamique Renseignements pratiques ( ):
CHAPITRE 16 TRANSFERTS MACROSCOPIQUES D’ÉNERGIE
Le second principe de la thermodynamique
Les lois de la thermodynamique Principe zéro de la thermodynamique:
2nd PRINCIPE – Bilan Entropique

Electrolytes Fonction de distribution radiale Energies de solvatation-Cycle de Born Haber Modèle de solvatation de Born Interactions ion-ion - Modèle de.
COURS DE THERMODYNAMIQUE (Module En 21) 26/11/20161Cours de thermodynamique M.Bouguechal En 21.
PRINCIPE DU MOTEUR. FONCTION D’USAGE Un moteur thermique transforme l’énergie chimique d’un carburant en énergie calorifique puis en énergie mécanique.
Thème 2 – L’électricité dans un circuit
Cours d’Econométrie de la Finance (Stat des choix de portf. IV 1-2)
Thème 3 – La résistance au mouvement des charges
Transfert d’énergie Mirek Kubera, 2013.
Analyse, Classification,Indexation des Données ACID
Chapitre 20 Et si nous réfléchissions ….

Thermodynamique statistique biomoléculaire GBM2620
Deuxième partie : La courbe d’indifférence

Détermination des propriétés texturales d’un solide poreux par traçage
Lois de comportement A tout système de forces extérieures appliquées à un corps, correspond une distribution des contraintes à l’intérieur de ce corps.
Loi Normale (Laplace-Gauss)
2 La phonétique physique
7.1 Transformation linéaire
VI Graphes probabilistes
Stage de Pré-rentrée de Paris VI
Sciences 8 Unité 3 Les fluides.
Présentation de l'objectif
Microphysique des nuages : la nucléation
Chapitre 2: Les équations et les inéquations polynômes
Effet de l’adsorption d’amphiphiles sur la tension interfaciale
LES PRINCIPES DE LA THERMODYNAMIQUE
Scénario Quatre hipsters entrent en collision un dans l'autre dans un ascenseur plein de personnes. En conséquence ils laissent tomber leurs téléphones.
Interactions de la lumière avec la matière
Variance Optimisation d’un procédé chimique
Chapitre 5 : La théorie particulaire de la matière
Les Energies renouvelables
THERMODYNAMIQUE. 1. Premier principe thermodynamique 1.1. Définition Système Un Système est une partie de l’univers constitué par des éléments.
2 La phonétique physique
Statistiques. Moyenne, Moyenne pondérée, Tableur et graphiques.
La Théorie cinétique moléculaire et les changements d’état
GESTION DE PORTEFEUILLE chapitre n° 4 C. Bruneau Rationalisation des choix: référence à l’utilité.
1 INTRODUCTION. 1.Constitution : Placer les principaux éléments du circuit électrique en face de leur définition.  Elément permettant la liaison électrique.
INTRODUCTION A LA SPECTROSCOPIE
La matière et l’énergie
10 COURS DE thermodynamique (Module En 21) 23/11/2018
2.4 La loi de vitesse d’une réaction chimique
Cours de thermodynamique M.Bouguechal Ph 21
Sciences 8 Unité 3 Les fluides.
LES TRANFORMATIONS D’ÉNERGIE
Lionel GRILLETLycée B FRANKLIN DynamiqueDynamique Terminale Si.
Les réactions nucléaires
Application des équations primitives à l’écoulement turbulent
La matière et l’énergie (Énergie: thermique, lumière et son)
Chapitre 15 : Les transformations de la matière (aspect énergétique)
Chapitre 5 : Thermochimie 1
Thème : 5 Questions flash autour des probabilités
GEOMETRIE VECTORIELLE
Ascension adiabatique
1 Théorie générale des systèmes Présenté Par Monsieur Nzukam Nguiffo Guillaume Ingénieur statisticien.
III. PRESSION ET STATIQUE DE FLUIDE
Couche limite atmosphérique
Cours de thermodynamique M.Bouguechal Phv 211
Transcription de la présentation:

Thermodynamique statistique biomoléculaire GBM2620 Automne 2018 Chapitre 10 de Molecular Driving Forces 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Chapitre 10 : La distribution de Boltzmann et l’ensemble Canonique L’ensemble = tous les états microscopiques possibles qui sont compatibles avec les contraintes externes (ou paramètres définis). Ensemble microcanonique = système isolé avec U,V,N définis U,V,N Config #2 ISOLÉ Config #1 Config #3 Config #4 Config #5 Config #6 Config #7 Config #8 Config #9 Le Système Son ensemble microcanonique 2019-07-24 2019-07-24 etc.

Ensemble microcanonique Le lien entre les états microscopiques et les propriétés macroscopiques est via l’entropie et distribution de probabilité : Avec l’équation fondamentale générale nous trouvons l’équation d’état du système avec Exemple 7.1 : Le modèle de réseau pour un gaz idéal 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Ensemble canonique Tous les états microscopiques possibles qui sont compatibles avec la température de l’ensemble définie plutôt que l’énergie interne (équivalent à fixer énergie moyenne) Ensemble canonique = système clos avec T,V,N définis CLOS T,V,N E1,V,N Config #1 E2,V,N Config #2 E3,V,N Config #3 E4,V,N Config #4 E5,V,N Config #5 E6,V,N Config #6 E7,V,N Config #7 E8,V,N Config #8 E9,V,N Config #9 Le Système Son ensemble canonique etc. 2019-07-24 2019-07-24

Ensemble canonique Nous allons montrer que le lien entre les états microscopiques et les propriétés macroscopiques pour l’ensemble canonique se fait via l’énergie libre de Helmholtz et la fonction de partition Avec l’équation fondamentale générale nous pouvons trouver l’équation d’état du système avec 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Ensemble canonique Le système est composé de particules identiques Le système a états d’énergie accessibles La probabilité que le système soit dans l’état est Avec constante le système est dans un bain de chaleur et nous devons minimiser Helmholtz (ch. 8) 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Ensemble canonique L’entropie est (déf. en fonction des probabiltés, ch. 5) L’énergie interne U est (notons que sont constants) Principe fondamental de la mécanique quantique: Ej n’est pas fonction de T ou S (seulement pj l’est) Q: En utilisant la 1ère loi, à quoi correspondent ? 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Ensemble canonique Nous devons minimiser F Sujet à la contrainte Avec le multiplicateur de Lagrange Et le terme entre parenthèse doit être nul La distribution de Boltzmann 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Ensemble canonique La contrainte nous donne la constante Le dénominateur est très spécial : La fonction de partition Q: est-ce que les particules ont une préférence intrinsèque pour les niveaux d’énergie faible? 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Ensemble canonique Avec la définition d’entropie Alors nous avons trouvé L’énergie libre de Helmholtz est 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Exemples Pression atmosphérique Température Pression 2019-07-24 Marc Lavertu

La fonction de partition La fonction de partition (où l’on définit ) est la somme des facteurs Boltzmann de chaque état microscopique, et représente les « états effectivement accessibles » La limite à faible énergie ou haute température Tous les états sont équiprobables et « accessibles » et nous retrouvons l’ensemble microcanonique 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

La fonction de partition La fonction de partition (où l’on définit ) La limite à haute énergie ou faible température Seulement l’état fondamental est occupé et « eff. accessible » Le rapport de l’énergie de l’état à l’énergie thermique détermine la partition de probabilité parmi les états 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

La fonction de partition Les états à faible énergie sont plus occupés que haute énergie Les états à haute énergie deviennent occupés à haute température 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

La densité d’états La fonction de partition peut être sommée sur les états d’énergie plutôt que sur les microétats en tenant compte de la multiplicité (# microétats) associé avec chaque énergie Exemple : Un polymère composé de 4 monomères en deux dimensions possède 1 état avec une interaction attractive entre deux monomères et 4 états sans cette interaction La fonction de partition 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

La densité d’états La fonction de partition peut être trouvée avec une somme sur les microétats ou avec une somme sur les niveaux d’énergie en tenant compte du nombre de microétats à Notons que la fonction de partition est alors la transformée de Laplace de la multiplicité (la densité d’état) Les deux approches sont équivalentes, on choisit ce qui est le plus pratique pour le calcul de Q 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Factorisation de la fonction de partition Supposons 2 particules discernables (ex. cristal) A et B avec des niveaux d’énergie accessible et Leur fonctions de partition considérées séparément sont Si on considère le système composé de A + B La fonction de partition d’un système composé des sous- systèmes indépendants (non-couplés) est le produit des fonctions de partition de ces sous-systèmes 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Factorisation de la fonction de partition Exemple de 2 particules et 2 niveaux d’énergies : Pour le système composé de A + B 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Factorisation de la fonction de partition: particules indiscernables Si les 2 particules sont indiscernables, la multiplication des fonctions de partition ne fonctionne pas: Pourquoi? De façon générale pour N particules identiques : indiscernables discernables même état si A=B 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Énergie interne obtenue de la fonction de partition Avec la définition on a et l’énergie interne est Notons Alors Q: Comment obtenir U autrement? 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Énergie par particule Si on a N particules discernables et l’énergie moyenne par particule est Énergie par particule est reliée à q comme U est reliée à Q et 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Résumé des calculs dans l’ensemble canonique Factoriser le système dans sous-systèmes indépendants Calcul de q de chaque sous-système « i » Système total: Avec N particules identiques si discernables ou si indiscernables Avec Q vous avez tout : 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Exemple : Modèle Schottky d’un système avec 2 états N particules discernables où chacune a 2 états possibles, un état fondamental avec et un état excité avec 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Exemple : Modèle Schottky d’un système avec 2 états Q: problème avec un de ces graphiques ? 2019-07-24 2019-07-24 Marc Lavertu

Canonique vs microcanonique Équivalence de l’ensemble canonique et microcanonique quand Exemple du Modèle de Schottky dans l’ensemble microcanonique Q: Pourquoi utiliser canonique plutôt que microcanonique si équivalent? 2019-07-24 2019-07-24