Réseaux géniques et métaboliques : vers des modèles intégrés Réunion du groupe de travail « Analyse dynamique de réseaux de régulation biologiques » Grenoble, 6-7 mai 2004
2 Modèles des fonctions cellulaires vLes biologistes distinguent plusieurs fonctions cellulaires, avec des bases moléculaires différentes Type dinteractions moléculaires, échelle de temps, nombre de molécules vDifférents types de modèles pour différentes fonctions cellulaires Metabolisme Régulation génique Réplication et réparation de lADN Transduction des signaux Mobilité Cellule
3 Modèles intégrés de la cellule vFonctions cellulaires sont étroitement couplées en réalité vVue globale de la cellule demande des modèles intégrés : « cellules virtuelles » Premier pas : modèles intégrés des réseaux géniques et métaboliques Metabolisme Régulation génique Réplication et réparation de lADN Transduction des signaux Mobilité Cellule
4 Modèles intégrés : débuts vImportance des modèles intégrés est réalisée dès les débuts de la biologie moléculaire Modèle de Goodwin (1963) de lauto-inhibition dun gène vThèmes encore pertinents aujourdhui : l Intégration de différents types dinteractions moléculaires l Hiérarchies temporelles E F E G G R R F R R e 2 m 2 e. m 1 1 m e 2 F R R M
5 Modèles intégrés : lère post-génomique vDisponibilité des outils expérimentaux à haut débit a changé le contexte des modèles intégrés vEmergence de nouveaux thèmes : l Echelle génomique : réseaux complexes de grand taille l Outils informatiques danalyse et de simulation l Couplage entre modélisation et expérimentation
6 Programme v14h15-15h15 : Athel Cornish-Bowden (CNRS, Marseille) Analyse stochiométrique du métabolisme : un outil puissant pour le dessin des médicaments v15h45-16h45 : Jean-Philippe Vert (Ecole des Mines, Paris) Analyse et reconstruction de voies métaboliques v16h45-17h45 : Julien Gagneur (CellZome, Heidelberg) Étudier le métabolisme à léquilibre : une approche par contraintes