Widespread occurrence and genetic diversity of marine parasitoids belonging to Syndiniales (Alveolata) L. Guillou, M. Viprey, A. Chambouvet, R. M. Welsh, A. R. Kirkham, R. Massana, D. J. Scanlan and A. Z. Worden Abondance et diversité génétique des parasitoïdes marins appartenant aux Syndiniales (Alveolés) Baffreau Alexandrine Couet Pauline M1 Océanographie BEM
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Les objectifs des auteurs Améliorer la phylogénie des Alvéolés via les nouvelles séquences ARNr 18S et réaliser la phylogénie précise des groupes I et II des Syndiniales Comparer la diversité génétique obtenue aux connaissances actuelles sur la taxonomie des Syndiniales Elargir les milieux d’habitats des Dinoflagellés à travers leur séquences dans les banques de gènes Extraire des informations générales sur l’écologie de certains membres des Syndiniales
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Echantillons récoltés : à des saisons différentes issus de milieux avec des conditions environnementales très différentes Profondeur Lumière Disponibilité en nutrients et dioxygène Séquençage Banques de séquences Analyses phylogénétiques : Neighbour-Joining Maximum de vraisemblance Maximum de parcimonie Test Bootstrap
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Groupes externes Ciliés Colpodellidae Apicomplexes AY665063 SCM38 C14, AF133909 Parvilucifera Groupe I Perkinsea Groupe V Groupe III Groupe II Groupe IV Autres Dinophycées Syndiniales Dinoflagellés Phylogénie des Dinobiontes parmi les Alvéolés
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Clade 7 Clade 4 Clade 8 Clade 6 Clade 3 Clade 2 Clade 5 Clade 1 HT HT HT HT HT HT HT Phylogénie du groupe I des Syndiniales
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Clade 8 Clade 23 Singleton Clade 12 Clade 24 Clade 19 Clade 32 Clade 28 Clade 38 Clade 44 Clade 13 HT Proche de 10+11 ? Clade 10+11 Clade 9 Clade 37 Singleton Clade 18 Clade 34 Clade 14 Clade 21 Clade 31 Clade 15 Clade 22 HT HT HT HT HT Clade 26 Clade 30 Clade 17 Singleton Clade 16 HT Phylogénie du groupe II des Syndiniales
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Amoebophrya Clade 5 Clade 25 Clade 39 Clade 42 Clade 3 Clade 2 Clade 33 Clade 4 Clade 1 Clade 41 Clade 7 Clade 29 Clade 43 Singleton Clade 40 Clade 36 Clade 27 Clade 20 Clade 35 Clade 6 Phylogénie du groupe II des Syndiniales
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Guillou & al (2008) : 8 clades du groupe II 1, 2, 3, 4, 5, 25, 33, 39, 41 et 42 Kim & al (2008) : 9 sous-groupes Clade 1 + une séquence du clade 25 Biaisée par une séquence chimère Clade 4 Clade 3 Clade 5 Clade 2 Clade 33 Chimère probable Sous-groupe 1 Sous-groupe 2 Sous-groupe 3 Sous-groupe 4 Sous-groupe 5 Sous-groupe 6 Sous-groupe 7 Sous-groupe 9 Sous-groupe 8
Diversité des habitats des Syndiniales Origine des séquences Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Diversité des habitats des Syndiniales Origine des séquences Séquences des Dinoflagellés Groupe I Syndiniales Groupe II Syndiniales Milieux continentaux 0,6 % 0 % Milieux marins 29,8 % 23,9 % 50,1 % Plancton de la colonne d'eau 33,2 % 51,5 % Sediments 8,6 % 38,8 % 12,9 %
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Clades présents sur toute la colonne d’eau Clades spécialistes d’un milieu
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Mode de vie des Syndiniales : exemple d’Amoebophrya
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Montagnes 2008, modifié
Résultats et discussion Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Saldarriaga 2003, modifié 60 90 75 Heterocapsa triquetra DINOFLAGELLES 100 Oxyrrhis marina OXYRRHIS 100 99 Perkinsus marinus PERKINSUS 83 87 93 Plasmodium falciparum 94 100 99 Toxoplasma gondii APICOMPLEXES Cryptosporidium parvum 100 Paramecium caudatum Tetrahymena thermophila CILIES Stylonychia lemnae 0,1
Noctiluca scintillans, près de Cape Rodney, Hauraki Gulf, Introduction Matériel et méthodes Résultats et discussion Autres études Conclusion Bloom à Noctiluca scintillans, près de Cape Rodney, Hauraki Gulf, Nouvelle-Zélande
Bibliographie Chambouvet A, Guillou L (2009) Les Amoebophrya, parasitoïdes de dinoflagellés toxiques. Consulté sur http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/index.php?option=com_content&task=view&id =82&Itemid=136#Pub2009 en novembre 2010 Guillou L, Viprey M, Chambouvet A, Welsh RM, Kirkham AR, Massana R, Scanlan DJ, Worden AZ (2008) Widespread occurrence and genetic diversity of marine parasitoids belonging to Syndiniales (Alveolata). Environ Microbiol 10: 3349-3365 Kim, S., Park, M.G., Kim, K.-Y., Kim, C.-H., Yih, W., Park, J.S., and Coats, D.W. (2008) Genetic diversity of parasitic dinoflagellates in the genus Amoebophrya and its relationship to parasite biology and biogeography. J Eukaryot Microbiol 55: 1–8 Montagnes DJS, Chambouvet A, Guillou L, Fenton A (2008) Responsibility of microzooplankton and parasite pressure for the demise of toxic dinoflagellate blooms. Aquat Microb Ecol 53: 211-225 Saldarriaga, J.F., McEwan, M.L., Fast, N.M., Taylor, F.J.R., and Keeling, P.J. (2003) Multiple protein phylogenies show that Oxyrrhis marina and Perkinsus marinus are early branches of the dinoflagellate lineage. Int J Syst Evol Microbiol 53: 355–365. Images : Diapositive de présentation : http://www.smhi.se/oceanografi/oce_info_data/plankton_checklist/dinoflagellates/amoebophrya_ceratii.gif Diapositive de conclusion : http://citoyen.onf.ca/blogs/wp-content/uploads/2008/08/red_tide_generav3.jpg
Merci de votre attention ! Amoebophrya ceratii