MCM 2006/07 LITTERATURE BIOMEDICALE STRATEGIES DE RECHERCHE Bibliothèque IMT, novembre 2006

Sujets principaux La littérature biomedicale Bases de données bibliographiques Revues électroniques (texte intégral) Liens entre bases de données (notices) et le texte intégral (articles)

Partie 1: La littérature biomédicale Résultat de la recherche biomédicale (‘publication’ + ‘archive’) Source de la recherche biomédicale future

Littérature primaire Articles (revues) Etudes spécifiques Plus à jour Repertoriés dans des bases de données Distribution dans les bibliothèques ou sur internet Livres (+ littérature ‘grise’) Portée plus large Moins à jour Repertoriés de façon plutôt limitée Plus difficiles à localiser dans les bibliothèques ou sur internet

Revues médicales générales Annals of Internal Medicine BMJ – British Medical Journal JAMA – Journal of the American Medical Association Lancet [tiers monde!] NEJM – New England Journal of Medicine Presse Médicale

Revues spécialisées AIDS Journal of Infectious diseases Lancet Infectious Diseases Médecine et Maladies Infectieuses Médecine Tropicale Tropical Medicine & International Health [IMT!]

Partie 2: les bases de données bibliographiques (‘littérature secondaire’)

Bases de données ‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui représentent des publications / champs: auteur, titre, revue, année de publication, … Contenu: couvrent des domaines et des resources nettement définis (p.ex. maladies endémiques; une collection locale ou (inter)nationale de livres ou revues) Pour optimaliser la recherche:  mots-clés (p.ex. thésaurus = mots-clés controllés + organisation hiérarchique)  index(es) alphabétiques  Résumé (‘abstract’)

Quelques exemples ITG Book and Document Holdings ITG Student Dissertations Tropical Endemic Diseases Control Health Care in Developing Countries Voir: ‘

Notices bibliographiques Affichage: sélection limitée de champs vs. ‘complete record’ Liens vers le texte intégral Marquer Imprimer: sélection de notices et de champs Sauvegarder: idem + location

(a): Chercher un document spécifique But: limiter rapidement les options Déterminez les éléments les plus spécifiques Cherchez dans les champs pertinents Utilisez les indexes alphabétiques pour vérifier l’épellation

(b): Littérature sur un sujet Choisissez une base de données appropriée Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels Identifiez des mots-clés ou des descripteurs anglais correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index Determinez la relation logique entre les différents mots-clés; combinez les avec les opérateurs booléens: AND, OR, NOT Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de publication, type de publication, disponibilité)

Remarques pratiques Commencez avec l’essentiel, continuez en étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés très complexes Pensez aux synonymes, faites attention à l’orthographe Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats N’utilisez que l’anglais, même si vous ne cherchez que des documents en français Attention: utilisation de « not », peut jeter le pertinent ensemble avec l’inutile

Exercises Cherchez de la littérature récente ( ) sur les sujets suivants: Contrôle vecteur de dengue Contrôle du tuberculose en Afrique utilisant la méthode DOTS L’éradication du ver de Guinée Flambées récentes de poliomyélite Mortalité maternelle en Asie

Bases de données IMT – charactéristiques Produites par la bibliothèque IMT Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices Sujets et collections pertinents Orientation tiers monde Toutes sortes de publications Mots-clés libres; thésaurus manque Disponibilité garanti: texte intégral à la bibliothèque IMT + liens vers l’édition électronique

Bases de données internationales Avantages Couverture large Volume Système de mots- clés bien structuré Mises-à-jour rapides Désavantages Uniquement des articles Biais USA/UK/Europe Sous-representation d’autres continents Aucune relation avec la collection de l’IMT

Medline / PubMed Base de de données bibliographique la principale des sciences biomédicales présent (>16,000,000 notices) Thésaurus: 20,000 mots-clés ‘MeSH’ Articles (livres et chapitres non-inclus!) Biais fort anglophone Sous-représentation des revues locales + tiers-monde Aucune relation avec la collection de l’IMT Logiciels: PubMed, NLM Gateway, WinSpirs, WebSpirs…

Notices PubMed Options d’affichage Liens vers le texte intégral Marquer Thésaurus ‘MeSH’ ‘Journal database’ ‘Single citation search’ Options pour imprimer ou sauvegarder une sélection de notices

Autres exemples Global Health (CABI) Embase Biosis Popline Lilacs [Amérique latine] African Index Medicus Voir: ‘

Autres genres de bases de données ‘Current awareness’ services:  Current Contents [ISI => Thomson Scientific] ‘Citation’ databases:  ISI Web of Science + Journal Citation Reports  Google Scholar ‘Knowledgebases’:  Cochrane Library  Clinical Evidence

Google Scholar Combine des charactéristiques d’un moteur de recherche avec une base de données bibliographique Cherche la littérature scientifique, non des sites web ‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique ‘Citation linking’ (dans un univers limité) Liens vers le texte intégral (à condition que vous avez le droit d’accès) Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection inconnus?

Partie 3: disponibilité des documents intégrals? Digital, sur l’internet? Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques La majorité des revues offrent une édition digitale intégrale à partir de leur site web, mais ceci n’est pas le cas pour chaque revue! Couverture généralement limitée (p.ex dernières années) Politiques d’accès différentes:  Disponible pour tous (avec ou sans embargo)  Disponible pour les abonnés  Edition électronique à cout supplémentaire  ‘Electronic only’

Listes de revues électroniques ‘ (IMT) Liste alternative: ‘A to Z’ (IMT) Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com, HighWire Press Free Online Full-text Articles, FreeFullText.com, …

Initiatives ‘Open access’ HINARI – Health Internetwork: conditions d’accès spéciales pour le tiers monde. PubMed Central: accès gratuit après 6 mois. BMC - BioMed Central: série de nouvelles revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer reviewed’, paiement d’auteurs). PLoS - Public Library of Science: idem, e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine,..., PLoS Clinical Trials

… (suite) SPARC – Scholarly Publishing & Academic Resources Coalition: nouvelles alternatives pour certaines revues à prix élevé. SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME). OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving, using universal interconnectivity protocols’. Voir p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University) Voir: ‘ parties 2 & 3http://lib.itg.be/journals.htm

Publications électroniques en texte intégral Human Development Report (UNDP) Humanity Library Online (Human Info) World Development Report (World Bank) World Health Report (WHO) … Voir: ‘

Liens entre notices bibliographiques et articles Au niveau de la revue:  Local holdings: lien vers la liste des revues électroniques Au niveau de l’article:  Champ ‘NT’ (clickable)  PubMed links

Comment trouver des documents dans la bibliothèque IMT? 1. Articles de revues  Vérifier si la revue est disponible à la bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)  Copier ou imprimer les notices  Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !  Les revues sont rangées par ordre alphabétique  Numéros récents: 4 e étage  Numéros anciens (reliés): 3 e étage

2. Livres  Copier ou imprimer les notices  Les champs ‘Code’ (‘CD’), ‘Publication year (‘PY’) et Number (‘NR’) sont essentiels!  Les livres sont rangés par sujet (= ‘CD’) 3. Dissertations IMT  Consultez les listes imprimées ou la base de données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)  Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro correcte  A demander au comptoir en utilisant le régistre

4. Littérature grise  Chercher dans la base de données ‘ITG Books and Document Holdings’  Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour identification correcte  Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des notices pour des directions spécifiques 5. Statistiques, etc.  Consulter les rapports dans la section ‘Reference’, à côté des ordinateurs

Codes d’utilisateur IMT Pour avoir accès à certaines bases de données ou revues électroniques: User Name: itguser Password: itguser Codes spécifiques: voir > Bibliotheek > Journal Access Codes