Etude de cas en imagerie médicale 3D Segmentation et extraction de caractéristiques géométriques de colonnes vertébrales à partir d’images scanner et SPECT
Le contexte Sujet proposé par le Dr. J.M. Rocchisani, Hôpital Avicenne de Bobigny Encadrement: J.M. Rocchisani Conseillers: M. Couprie, L. Najman Environnement logiciel: Bibliothèque de traitement d’images (A2SI) Programmation en C ou C++ IHM: TCL/TK Visualisation 3D: VTK
La scoliose La scoliose est une déformation de la colonne vertébrale entraînant une torsion du rachis (colonne vertébrale) et une déformation du thorax, de l'abdomen et des zones paravertébrales (proches du rachis). Elle est plus souvent idiopathique (sans cause connue) mais elle peut compliquer des affections invalidantes (neurologiques ou neuro-musculaires) risquant d'aggraver le handicap. Il existe des possibilités de traitements (kinésithérapie, appareillage, chirurgie) de plus en plus efficaces, mais contraignantes et provoquant des limitations fontionnelles de la colonne vertébrale (chirurgie). Le dépistage qui permet un traitement précoce est essentiel. Dr Jean-Michel Bruandet, CRRF Marc Sautelet, Villeneuce d'Ascq
Illustrations
Mesures: exemple Angle de Coob
Les données: exemple
Objectifs Conception d’une méthode pour segmenter des images 3D du rachis (scanner, spect) Extraction d’un axe médian ‘robuste’ à partir de cette segmentation Extraction de mesures géométriques Visualisation assistée (coupes perpendiculaires à l’axe du rachis)
Connaissances mises en oeuvre Morphologie mathématique Notions métriques discrètes (axe médian, cartes de distance) Notions topologiques discrètes (squelette, point simple) Géométrie 3D Algorithmique Programmation en environnement graphique