Cartographie génomes entiers

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Transcription de la présentation:

Cartographie génomes entiers Page 24 1980, David Botstein Variations de l’ADN (PTFR) → point de départ pour cartographier en détails l’ensemble du génome humain 1990: lancement du projet Génome Humain Buts: Cartographier tout le génome Déterminer la séquence nucléotidique de tous les chromosomes

Projet Génome Humain 3 étapes Page 24 3 étapes La cartographie génétique (marqueurs génétiques) La cartographie physique (distances entre les marqueurs / nucléotides) Le séquençage de l’ADN

Projet Génome Humain Cartographier le génome d’autres espèces: 2004 / 2007 Page 24 Cartographier le génome d’autres espèces: Saccharomyces cerevisiae (une levure) E.Coli et d’autres procaryotes Caenorhabditis elegans (un Nématode ou Ver rond) Drosophila melanogaster (la Mouche du vinaigre) Mus musculus (la Souris commune) 1996 1997 1998 2000 2002

Séquençage d’ADN = séquence nucléotidique complète Technique utilisée: Page 25 = séquence nucléotidique complète Technique utilisée: Clonage de fragments d’ADN Marquage d’ADN Synthèse d’ADN (nucléotides particuliers) Electrophorèse sur gel Méthode de Sanger

Méthode de Sanger Grand nombre de copies d’un fragment d’ADN purifié Page 25 Grand nombre de copies d’un fragment d’ADN purifié

Méthode de Sanger (étape n°1) Page 25

Méthode de Sanger (étape n°2) Page 25

Méthode de Sanger (étape n°3) Page 25

Méthode de Sanger (étape n°4) Page 25

Consortium public (méthode) Page 26

Autres stratégies de séquençage Page 26 1992, J. Craig Venter

Indices fournis par les séquences du génome Page 27 La génomique (étude des génomes – séquence ADN) → réponses aux questions sur: La structure des génomes La régulation de l’expression génique Le développement et la croissance L’évolution

Intérêt des biotechs… Pages 27 - 31 Etudier les gènes directement sans déduire un génotype à partir d’un phénotype Le problème est inversé… Il faut maintenant déduire le phénotype à partir d’un génotype Comment peut-on reconnaître les gènes et déterminer leur fonction en partant d’une longue séquence d’ADN ?

Analyse des séquences d’ADN Page 28

Etude l’expression génique Page 29

Etude l’expression génique Page 29 Etape n°1

Etude l’expression génique Page 29 Etape n°2

Etude l’expression génique Page 29 Etape n°3

Etude l’expression génique Page 29 Etape n°4

Etude l’expression génique Page 29 Résultat: