Options de recherche de PubMed et revue (Cours de base: Module 6)

Table des matières  Historique  Recherche avancée  Accès au texte intàgraé des articles depuis HINARI/PubMed  Problèmes d’accès aux articles en texte intégral

Before logging into the Partner Publisher services websites, we will Login to the HINARI site using the URL Avant de se connecter sur des sites d’éditeurs partenaires, nous nous connectons à HINARI en utilisant l’URL

Nous allons entrer notre nom d’utilisateur et notre mot de passe dans les champs appropriés, puis cliquer sur le bouton “Connexion”. Pour avoir accès au article en texte intégral, il faut s’enregistrer correctement. Depuis la migration sur un nouveau serveur d’authentification (jan 2014), nous recommandons vivement l’utilisation de Chrome ou de Mozilla. Si vous utilisez Internet Explorer, vous devrez vous identifier deux fois.

Une fois que vous êtes enregistrés sur la page contenu HINARI, accédez à PubMed en cliquant sur Chercher dans HINARI texte intégral.

Historique To access the History option, click on the Advanced Search option.

Nous allons commenter la fonctionnalité History qui permet de consulter l’historique de recherche. Pour accéder à l’historique, il faut passer par la recherche avancée (Advanced Search), de puis la page d’accueil de PubMed ou la page des résultats de recherche. L’historique de recherche est sauvegardé automatiquement mais est effacé après 8 heures et ne conserve qu’un maximum de 100 recherches.

La recherche du terme treatment retourne 8 millions d’articles. Il est possible de voir cette recherche en cliquant sur la page Advanced (History).

Sur la page Advanced Search Builder (History), un numéro de lot est attribué à notre première recherche. Ce numéro est précédé du symbole # - in this dans notre exemple #1. Sur la partie droite de la page, un nombre d’article est indiqué dans la colonne Items found (élements trouvés). Dans ce cas, un total de plus de 8 millions de références. Retournons maintenant sur la page d’accueil de PubMed en cliquant en haut à gauche de l’écran.. Les numéros attribués à vos recherches peuvent varier si vous avez déjà effectué des recherches sur PubMed aujourd’hui.

Nous avons maintenant effectué une deuxième recherche avec le terme malaria et obtenu références. Comme pour les résultats précédents, la recherche sur la malaria est visible en se rendantsur la page Advanced (History).

Nous allons maintenant utiliser la fonction Add pour #1 AND #2 et cliquer sur Search afin d’obtenir les résultats combinés des deux termes recherchés précédement – treatment AND malaria. Nous avons ajouter les deux termes recherchés dans le Builder (constructeur).

Les résultats de la recherche ont été restreints à articles. Cliquez sur le lien Advanced pour retourner à la page Advanced Search (History).

Nous allons maintenant combiner notre dernière recherche (#3) avec le terme géographique Africa en les ajoutant dans les champs du Builder et en cliquant sur Search. Vous pouvez aussi cliquer sur Add pour le lot #3 et ensuite ajouter Africa sur la ligne suivante du constructeur.

La recherche #4 est maintenant treatment AND malaria AND Africa avec un résultat de 8866 références. Ensuite, nous allons afficher le résultat de cette recherche –en affichage Summary– en cliquant sur le nombre de d’éléments trouvés pour le lot #4. Note: Pour effacer ces recherches, cliquer sur le bouton Clear History.

Voici l’affichage Summary pour la recherche combinée #4 search. Nous allons maintenant passer aux diapositives sur la recherche avancée.

We now will use Advanced Search Builder option. Access to Advanced is from the initial PubMed page or the Search Results page. Recherche avancée

Dans l’Advanced Search Builder, nous avons sélectionné l’option All Fields du menu. Il est possible d’ajouter des termes à chercher dans tous les champs ou dans les champs spécifiques, en utilisant les opérateurs booléens AND, OR et NOT.

Ici, nous avons construit une recherche sur les termes tuberculosis et drug resistance dans les champs Text words. Nous avons utilisé l’opérateur booléen AND. Une fois entrés, les termes de recherches sont affichés dans la boîte au dessus du Builder.

Vous pouvez afficher ou cacher la liste des index. Nous afficons la liste initialte des termes de l’index pour tuberculosis. Vous pouvez entrer n’importe lequel de ces termes dans la barre de recherche.

Nous allons maintenant utiliser l’option de recherche des MeSH Terms dans le menu du Builder et insérer le terme developing countries dans la barre de recherche. Nous allons ensuite lancer la recherche en cliquant sur Search.

Les résultats de la recherche tuberculosis AND drug resistance AND developing countries sont 134 références. Pour retourner à la page de recherche avancée, cliquez sur Advanced Search en dessous de la barre de recherche de PubMed. Vous pouvez observer que dans la liste Filter your results, il y a 32 articles en texte intégral et 50 références HINARI.

Nous sommes revenus sur la page de l’Advanced Search Builder Remarquer que l’historique de recherche a été activé et affiche la recherche la plus récente avec le #5. Nous allons afficher le résultat de cette recherche –en affichage Summary– en cliquant sur le nombre de d’éléments trouvés pour le lot #5.

Pour plus d’information sur la recherche avancée, Advanced Search, rendez vous sur la page Search Clinic: Building a PubMed Search. Depuis cette page, vous pourrez visionner une vidéo de 30 minutes qui explique la recherche avancée. Cet enregistrement contient aussi des réponses aux questions fréquentes., you can view a 30 minute clinic recording. Notez que cette vidéo est consacrée à PubMED en général et non à la version HINARI/PubMed.

Nous allons maintenant passer en revue l’accès aux articles en texte intégral avec HINARI/PubMed. Lancez la recherche hypertension AND developing countries.

Les résultats de cette recherche sont affichés au format Summary format et atteignent 1704 références.

Nous allons changer le format au format Abstract et le nombre d’éléments par page à 50 puis cliquer sur Apply.

Depuis l’affichage au format Abstract, les liens vers les éditeurs qui fournissent le texte intégral se situent en base de la notice. Dans la plupart des cas, les deux icônes vous permettrons d’atteindre le texte intégral.

Quand vous arriver à l’article sur la page de l’éditeur, vous pouvez vérifier l’adresse ou l’URL dans la barre du navigateur. Si vous êtes correctement authentifiés, vous verrez un IRL qui comment par : hinarilogin.research4life.org/ Accédez au texte intégral au format HTML ou dans un fichier PDF.

Voici la version texte intégral en PDF de cet article en particulier.

Linking to texte intégral 4 Problèmes d’accès aux articles en texte intégral L’accès HINARI/PubMed au texte intégral des article est basé sur la technologie ‘Link Out’ de PubMed. Ces liens marqués l’icône de l’éditeur ou d’HINARI –au bas de chaque notice. Dans certains cas, ce lien nous vous donne pas accès au texte intégral et vous devez effectuer un ‘diagnostic’.

Les problèmes d’accès peuvent découler de : 1)Échec du LOGIN avec l’identifiant et le mot de passe de votre institution 2)Problèmes techniques sur le site de l’éditeur 3)Problèmes liés à l’environnement de travail local (configuration du pare- feu de l’instituion, configuration du navigateur ) 4)Titres non inclus dans l’offre de l’éditeur Par conséquent, vous voyez peut-être un message sur le site de l’édtieur qui vous bloque l’accès et demande que vous vous connectiez ou que vous payiez pour l’article en question. Note: Vos identifiant et mot de passe HINARI NE vont PAS fonctionner

Pour vérifier que vous avez bien utilisé l’identifiant et le mot de passe correctement, vérifiez que vous le message ‘Connecté à partir de’ s’affiche. Une connexion réussie est également confirmée par l’addresse URL qui s’affiche dans la barre de votre navigateur. Si vous êtes correctement authentifié, vous verrez que l’URL commence par: hinarilogin.research4life.org/...

NOTE: Si vous rencontrez des problèmes quand vous accédez à une revue en texte intégral depuis HINARI/PubMed (et non depuis les liens de la page d’accueil d’HINARI) il y a une étape supplémentaire de vérification. Si vous n’êtes pas en mesure d’accéder à un article de revue à travers l’icône ‘Link Out’ d’HINARI/PubMed, vérifier la disponibilité du titre en parcourant la liste A-Z de la collection de revues et vérifiez également les volumes disponibles par années.

Quand vous observez la liste A-Z de la collection de revues, les cases vertes indiquent si votre institution a accès aux contenus de la revue. Les ! Indiquent que les titres ne sont pas inclus dans l’offre de votre institution. Si l’accès au texte intégral vous est refusé malgré la case verte, suivez les instructions de la diapositive suivante. Les années et volumes disponibles sont notés après le titre de la revue.

Cet exemple est une capture d’écran qui a été attachée au courriel envoyé à Pour un article de JEM, il était indiqué qu’un abonnement est nécessaire. L’éditeur demandait à ce que l’utilisateur s’enregistre avec Sign in (identifiant et mot de passe pour un abonnement individuel) ou d’acheter un accès temporaire (Purchase Short-Term Access). Note: Cette capture d’écran inclus l’URL de la revue. Cette information est inestimable pour les collaborateurs HINARI qui vous aideront à résoudre le problème d’accès. Pour faire une capture d’écran, cliquez sur la touche Print Screen tout en étant sur la page de la revue. key while viewing the webpage of the journal. Ensuite, effectuer un copier-coller (ctrl-c / ctrl-v) dans un document de traitement de texte et envoyer ceci en pièce-jointe de votre courriel.

Vérifiez que vous avez réussi à vous identifier dans HINARI. Si vous êtes certain que le problème ne se situe pas au niveau de l’authentification, contacter les collaborateurs HINARI pour qu’ils puissent contacter l’éditeur afin de régler le problème. Voici un exemple de courriel envoyé par un utilisateur HINARI en Ouganda. Note: Veillez à inclure votre identifiant institutionnel, le nom de la revue concernée et d’autres détails. Joignez également une capture d’écran copiée dans un document.doc ou.ppt, et qui contient l’URL (adresse internet) de la revue, comme vu sur la diapositive précedente.

Cette capture d’écran supplémentaire montre que la revue est bien listée sur la page J de la liste A-Z de la collection de revues, que le numéro recherché est disponible et que, grâce à la case verte, l’institution devrait avoir accès à la revue. Si le système d’authentification HINARI avait fonctionné correctement, l’utilisateur devrait pouvoir accéder à la revue.

C’est la fin du cours de base HINARI module 6 Il existe un manuel qui accompagne cette partie du module pour réaliser une session pratique sur les sujets traités dans ce module. Mis à jour