Réalisation d'un maillage 3D à l'aide de la toolbox Matlab ISO2MESH Frédéric Lange Doctorant CREATIS Equipe 5:RMN et optique, méthodes et systèmes Encadrants.

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1 Réalisation d'un maillage 3D à l'aide de la toolbox Matlab ISO2MESH Frédéric Lange Doctorant CREATIS Equipe 5:RMN et optique, méthodes et systèmes Encadrants : B. MONTCEL, F. PEYRIN 8 juillet 2013

2 I.Contexte II.Iso2Mesh III.Exemple de notre application

3  Imagerie fonctionnelle cérébrale: La Tomographie optique diffuse  Propagation de la lumière dans les tissues : processus complexe.  Besoin d’une modélisation de cette propagation Capacité de détection du système optique Influence des paramètres physiologiques  Modèle Monte Carlo capable de modéliser des géométries complexes en utilisant un maillage 3D.  Nécessité de créer ce maillage. Utilisation de la toolbox matlab iso2mesh.

4 Toolbox matlab disponible gratuitement : http://iso2mesh.sourceforge.net/ cgi-bin/index.cgi http://iso2mesh.sourceforge.net/ cgi-bin/index.cgi Maillage à partir d’image 3d Différents types de fonctions : – Création de maillage Image en niveau de gris Image binaire – Travail sur le maillage Lissage Redimensionnement … – Fusion de maillages – Affichage graphique – Information sur le maillage

5 Objectif : Avoir un modèle de l’anatomie cérébrale le plus fidèle possible Image anatomique IRM (segmenté) (http://brainweb.bic.mni.mcgill.ca/brainweb/)http://brainweb.bic.mni.mcgill.ca/brainweb/ Maillage ?

6 opt.radbound=1000; opt.distbound=100; maxvol=4; isovalues= [0.5,1.5,2.5,3.5,4.5,5.5,6.5,7.5,8.5,9.5,10.5]; [node,elem,face]=v2m(IMAGE3D, isovalues,opt,maxvol,'cgalmesh'); Code

7 Nombre de nœuds: 432096 Nombre de triangles: 1650380 Nombre de tétraèdres: 2607833 Nombre de régions: 11 Temps de génération <5min (core i7, 16GB, Matlab R2012b)

8 Quelques Problèmes : Possible Collision entre 2 types de tissues Maillage des vaisseaux : éléments discontinues

9 Injection dans notre modèle Monte Carlo

10 Merci de votre attention