MeSH Medical Subject Headings Geneviève Botti Hôpital Timone adultes Marseille 2004.

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1 MeSH Medical Subject Headings Geneviève Botti Hôpital Timone adultes Marseille 2004

2 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Qu ’est-ce que c ’est ? n Le « langage » médical –thesaurus de mots clés médicaux –organisés entre eux par des relations n Utilisé par la NLM n Pour la recherche documentaire n Depuis 1954 n Et continuellement mis à jour

3 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 N.L.M. http://www.nlm.nih.gov/

4 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 La recherche documentaire

5 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 La recherche documentaire : MEDLINE n Medical literature analysis and retrieval system (MEDLARS) années 1960 n On line : accès automatisé, modem, net n Base de données bibliographiques n Références de plus de 4200 périodiques

6 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Émetteur Récepteur MeSH : le langage d ’indexation (médiation documentaire) MeSH

7 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Le vocabulaire (1) : descripteurs n 22 568 main headings ou descripteurs Coronary Disease Lung Candida albicans Fresh water Rhinoplasty Hemagglutination …

8 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Descripteurs majeurs et mineurs n Descripteurs majeurs –peuvent être rubriques de l ’Index Medicus –quand ils sont pondérés n Pondération * point essentiel de l ’article n Descripteurs mineurs –ne sont jamais rubriques de l ’Index Medicus

9 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Le vocabulaire (2) : autres termes d ’entrée n 125 000 autres termes d ’entrée Synonymes ou Termes équivalents n Torulopsis glabrata, Entry term pour Candida glabrata n Permet à l ’utilisateur de s ’exprimer avec ses mots : acceptabilité plus grande n Maîtrise du nombre de concepts

10 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Vocabulaire (3) : qualificatifs n 83 Subheadings ou qualificatifs n Viennent préciser le point de vue qu ’on porte sur le descripteur, le champ d ’utilisation Adverse effects EconomicsSecondary Surgery...

11 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Vocabulaire (3) : qualificatifs n Liste de qualificatifs permis par descripteur (Ne sont pas des termes d ’entrée) Coronary disease / SU(surgery) n Rangés en familles Adverses Effects : Poisoning : Toxicity : Toxicity

12 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Mots clés rangés dans 15 arborescences (tree structures) n n Anatomy [A] n n Organisms [B] n n Diseases [C] n n Chemicals and Drugs [D] n n Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment [E] n n Psychiatry and Psychology [F] n n Biological Sciences [G] n n Physical Sciences [H]

13 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Arborescences (suite) n n Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena [I] n n Technology and Food and Beverages [J] n n Humanities [K] n n Information Science [L] n n Persons [M] n n Health Care [N] n n Geographic Locations [Z]

14 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 MeSH tree structure (1) n Cardiovascular Diseases [C14] Heart Diseases [C14.280] Heart Diseases [C14.280] Myocardial Ischemia [C14.280.647] Myocardial Ischemia [C14.280.647] Coronary disease [C14.280.647.250] Angina pectoris + Coronary Aneurysm Coronary Arteriosclerosis...

15 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 MeSH tree structure (2) n Cardiovascular Diseases [C14] Vascular diseases [C14.907] Vascular diseases [C14.907] Ischemia [C14.907.553] Ischemia [C14.907.553] Myocardial Ischemia Myocardial Ischemia Coronary Disease Angina pectoris +...

16 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Polyhiérarchie n Coronary disease est à la fois Maladie du cœur C14.280.647.250et Maladie des vaisseaux C14.907.553.470.250

17 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Intérêt des hiérarchies n Naviguer dans son domaine d ’intérêt pour repérer rapidement les mots-clés pertinents n Rechercher des sous ensembles d ’arbres (un terme et tous les termes plus précis que lui)

18 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Relations entre descripteurs n Implicites : – au sein de la structure arborescente – de type hiérarchiques Vascular diseases [C14.907] Ischemia [C14.907.553] Ischemia [C14.907.553]

19 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Relations entre descripteurs Explicites : hiérarchiques see under see under Descripteur mineur Descripteur majeur XU XU RESPIRATION DISORDERS XU CHEYNE-STOKES RESPIRATION CHEYNE-STOKES RESPIRATION see under RESPIRATION DISORDERS

20 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Relations entre descripteurs Explicites : équivalence see terme d ’entréedescripteur XCHICKENPOX X VARICELLA VARICELLA see CHICKENPOX

21 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Relations entre descripteurs Explicites : associative see related Descripteur majeur Descripteur majeur XR XR DEATHXRTHANATOLOGIE

22 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 n Descripteur obligatoire, information renseignée de façon systématique par l ’indexeur n Concernent les notions d ’âge, humain ou animal, type d ’article, période historique.. Annotations : Check tag

23 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Annotations : n Do not Use /…/…/ : ne pas utiliser les qualificatifs indiqués entre les / n 73 (71) : date de création du descripteur –majeur à partir de 1973 –provisoire de 1971 à 1973 n et bien d ’autres...

24 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Un descripteur n Est donc un objet complexe n Identifié par un numéro et un libellé n Accompagné d ’un commentaire n Ayant une position dans la structure n Pouvant être précisé par des qualificatifs n En relation avec d ’autres termes

25 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 MeSH HeadingThoracic Surgery Tree NumberG02.403.810.803G02.403.810.803 Annotationa surg specialty: do not confuse with THORACIC SURGICAL PROCEDURESTHORACIC SURGICAL PROCEDURES (Cat E4); SPEC qualif; do not use for surg of specific thoracic organs ( = organ / surg) or surg specific thoracic dis ( = disease /surg); DF: THORACIC SURG Scope NoteA surgical specialty concerned with diagnosis and treatment of disorders of the heart, lungs, and esophagus. Two major types of thoracic surgery are classified as pulmonary and cardiovascular. Entry TermCardiac Surgery Entry TermHeart Surgery Entry TermSurgery, Cardiac Entry TermSurgery, Heart Entry TermSurgery, Thoracic

26 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 See AlsoCardiac Surgical ProceduresCardiac Surgical Procedures See AlsoCardiovascular Surgical ProceduresCardiovascular Surgical Procedures See AlsoThoracic Surgical ProceduresThoracic Surgical Procedures Allowable QualifiersCL EC ED ES HI IS LJ MA MT OG SN ST TDCL EC ED ES HI IS LJ MA MT OG SN ST TD Entry VersionTHORACIC SURG Online Noteuse THORACIC SURGERY to search THORAX /surgery 1966-79 (with no qualif 1966-79) History Note80; was THORAX /surgery 1966-79 & SURGERY, THORACIC (NON MESH) before 1980 Unique IDD013903

27 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Variété du vocabulaire médical n Heart n Surgery n Surgical procedure, operative n Heart surgery n Thoracic surgery n Cardiac surgical procedure Nombreuses possibilité de parler de la Nombreuses possibilité de parler de la chirurgie cardiaque à partir de ces 6 termes

28 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 La maîtrise des concepts n Main headings : Thoracic surgery n Termes d ’entrée : –Cardiac surgery ; Surgery cardiac –Heart surgery ; Surgery heart ; Surgery thoracic n see also: –Cardiac surgical procedure –Thoracic surgical procedure –Cardiovascular surgical procedure n Subheadings : surgery non autorisé

29 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Conséquence pour les requêtes Thyroïd [MH] AND Neoplasms [MH] AND Surgery [MH] 4 références

30 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Conséquence pour les requêtes Thyroïd neoplams [MH] / SU 5174 références

31 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Conséquence pour les requêtes n Brain [MH] AND Virology [MH] 1 référence n Brain [MH] / VI 2086 références

32 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Conséquence pour les requêtes Brain [MH] AND Injuries [MH] 13 59 Brain [MH] / IN3 583 Brain injuries [MH] 26 034 Brain injuries [TW]23 063

33 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 La complexité des liens n Un atout pour éviter le silence lors des recherches n Pour suggérer des informations complémentaires

34 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 La maintenance n IMPORTANCE MAJEURE n Adapter le système à l ’évolution des technologies informatiques (1960 à 2004) n Adapter les bases à l ’évolution des connaissances n enlever, ajouter, renommer, modifier les concepts et les relations, en leur conservant une cohérence

35 Master Expertise et Ingénierie des systèmes d ’information en santé novembre 2004 Vers plus d ’ « intelligence » n Le MeSH est donc le langage d ’indexation du système MEDLINE n Mais l ’interface PUBMED d ’interrogation de MEDLINE fait aussi appel à un autre « langage » (UMLS) afin d ’être plus intelligent.