AUDACE Défi transversal CPER 2015 - 2020 Auvergne Data Cloud Academic Vincent BRETON UBP / CNRS MESOCENTRE CO Décisionnel CU ConsultatifTutellesCRRI Centre.

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1 AUDACE Défi transversal CPER 2015 - 2020 Auvergne Data Cloud Academic Vincent BRETON UBP / CNRS MESOCENTRE CO Décisionnel CU ConsultatifTutellesCRRI Centre Régional de Ressources Informatiques Pôle Application Métier et Système d’Information (AMSI) Pôle Infrastructure Réseaux & Datacenter Systèmes & Calcul Scientifique Antoine MAHUL Assistante 6 75+ supportcrri@clermont-universite.fr Mutualisé NonMutualisé CoPil EPICURE SYMBIOSE SYMBIOSE Gilles MAILHOT Isabelle CASSAR-MALEK Gilles BRUNSCHING MMaSyF ATTRIHUM Adaptation des systèmes biologiques et trajectoires de santé Interactions entre changement global, biodiversité et fonctionnement des systèmes Mobilité - Matériaux et Systèmes du Futurs Attractivité, Innovation, Humanités, Numérique Pierre PEYRET UdA Philippe LEROY, Inra Jean-Pierre CHANET Irstea Thibault FALVARD UBP Farouk TOUMANI Cyril GALPIER, Géraldine FETTAHI, Thierry MALLET, Antoine MAHUL Thématique 1 Millieux et Ecosystèmes Thématique 2 Agro-systèmes Thématique3 Analyses de risques, Modélisation Anne-Marie DELORT Télesphore SIME-NGANDO Pierre SCHIANO Pascal CARRERE Marie-Christine MONTEL Thierry LANGIN Guillaume DEFFUANT ConnecSens ConnecSens Michel MISSON CU Mésocentre – 30 Mars 2016

2 MESOCENTRE ~ 2035 CO Décisionnel CU Consultatif CRRI Centre Régional de Ressources Informatiques Pôle Application Métier et Système d’Information (AMSI) Pôle Infrastructure Réseaux & Datacenter Systèmes & Calcul Scientifique Antoine MAHUL Assistante 6 75+ supportcrri@clermont-universite.fr Mutualisé NonMutualisé AuBi Auvergne Bioinformatique Structuration de la Bioinformatique en Auvergne

3 Réseau Bioinformatique Français Pierre PEYRET UdA 29 Février 2016 CoPil IFB - PRABI-AMSB, LyonPRABI-AMSB - PRABI-Doua, Lyon PRABI-Doua - PRABI-Gerland, LyonPRABI-Gerland - PrabiG, GrenoblePrabiG - PRABI-Lyon SudPRABI-Lyon Sud - INCa-SLCINCa-SLC

4 15 Janvier 2016 Réunion Galaxy CRRI 2 Novembre 2015 2 ème Réunion Groupe BioInfo Auvergne 6 – 9 Juillet JOBIM 2015 29 Octobre 2014 Séminaire de Réflexion Pôle Physique - Cézeaux * Bioinformatique * Infrastructure * Réseaux 29 Février 2016 VisioConf IFB 30 Mars 2016 4 ème réunion - CU Mésocentre - Présentation AuBi 8 Décembre 2015 3 ème réunion CU Mésocentre 15 Septembre 2015 2 ème réunion CU Mésocentre Présentation du Projet de Structuration de la Bioinformatique en Auvergne P. Peyret CIDAMGDECGReDLMGEPIAFM2ISHLIMOS Novembre 2014 Premiers contacts avec PRABI – Guy Perrière Procédure d’Adhésion à l’IFB 6 Janvier 2015 Première Réunion « Structuration de la Bioinformatique » IFB Formation CRRI 28 Octobre 2015 Site WEB AuBI 15 Mai 2015 Dossier IFB 17 Décembre 2015 CS PRABI – Lyon P. Peyret présente le projet AuBi 18 Mars 2016 3 ème Réunion AuBi Candidature Validées

5 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr

6 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Réunion AuBi - 18 Mars 2016 Philippe LEROY sera le webmaster du site web AuBi Identifié comme éditeur par l’IFB (Drupal 7) Formation Drupal Liste ifb-webediteur Vérifier les informations Mise à jour utilisateurs/Equipes AuBi Screenshots résultats/outils Validation des outils PF AuBI (CRRI) - offres de Service Liens entre IFB-AuBi / Mésocentre / CRRI / UCA Faire un recensement des outils disponibles sur CRRI  mutualisables Faire un recensement des bases de données disponibles au CRRI

7 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Réunion AuBi - 18 Mars 2016 Compte AuBi / IFB en cours de création Frais de Missions Animations Scientifiques Formations Convention en cours de signature UMR 1095 INRA-UBP GDEC  Gestionnaire Gestionnaire Isabelle LHOMMET Liste diffusion administratifs IFB Ligne budgétaire identifiée Philippe LEROY  correspondant

8 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ?

9 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ? Liste de Diffusion AuBi – aubi-news@listes.inra.fr Réunion AuBi - 18 Mars 2016 Philippe LEROY  Modérateur Pierre PEYRET  Modérateur Premiers envois très prochainement Compléter et/ou expurger (ancienne liste JOBIM2015) Faire vivre

10 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ? Liste de Diffusion AuBi – aubi-news@listes.inra.fr Groupe de travail Galaxy  Bérénice BATUT

11 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ? Liste de Diffusion AuBi – aubi-news@listes.inra.fr Groupe de travail Galaxy  Bérénice BATUT Animation : Journée Bionformatique AuBi (avant fin Juin 2016) Date à trouver – Pôle Physique des Cézeaux Intervenants pressentis Claudine MEDIGUE Génoscope – Introduction au nouveaux enjeux de la Bioinformatique Christophe KLOPP – Responsable de la PF Genotool à INRA Toulouse Guy PERRIERE – PF PRABI J-F GIBRAT – IFB-core / Elixir Animation : Journée Bionformatique AuBi Septembre / Octobre – Etat de l’Art local en Bioinformatique

12 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ? Liste de Diffusion AuBi – aubi-news@listes.inra.fr Groupe de travail Galaxy  Bérénice BATUT Animation : Journée Bionformatique AuBi (avant fin Juin 2016) Formations MASTER Bioinformatique dans le cadre de la nouvelle Université UCA (Gisèle Bronner) DUT Bioinformatique IUT Aurillac (Valérie Polonais) Formations qui pourront être proposées dans le cadre de la PF AuBi

13 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ? Liste de Diffusion AuBi – aubi-news@listes.inra.fr Groupe de travail Galaxy  Bérénice BATUT Animation : Journée Bionformatique AuBi (avant fin Juin 2016) Formations Benchmarks Infra machine SMP – 360 cœurs / 8 To RAM Assemblage NGS (500 Go de reads – transcriptome du génome du blé tendre) Trinity

14 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ? Liste de Diffusion AuBi – aubi-news@listes.inra.fr Groupe de travail Galaxy  Bérénice BATUT Animation : Journée Bionformatique AuBi (avant fin Juin 2016) Formations Benchmarks Logo AuBi 

15 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique  Site WEB – http://aubi.clermont-université.fr Site WEB – http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes/AuBI Subventions IFB Subventions CNOC – Commission Nationale des Outils Collectifs de l’INRA ?  Subventions DTN (Délégué à la Transmission Numérique) via Ingenum (Ingénierie Numérique en Recherche) ? Liste de Diffusion AuBi – aubi-news@listes.inra.fr Groupe de travail Galaxy  Bérénice BATUT Animation : Journée Bionformatique AuBi (avant fin Juin 2016) Formations Bureau ? Réunions bi mensuelles  Renforcer le Collectif  Postes Site 2017  AuBi Développement Maintenance - Services Formations  Benchmarks Logo AuBi 

16 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique - PRABI-AMSB, LyonPRABI-AMSB - PRABI-Doua, Lyon PRABI-Doua - PRABI-Gerland, LyonPRABI-Gerland - PrabiG, GrenoblePrabiG - PRABI-Lyon SudPRABI-Lyon Sud - INCa-SLCINCa-SLC Formations Offres de Services Interfaces / Outils / Data Banks Visibilité

17 AuBi – AuBi – Auvergne Bioinformatique Toute demande au CRRI ou au Mésocentre concernant la bioinformatique (installation d’outils…) doit être connue de la plate-forme Auvergne Bioinformatique – AuBi Transmission des informations à pierre.peyret@udamail.fr qui fera le transfert au sein de la plate-forme.  Il faut éviter la redondance des demandes  Être cohérent & robuste Réunion AuBi - 18 Mars 2016 Recommandation

18 Philippe.leroy@clermont.inra.fr Merci Massif du Sancy Joël Damase Murol Castle http://www.clermont.inra.fr/triannot/