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Publié parBernard Lepage Modifié depuis plus de 8 années
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Faculté de Médecine de Marseille, Université de la Méditerranée julien.mancini@univmed.fr Laboratoire d’Enseignement et de Recherche sur le Traitement de l’Information Médicale Dr Julien Mancini Épidémiologie étiologique prise en compte des facteurs de confusion
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Biais de confusion l Seul biais qui peut-être corrigé lors de l’analyse statistique stratification analyse multivariée : régression logistique E M F
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Stratification
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Exemple : enquête fictive l On constate début 2004 une hausse brutale du nombre des malformations congénitales l On suspecte rapidement 2 nouveaux traitements mis sur le marché en début d’année...
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Fichier disponible 4 variables : Malformation : oui / non Age maternel Trt A (antihypertenseur) : oui / non Trt B (antalgique) : 0 / 10 / 100mg
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Confusion ? Trt AMalformations Âge ?
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Analyses univariées : Trt A Trt A Risque de Malformation (p<0,001) Prescrit chez les femmes de plus de 35 ans (p<0,001) Hors, le R de malformation est plus fréquent chez les femmes âgées (p<0,001)
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Stratification l Femmes < 35 ans : Quasi absence de prescription de A, pas d’effet l Femmes > 35 ans : Absence d’effet du traitement A (p=0,662)
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Confusion ? Trt AMalformations Âge Oui !!!
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Régression logistique
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Modèles multivariés l Étudient les relations entre : 1 variable dépendante Y Et plusieurs var explicatives X i l On devrait plutôt employer le terme « multivariables » ou « multifactoriels » car une seule var. dépendante
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Modélisation l Remplace la « stratification » avantageusement dès qu’il y a plusieurs strates l Suppose que la réalité soit « proche » de la modélisation Si on modélise une relation sous forme linéaire, les conclusions des analyses dépendront du bien-fondé de cette hypothèse de départ
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Utilisation croissante (Horton NEJM 05)
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Principaux modèles l Variable dépendante Y = quantitative (normale) Régression linéaire multiple l Variable dépendante Y = qualitative Binaire : Régression logistique 3 classes et + : Régression polytomique 3 classes et + ordonnées : Régression ordinale l Variable dépendante Y = incidence instantanée (Données censurées (de survie)) Modèle de Cox
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Régression logistique l Très utilisée en épidémiologie Liens entre Maladie et Facteurs de risque +++ l Étudie les relations entre : 1 variable expliquée Y (dépendante) binaire (0/1) Et 1 (RLog simple) ou plusieurs (Rlog multiple) var explicatives X i X i aussi bien qualitatives que quantitatives
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Variable dépendante Y l Le + souvent : Maladie = oui/non l Toute var. binaire : Pronostic = favorable/défavorable Décès = oui/non … l Toute var. quantitative dichotomisée : Hb <10 / 10 g/dl …
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Modèle l Probabilité d’être malade fonction de n différents facteurs de risque X i : l Y = P (M + / X 1, X 2, …, X n )
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Fonction logistique l P (M+ / X) = f(x) = 1 / [1+exp(-( + X)] l Varie entre 0 et 1 (proba) x f(x) 1 0
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Fonction logit l Logit(P) = Ln(Odd(P)) = Ln(P/(1-P)) l Logit(P) = + X l On peut écrire: l Ln ([Odd(P(M+/X=x 1 ))] / [Odd(P(M+/X= x 0 ))]) = Ln (ORx 1 /x 0 ) = (x 1 - x 0 ) l Exposition E dichotomique : E 1 = 1 et E 0 = 0 l on a : OR E 1 /E 0 = exp( )
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Extension à plusieurs variables l Modéle multiplicatif l P (M+ / X 1, X 2, …, X n ) = 1 / [1+exp(-( +Σ i X i )] l Ou : Logit(P) = + Σ i X i l Exposition E (X 1 ) dichotomique (0/1) l Ln OR E = Logit P 1 - Logit P 0 = ( + +Σ 1 i X i ) - ( +Σ 0 i X i ) = si les X i sont fixés (i.e. Σ 1 =Σ 0 ) l OR E 1 /E 0 ajusté sur X 2, …, X n = exp( 1 (E 1 - E 0 )) = exp( 1 )
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Estimation des paramètres et tests l et estimés par la méthode du maximum de vraisemblance (V = proba d’observer l’échantillon) et qui maximisent la vraisemblance du modèle l On peut alors tester les paramètres de 2 modèles emboités: H 0 : OR = 1 ou = 0 Modèle 1 (V 1 ) : Logit(P) = + 1 X 1 + 2 X 2 Modèle 2 (V 2 ) : Logit(P) = ’ + ’ 1 X 1 + ’ 2 X 2 + ’ 3 X 3 ’ 3 significativement différent de 0 si V 1 significativement inférieure à V 2 Test : 2Ln(V 1 /V 2 ) = 2Ln(V 2 ) - 2Ln(V 1 ) suit une loi du Chi ² à 1 ddl
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Codage des variables à k classes l On doit recoder les variables à k classes en (k-1) variables binaire en 0/1 l On peut ainsi interpréter les différents coefficients à partir d’une référence l Codage standard (par défaut dans les logiciels de stats) : XY1Y1 Y2Y2 Y3Y3 0000 1100 2010 3001
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Codage (E 0 = ref) l Modèle1 : Logit(P) = + E OR E 2 /E 0 = exp( (E 2 - E 0 ) = exp(2 ) = (OR E 1 /E 0 )² !!! l Modèle 2 : Logit(P) = + 1 X 1 + 2 X 2 + 3 X 3 OR X 2 /X 0 = exp( 2 (X 2 - X 0 ) = exp( 2 ) EX1X1 X2X2 X3X3 0000 1100 2010 3001
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Codage des variables quantitatives l Soit tel quel : Suppose effet linéaire sans seuil de la var explicative l Soit recodage en k classes : plus prudent interprétation plus facile l Choix en fonction : De la vraisemblance des modèles, de l’adéquation du modèle aux observations De la facilité d’interprétation
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Exemple : enquête fictive l Régressions logistiques univariées : association significative entre trt A et malformation association significative entre âge et malformation
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Exemple : enquête fictive (2) l Régression logistique multivariée : Disparition de l’association significative entre trt A et malformation après ajustement sur l’âge
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Dr Julien Mancini, LERTIM, Faculté de Médecine, Université de la Méditerranée Exemple : Lee SJ et al. Jama 2006: 295(7): 801-8 l Recherche de facteurs indépendamment prédictifs de la mortalité à 4 ans, pour création d’un index l Tous les facteurs inclus sont ici significativement liés à la mortalité car OR > 1 avec IC95% qui ne contient pas 1
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