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Publié parHenri Baril Modifié depuis plus de 8 années
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CARACTÉRISATION DE L’HÉMAGGLUTININE DU VIRUS INFLUENZA PANDÉMIQUE A/H1N1 2009 CIRCULANT AU QUÉBEC. Isabelle Hardy 1, Marie-Ève Hamelin 2, Guy Boivin 2, Annie- Claude Labbé 3, Claire Béliveau 3 et Michel Roger 1. 1 Hôpital Notre-Dame du Centre Hospitalier de l’université de Montréal, 2 CHUQ-CHUL, Centre de Recherche en Infectiologie et Université Laval, 3 Hôpital Maisonneuve-Rosemont. Isabelle Hardy 1, Marie-Ève Hamelin 2, Guy Boivin 2, Annie- Claude Labbé 3, Claire Béliveau 3 et Michel Roger 1. 1 Hôpital Notre-Dame du Centre Hospitalier de l’université de Montréal, 2 CHUQ-CHUL, Centre de Recherche en Infectiologie et Université Laval, 3 Hôpital Maisonneuve-Rosemont. AMMIQ, 26 mai 2010
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OBJECTIFOBJECTIF Caractériser la souche pandémique A/H1N1 2009 circulante Caractériser la souche pandémique A/H1N1 2009 circulante au Québec lors de la première et de la deuxième vague à au Québec lors de la première et de la deuxième vague à l’aide du séquençage de l’hémagglutinine. l’aide du séquençage de l’hémagglutinine. Caractériser la souche pandémique A/H1N1 2009 circulante Caractériser la souche pandémique A/H1N1 2009 circulante au Québec lors de la première et de la deuxième vague à au Québec lors de la première et de la deuxième vague à l’aide du séquençage de l’hémagglutinine. l’aide du séquençage de l’hémagglutinine.
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HÉMAGGLUTININEHÉMAGGLUTININE HA1 HA2 http://hemagglutinin.org/Start/start-en.htmhttp://hemagglutinin.org/Start/start-en.htm Sites antigéniques
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Igarashi et al., Plos One 2010 Jan 1;5(1):e8553 Évolution des sites antigéniques de l’HA A/H1N1 (2)
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CAS INDEX (Québec et Montréal) Cas Index de Montréal: ~ Homme de 26 ans revenant du Mexique (Cancun) ~ Homme de 26 ans revenant du Mexique (Cancun) ~ Syndrome grippal ~ Syndrome grippal ~ Prélèvement 26 avril 2009 ~ Prélèvement 26 avril 2009 Cas Index de Québec: ~ Homme de 16 ans revenant de New York ~ Homme de 16 ans revenant de New York ~ Syndrome grippal ~ Syndrome grippal ~ Prélèvement 3 mai 2009 ~ Prélèvement 3 mai 2009 Cas Index de Montréal: ~ Homme de 26 ans revenant du Mexique (Cancun) ~ Homme de 26 ans revenant du Mexique (Cancun) ~ Syndrome grippal ~ Syndrome grippal ~ Prélèvement 26 avril 2009 ~ Prélèvement 26 avril 2009 Cas Index de Québec: ~ Homme de 16 ans revenant de New York ~ Homme de 16 ans revenant de New York ~ Syndrome grippal ~ Syndrome grippal ~ Prélèvement 3 mai 2009 ~ Prélèvement 3 mai 2009
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20 échantillons par vague (50% M/F) 1 ère vague: mai à août 2009 2 ième vague: septembre à décembre 2009 2 ième vague: septembre à décembre 2009 Spécimens nasopharyngés (+ par PCR, A/H1N1p) 20 échantillons par vague (50% M/F) 1 ère vague: mai à août 2009 2 ième vague: septembre à décembre 2009 2 ième vague: septembre à décembre 2009 Spécimens nasopharyngés (+ par PCR, A/H1N1p) POPULATION ÉTUDIÉE 43,0 (10-86) 43,5 (10-81) 42,5 (11-80) 43,5 (10-80) QuébecQuébec MontréalMontréal 1 ère vague 2 ième vague Âge (Médiane)
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Schéma expérimental 5’5’3’3’ Séquençage (1701pb) Extraction ARNv RT-PCR (amorces spécifiques HA H1N1p) RT-PCR Analyse (SeqScape) Analyse (SeqScape) Comparaison (BioEdit) Comparaison (BioEdit) Phylogénie (Mega 4) Phylogénie (Mega 4) Analyse (SeqScape) Analyse (SeqScape) Comparaison (BioEdit) Comparaison (BioEdit) Phylogénie (Mega 4) Phylogénie (Mega 4) A/California/04/2009 et A/New York/04/2009
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S220T Comparaison des séquences: 1 ère vague MONTRÉALMONTRÉAL QUÉBECQUÉBEC
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S220T Comparaison des séquences: 2 ième vague MONTRÉALMONTRÉAL QUÉBECQUÉBEC
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Analyse phylogénétique (1 ère vague) 220T220T 220S220S
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Analyse phylogénétique (2 ième vague) 220T220T220S220S 49I 477V 537A 49I 477V 537A 391K 114N 211S 114N 211S
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CONCLUSIONSCONCLUSIONS Lors de la première vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Lors de la première vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Montréal vs Québec diffèrent par une mutation au niveau d’un site Montréal vs Québec diffèrent par une mutation au niveau d’un site antigénique (S220T). antigénique (S220T). → introduction d’un virus provenant d’une différente région pandémique (Cancun vs New York) région pandémique (Cancun vs New York) Lors de la première vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Lors de la première vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Montréal vs Québec diffèrent par une mutation au niveau d’un site Montréal vs Québec diffèrent par une mutation au niveau d’un site antigénique (S220T). antigénique (S220T). → introduction d’un virus provenant d’une différente région pandémique (Cancun vs New York) région pandémique (Cancun vs New York) Lors de la deuxième vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Lors de la deuxième vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Montréal et Québec arborent majoritairement la mutation S220T. Montréal et Québec arborent majoritairement la mutation S220T. → Meilleure capacité réplicative → Effet du vaccin (contient S220) Lors de la deuxième vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Lors de la deuxième vague, les souches A/H1N1p 2009 circulantes à Montréal et Québec arborent majoritairement la mutation S220T. Montréal et Québec arborent majoritairement la mutation S220T. → Meilleure capacité réplicative → Effet du vaccin (contient S220) Lors de la deuxième vague, plusieurs autres mutations accessoires Lors de la deuxième vague, plusieurs autres mutations accessoires sont apparues. sont apparues. → Pression sélective immunitaire Lors de la deuxième vague, plusieurs autres mutations accessoires Lors de la deuxième vague, plusieurs autres mutations accessoires sont apparues. sont apparues. → Pression sélective immunitaire
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REMERCIEMENTSREMERCIEMENTS Laboratoire de Santé Publique du Québec Laboratoire de Santé Publique du Québec Drs A.-M. Bourgault et H. Charest Drs A.-M. Bourgault et H. Charest Équipe technique au CHUM Équipe technique au CHUM Mmes É. Comète et D. Gaudreault Mmes É. Comète et D. Gaudreault Consortium Québécois sur le virus pandémique Consortium Québécois sur le virus pandémique A/H1N1 (FRSQ) A/H1N1 (FRSQ) Laboratoire de Santé Publique du Québec Laboratoire de Santé Publique du Québec Drs A.-M. Bourgault et H. Charest Drs A.-M. Bourgault et H. Charest Équipe technique au CHUM Équipe technique au CHUM Mmes É. Comète et D. Gaudreault Mmes É. Comète et D. Gaudreault Consortium Québécois sur le virus pandémique Consortium Québécois sur le virus pandémique A/H1N1 (FRSQ) A/H1N1 (FRSQ)
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