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Click to edit Master title style 1 Guide dutilisation du site www.atlas-ornitho.fr pour linstallation dune mise à jour automatique et semi-automatique.

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1 Click to edit Master title style 1 Guide dutilisation du site www.atlas-ornitho.fr pour linstallation dune mise à jour automatique et semi-automatique www.atlas-ornitho.fr

2 Click to edit Master title style 2 Choix du type de mise à jour : Semi-automatique : Si vous disposez dune base de donnée locale et vous souhaitez préparer un export que vous pourrez ensuite charger sur le site www.atlas- ornitho.frwww.atlas- ornitho.fr Automatique : Si vous disposez dun système de saisie en ligne et que vous voulez le connecter au site www.atlas- ornitho.fr de manière à navoir plus aucune manipulation à faire pour transmettre vos donnéeswww.atlas- ornitho.fr

3 Click to edit Master title style 3 Procédure de mise à jour semi-automatique

4 Click to edit Master title style 4 Préparation des fichiers Vous devez préparer 3 fichiers : –Un pour les statuts de nidification –Un pour les classes dabondance –Un pour la pression dobservation Ces fichiers sont de simples fichiers texte tabulé dont chaque ligne est séparée par un retour à la ligne. Ces fichiers seront encodé en UTF-8. Le nom est sans importance.

5 Click to edit Master title style 5 Fichier : statuts de nidification Numéro (ID) de lespèce (Un fichier excel avec la liste complète disponible sur la page http://www.atlas- ornitho.fr/index.php?m_id=120, sil manque une espèce, contactez la coordination nationale)http://www.atlas- ornitho.fr/index.php?m_id=120 Année de prospection complète sur 4 chiffres Numéro de la maille Selon les références officielles Statut de nidification possible, probable, certain ou - pour retirer une espèce tabulationsretour à la ligne

6 Click to edit Master title style 6 Fichier : classes dabondance Numéro (ID) de lespèce (Un fichier excel avec la liste complète disponible sur la page http://www.atlas- ornitho.fr/index.php?m_id=120, sil manque une espèce, contactez la coordination nationale)http://www.atlas- ornitho.fr/index.php?m_id=120 Année de prospection complète sur 4 chiffres Numéro de la maille Selon les références officielles Classe dabondance I, II, III, IV ou - pour retirer une espèce tabulationsretour à la ligne

7 Click to edit Master title style 7 Fichier : pression dobservation Année de prospection complète sur 4 chiffres Numéro de la maille Selon les références officielles Pression dobservation A,B,C,D ou - pour retirer une espèce tabulationsretour à la ligne

8 Click to edit Master title style 8 Envoi des fichiers Un fois les fichiers préparés, vous devez suivre la procédure suivante pour les transmettre sur le site et les intégrer à latlas

9 Click to edit Master title style 9 Etape 1 : inscription sur le site Avant toute opération, il faut être reconnu par le site, donc inscrit. Lopération se fait depuis la page : http://www.atlas-ornitho.fr/inscription/ http://www.atlas-ornitho.fr/inscription/

10 Click to edit Master title style 10 Formulaire dinscription Choix personnalisé du tri des espèces dans les différentes pages du site Votre email sert de nom dutilisateur unique pour que le système vous reconnaisse dune visite à lautre. Pour éviter des fautes dinattention, le système demande 2x votre email pour comparaison, avant de vous envoyer votre mot de passe par ce mail.

11 Click to edit Master title style 11 Etape 2 : connexion Connectez-vous au site en utilisant lemail utilisé à linscription (Etape 1) et le mot de passe que vous avez reçu sur cet email. Cochez la case « mémoriser le mot de passe » pour que le système ne vous le demande plus lors de vos prochaines visites, tant que vous utilisez la même machine. Si vous avez perdu votre mot de passe, le système peut vous en générer un nouveau. Pour ce faire, cliquez sur le lien « Jai perdu mon mot de passe »

12 Click to edit Master title style 12 Etape 3 : saisie Une fois connecté, une nouvelle entrée apparaît dans le menu : « Transmettre mes données ». Elle vous permet daccéder à la saisie en ligne.

13 Click to edit Master title style 13 Premier accès Lors de votre première connexion (vous recevez votre mot de passe dans les minutes qui suivent votre inscription), vous navez accès à rien. Cest normal. Il faut maintenant laisser le temps au coordinateur régional/départemental/national de vous donner les droits daccès sur les mailles/départements auquel vous allez travailler. Cela peut prendre quelques jours, contactez votre coordinateur si nécessaire.

14 Click to edit Master title style 14 Au fond de la page de chacun des trois onglets « Statut par maille », « Classes dabondance » et « Pression dobservation » se trouve une ligne permettant de sélectionner un fichier. Choisissez le fichier correspondant que vous avez créé en suivant la procédure décrite précédement et cliquez sur « Importer » Import

15 Click to edit Master title style 15 Gestion des erreures Lors de limport, le système vérifie tout dabord les données du fichier. Tant que le fichier nest pas 100% correct, aucune donnée nest modifiée et une synthèse des erreurs est présentée. Pour des raisons pratiques, le nombre derreurs affichés est limité à un maximum de 20. Modifiez le fichier en fonction des erreurs présentées et retentez un import. En cas de soucis, envoyez votre fichier à la coordination nationale pour vérification.

16 Click to edit Master title style 16 Mise à jour Lors de lenvoi successif de plusieurs fichiers, les données du dernier fichier remplacent les données précédentes. Pour supprimer une ligne, indiquez - dans la dernière colonne (statut de nidification, pression dobservation ou classe dabondance). Sans - la donnée concernée reste inchangée. Vous pouvez aussi corriger à la main les données en suivant la procédure de mise à jour manuelle. Toutefois, si vous réimportez ensuite un fichier après vos modifications, celles-ci seront perdues.

17 Click to edit Master title style 17 Procédure de mise à jour automatique

18 Click to edit Master title style 18 Fichier XML La mise à jour automatique se base sur un fichier XML que votre système doit produire. LURL de ce fichier doit être transmis à la coordination nationale pour être intégré dans latlas

19 Click to edit Master title style 19 Format de fichier Le fichier XML doit respecter la DTD (Data Type Definition) ci- contre. (exemple page suivante) La branche « users » (facultative) sert à établir la liste des observateurs ayant contribué à latlas. Ladresse email sert à discriminer un utilisateur actif sur plusieurs régions/départements. Il nest pas possible de transmettre la classe dabondance par ce biais. Le fichier doit contenir en permanence toutes les données car le système remplace le contenu de toutes les mailles par les nouvelles données. Les mailles absentes du fichier XML sont retirées de la synthèse atlas. Le fichier doit être encodé en UTF-8. Le fichier peut-être compressé en bz2 pour réduire la bande passante. Contactez la coordination pour plus dinfo si vous êtes intéressé par cette procédure.

20 Click to edit Master title style 20 Exemple de fichier XML valide

21 Click to edit Master title style 21 Problème des mailles limitrophes Les mailles qui sont à cheval sur deux (ou plusieurs) régions / départements peuvent poser problème. Il y a 2 cas de figure : –Mailles automatiques : Au moins une des zones limitrophe est mise à jour automatiquement par une base de donnée en ligne (compatible biolovision) –Mailles manuelles ou semi-automatiques : Toutes les zones touchées sont mises à jour manuellement ou semi-automatiquement par un ou plusieurs responsables de maille. Pour le cas ou toutes les zones dune maille sont mise à jour automatiquement par une base de donnée en ligne, le logiciel synthétise les résultats de toutes les zones.

22 Click to edit Master title style 22 Mailles automatiques Par défaut, toutes les mailles touchées (même à 1%) par un département doté dune base de donnée en ligne compatible sont mises à jour automatiquement et la mise à jour manuelle ou semi- automatique est impossible. Pour pouvoir faire une mise à jour manuelle ou semi-automatique, vous devez demander à la coordination nationale de désactiver la mise à jour automatique pour la maille concernée. Les données provenant de votre voisin sont dès lors ignorées et vous devez vous-même les intégrer dans votre synthèse si souhaité ou souhaitable.

23 Click to edit Master title style 23 Mailles manuelles ou semi-automatique Les mailles sans mise à jour automatique sont accessibles pour tous les coordinateurs de maille concernés. Vous devez vous mettre daccord pour savoir qui va gérer la maille.


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