Recherche dans PubMed Bibliothèque des sciences de la santé Automne 2013.

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1 Recherche dans PubMed Bibliothèque des sciences de la santé Automne 2013

2 SURVOL Quest ce que PubMed AccèsAccès Énoncé/stratégie de recherche Opérateurs logiques Recherche Simple Les termes MeSH (Medical Subject Headings)Les termes MeSH Interroger PubMed avec les MeSH Historique de recherche et combinaisons Limitez votre recherche Repérez les références non-indexées Gérez vos références Sauvegarde des références dans RefWorksSauvegarde des références dans RefWorks My NCBI : Sauvegarde des recherches Aide additionnelle Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

3 Quest-ce que PubMed? Une base de données bibliographiques Plus de 22 millions de références bibliographiques à des articles de périodiques Produite par la National Library of Medicine (NLM), U.S. Plus de 5600 périodiques indexés dans Medline Contenu international (75% anglais) 1950-présent + références non indexées dans Medline Détails du contenu: http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/dif_med_pub.ht ml http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/dif_med_pub.ht ml Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

4 Accès Page daccueil de la Bibliothèque des sciences de la santé: Page daccueil de la Bibliothèque des sciences de la santé –Ressources principales à la page daccueil –Liste A-Z des bases de données –Pages Trouver des articles de nos Libguides Pubmed.gov : disponible gratuitement sur Internet Pubmed.gov ATTENTION: si vous ne passez pas par nos pages Web, les liens vers les textes intégraux des articles de périodiques auxquels nous sommes abonnées pourraient ne pas fonctionner. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

5 Stratégie de recherche Énoncé de recherche: Mme Smith, une patiente âgée de 50 ans, se demande si le cancer du sein peut être prévenu grâce aux vitamines ou aux suppléments nutritionnels. Concepts clés: 1. Cancer du sein Prévention 2.Vitamines 3. Suppléments nutritionnels Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

6 Opérateurs logiques ET – Relie 2 ou plusieurs idées différentes. Permet de mieux cibler les résultats de recherche. OU –Relie 2 ou plusieurs synonymes ou termes connexes. Permet délargir votre résultat de recherche. NON (SAUF) –élimine les idées ou concepts non désirés. Réduit la recherche. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

7 Stratégie de recherche: relations entre les concepts Concept 1: cancer du sein ET prévention (un aspect du concept 1) ET (Concept 2: vitamines OU Concept 3: suppléments nutritionnels) Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

8 Représentation graphique Suppléments nutritionnels Cancer du sein/prévention Vitamines Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

9 Recherche intuitive dans PubMed Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

10 Caractéristiques de la recherche intuitive Facile, rapide Exige une connaissance minimale des opérateurs logiques Le système fait tout le travail (renvois aux termes appropriés) Repérage maximum Précision laisse à désirer Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

11 MeSH Medical Subject Headings pourquoi les utiliser? Des listes de mots et dexpressions uniformisés: cancer=neoplasms Éliminent les variations terminologiques et orthographiques: tumor ou tumour=neoplasms Couvrent tout un éventail de synonymes ou de termes plus spécifiques: neoplasms inclut Lung neoplasms, Kidney neoplasms, Breast neoplasms, etc. Pour de plus amples explications: vidéo sur le vocabulaire MeSH (en anglais seulement)vidéo sur le vocabulaire MeSH Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

12 MeSH (suite) Permettent de réduire létendue de la recherche du sujet grâce à la fonction sujet principal (major topic) Permettent de réduire létendue de la recherche du sujet en le combinant avec les qualificatifs (subheadings) désignant des aspects spécifiques - ex. : Breast Neoplasms – prevention & control Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

13 Interroger PubMed avec les MeSH – recherche du concept 1 Ch 1. Choisir la base MeSH soit du menu déroulant ou directement en cliquant sur ce lien 2. Taper le terme ou lexpression dans la case et cliquer sur Search Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

14 Renvoi au MeSH (mapping) Cliquer sur le MeSH Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

15 Identifier / utiliser les MeSH (suite) Choisir les sous-catégories pertinentes et décider du poids du MeSH (« major » ou pas) puis ajouter au « Search builder » Cliquer sur Search PubMed Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

16 Résultats de la recherche – 1 er concept Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

17 Recherche du 2 ème concept: vitamines 1.Cochez tous les termes pertinents. 2.Ajoutez au Search builder 3.Combinez avec le OR (OU) 4.Cliquez sur Search Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

18 Résultats, 2 ème concept Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

19 Recherche du 3 ème concept Vous pouvez cliquer dans la case pour choisir le MeSH, puis Add to search builder, et Search PubMed Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

20 Résultats, 3 ème concept Cliquez maintenant sur Advanced Search pour voir lhistorique de la recherche Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

21 Historique de la recherche et combinaisons logiques Les concepts apparaissent dans les boîtes lorsque vous cliquez sur Add. Choisissez lopérateur pertinent pour votre combinaison. Avec le bouton de gauche, cliquez sur Add pour chaque ensemble à combiner. Dans cette recherche, commencez par combiner « vitamines » OR « suppléments nutritionnels ». Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

22 Résultat du OR et retour à lhistorique de recherche Cliquez Historique de recherche enrichie dun ensemble Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

23 Complétez votre recherche en combinant les concepts devant être reliés par ET (AND) Toujours avec le bouton gauche de la souris, cliquez Add pour les ensembles à combiner avec le AND. Dans la section en haut de lécran, cliquez sur Search pour exécuter la combinaison. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

24 Vos résultats: concept 1 ET (2 OU 3) Les filtres sont des critères de limites que vous pouvez appliquer à vos résultats 1.Cliquez pour ajouter des critères de limites tels âge, langue des asrticles… Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013 2. Choisissez les filtres et cliquez sur Show

25 Filtres 1. Choisissez une ou plusieurs valeurs pour chaque filtre désiré, puis cliquez sur Show Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013 2. Limitez ensuite vos résultats en cliquant sur un filtre pour lappliquer. Ici, on passe de 155 à 62 références. Noubliez pas que les limites demeurent actives pour toute la session, à moins que vous les enleviez.

26 Repérez les références non-indexées Utilisez tous les synonymes possibles (pas de MeSH) Utilisez les parenthèses et les opérateurs logiques pertinents entre vos concepts (Breast cancer* OR breast carcinoma* OR breast neoplasm* OR breast tumor*) AND prevent* AND (Vitamin* OR ((nutrition* OR dietary) AND supplement*)) Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

27 Exécution de la recherche 1. Cliquez sur ce filtre Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013 2. Limitez aux 7 derniers mois et appliquez

28 Résultat limité On constate que plusieurs références sont « in Process » (en cours de traitement) ou « Epub ahead of print » Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

29 Votre stratégie de recherche élargie Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013 Il vous suffit maintenant de combiner #13 OR #17 pour obtenir toutes les références, indexées ou non, sur votre sujet. Noubliez pas denlever la limite de temps!

30 Vos résultats Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013 N.B.: Cliquer pour choisir les références. Si aucune référence nest choisie, tout lensemble est traité lors de la prochaine action.

31 Visionnez vos résultats Choisissez le format Abstract pour voir le bouton, les MeSH et les résumés Choisissez le format MEDLINE si vous exportez à un gestionnaire bibliographique Cliquez sur Display settings pour voir les options daffichage Affichez suffisamment de références pour voir tout votre ensemble sur un seul écran, si possible Cliquez pour valider vos choix Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

32 Gérez vos références Cliquez sur Send to pour imprimer, sauvegarder sur une clé usb ou sur votre poste de travail, acheminer par courriel ou créer un fichier qui pourra être importé dans un gestionnaire bibliographique comme RefWorks. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

33 Sauvegarde du fichier pour importation dans RefWorks Veillez à modifier le nombre de références à envoyer en fonction de vos résultats. Ici, le nombre le plus petit que lon devrait choisir est 100, si on veut les 65 références en un seul envoi. Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013 Le fichier est sauvegardé dans les téléchargements. Cliquer sur Save File

34 Connexion à RefWorks Saisissez vos coordonnées si vous êtes déjà inscrit(e) ou inscrivez- vous - cest gratuit! Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

35 Importation dans RefWorks Cette page est disponible dans les guides de recherche, (sciences infirmières, physiothérapie, ergothérapie, audio/ortho) sous longlet Trouver des articles guides de recherche Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

36 Importation dans RefWorks Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

37 Résultat de limportation Cliquez ici pour obtenir cela Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

38 Aide sur RefWorks Consultez le Tutoriel de RefWorks http://refworks.scholarsportal.info/tutorial Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

39 Sauvegardez des recherches Cliquez Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

40 Sauvegardez la recherche Connectez-vous à MyNCBI ou inscrivez-vous Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

41 Sauvegardez la recherche Cliquez Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

42 Rappelez la recherche Cliquez sur MyNCBI: Aide dans MyNCBI Cliquez sur votre recherche pour la ré-exécuter Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

43 Aide exhaustive (en anglais seulement) Le fichier daide de PubMed : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/help/pmhelp.html PubMed FAQ : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.FAQs Tutoriel interactif sur PubMed : http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_tutorial/m1001.html Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013

44 Des questions? refrgn@uottawa.carefrgn@uottawa.ca 613-562-5800 x 8294 Clavardez en direct Bibliothèque des sciences de la santé MERCI! Bibliothèque des sciences de la santé automne 2013