Développement d’applications informatiques en recherche biomédicale

Présentation au sujet: "Développement d’applications informatiques en recherche biomédicale"— Transcription de la présentation:

1 Développement d’applications informatiques en recherche biomédicale
First and before I’ll introduce myself, you have to know you will suffer during this presentation because my english is very pour. So who I am? I am the data processing coordinator for the Biomedical Telematics Laboratory, which is an infrastructure of the Respiratory Health Network of the FRSQ. It’a a long title and I’d like to thanks my supervisor Dr Rousseau for it ! I’m here to talk about Data Processing, specially in the case of clinical trials. Many information you will see in this presentation were prepared by M Steve Bélanger which is a consultant for LGS group in Quebec. LGS is a division of IBM dedicated to developpment of solutions in IT. Yvan Fortier, Dany Janvier et Éric Rousseau Laboratoire de Télématique Biomédicale (LTB) du Réseau en Santé Respiratoire du FRSQ

2 Introduction Le Laboratoire de Télématique Biomédicale (LTB)
Créé en 1995 par le Réseau en Santé Respiratoire supporté par le FRSQ. Mission: Réaliser les analyses, le développement et la maintenance de solutions informatiques pour supporter les projets de recherches menés par les chercheurs du RSR. Situé à Sherbrooke au Centre de recherche clinique du CHUS Since 1995, we developped a douzen of application an many of them are web-based and multicentric. One of them is the RHN tissue bank you’ll see after lunch

3 Équipe Le Laboratoire de Télématique Biomédicale (LTB)
Emploi un coordonnateur et un programmeur à temps plein Accueille des stagiaires en informatique et des étudiants en médecine Est dirigé par le Dr Éric Rousseau Since 1995, we developped a douzen of application an many of them are web-based and multicentric. One of them is the RHN tissue bank you’ll see after lunch Dr Éric Rousseau Yvan Fortier Dany Janvier

4 Rôle du LTB Développement d’applications informatiques spécialisées:
PPA, Dr Larivée, Asthme FKP, Dr Berthiaume, Fibrose Kystique IRMPOC, Drs Bourbeau et Maltais, MPOC BTRSR, Banque de Tissus OSANA, Dr Bellemare, Apnée chez l’adulte SIMPOC, Pneumologues/patients MPOC TB-ERA, Dr Menzies, Infections pulmonaires COPD-REHAB, Drs Bourbeau et Maltais, MPOC

5 Rôle du LTB Procure le support informatique aux utilisateurs
Assure la maintenance du site web trilingue du Réseau en Santé Respiratoire du FRSQ

6 Équipement et services
Serveur web Hébergement d’applications web Connections avec des bases de données Service FTP pour le transfert de fichiers Serveur Teleform Conversion de fax en données Projets de développement sur plates-formes Palm One Pen Tablet

7 Plates-formes utilisées
Développement d’applications ASP, VBScript et JavaScript ASP.net Visual Basic MS Access Base de données MS Access My SQL

8 Exemple d’application: BTRSR
BTRSR est une application hybride qui combine l’utilisation d’une fenêtre web enchâssée dans un programme Visual Basic.

9 Exemple d’application: IRMPOC
IRMPOC est une application web qui permet l’administration de questionnaires et de tests pour le suivi d’une cohorte de sujets en réadaptation pulmonaire IRMPOC is a web based application for the Respiratory Rehabilitation Research Infrastructure of the RHN It contain actually 490 patients followed for 5 years in a clinical trial. The application gives a web access to 12 questionnaires like the CRQ and the St-George questionnaire ant to 5 tests like the 6 minutes walk test. The datas and the result for each test and questionnaires are saved in a database on the RHN server in Sherbrooke.

10 Exemple d’application: IRMPOC v2
IRMPOC v2 est la seconde version de l’application web IRMPOC et propose un mode de navigation amélioré. The first version will be replaced by the second version in a couple of months. The patients datas will be integrate in the same screen without the necessity to use another tool.

11 Exemple d’application: COPD-REHAB
COPD-REHAB est une application web en réadaptation MPOC qui utilise le langage ASP.net . Another application is under development COPD_REHAB is a multicenter, randomized clinical trial evaluating the effects of a home-based versus a hospital based outpatient pulmonary rehabilitation program in a COPD population. A total of 240 subjects will be randomized in 10 participating sites across Canada.

12 Exemple d’application: FKP
FKP est une application Access qui permet le suivi d’une cohorte de sujets en Fibrose Kystique et le calcul automatique de nombreux paramètres.

13 Exemple d’application: SIMPOC
SIMPOC est une application programmée en Visual Basic destinée au suivi clinique de patients atteints de MPOC.

14 Engagement du LTB Pour les coordonnateurs de projet…
Réduire le temps investi dans la vérification de données qui ne respectent pas les protocoles établis en fournissant des outils qui valident l’information dès sa saisie. Maximiser l’utilisation de listes pré formatées plutôt que des champs en texte libre pour uniformiser les données. Intégrer aux outils le concept de données manquantes pour permettre le suivi des données et la saisie en plusieurs étapes. Pour les directeurs de projets… Permettre de garder en tout temps le plein contrôle sur le développement des outils et sur la conservation des données. Assurer la conformité des outils aux standards existants

15 Engagement du LTB Pour les utilisateurs finaux des applications
Bien former les utilisateurs sur les outils qu’ils utilisent, Permettre aux utilisateurs de naviguer librement parmi les sujets, les projets et les formulaires sur lesquels ils ont des droits d’accès, Favoriser l’utilisation de listes pré formatées à celle des boutons radio ou des cases à cocher pour faciliter la saisie d’information, Arrimer le plus possible la présentation écran à celle des impressions papier.