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RESISTANCE BACTERIENNE AU SENEGAL
Pr Cheikh Saad Bouh BOYE Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie FMPOS/UCAD/DAKAR
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. Fréquence des Infections
OBJECTIFS . Fréquence des Infections . Surveillance de la Résistance . Efficacité thérapeutique
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PALM EGEM INSPEAR OBSAIRV BASKETT INSPIRATION
DEMARCHE QUALITE
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Isolement Bactérien Coloration Cytologie Flore bactérienne
- Isolement , Identification - Etude de la Sensibilite( ABG , CMI… ) - Contrôle Qualité ( Références ATCC )
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SOUCHES COMMUNAUTAIRES
DEMARCHE QUALITE
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IRBC IRH ( OTITES ET SINUSITES AIGUES)
Streptococcus pneumoniae Haemophilus influenzae , Moraxella catarrhalis Bactéries Atypiques à Dakar ( SENEGAL) ( ) IRBC IRH ( OTITES ET SINUSITES AIGUES) Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie FMPOS/UCAD/DAKAR
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Observatoire Sénégalais pour l ’Antibiothérapie dans les Infections Respiratoires de Ville
PROJET OBSAIRV
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ETIOLOGIE BACTERIENNE CAP
Bacteries atypiques: Legionella spp Chlamydia spp Mycoplasma spp S. pneumoniae 22% 34% 6% S. aureus 15% 15% Autres 8% H. influenzae et M. catarrhalis BGN 20/11/2018 1
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(OMA) (n = 113 souches) Enfants n= 63 souches Adultes n= 50 souches
Autres Autres Haemophilus Haemophilus Moraxella Moraxella S.pneumoniae S.pneumoniae Enfants n= 63 souches Adultes n= 50 souches
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(Sinusites Aigues) (n = 66 souches)
Autres Autres Haemophilus Moraxella Haemophilus Moraxella S.pneumoniae S.pneumoniae Adultes n= 24 souches Enfants n= 42 souches
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Profil des Souches isolées
% % Afrique % Monde S.pneumoniae (DRSP) 32 15-50 > 50 S.pneumoniae (DSSP) 68 H.influenzae (Ampi S) H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 25-40 30-80 H.influenzae(Ampi R/BL- 02 1-5 2-4 M.catarrhalis ( BL+) 70 70-90 M.catarrhalis ( BL-) 30
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Profil des Souches isolées
% IRB IRH S.pneumoniae (DRSP) 32 23 35 S.pneumoniae (DSSP) 68 H.influenzae (Ampi S) 72 H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 28 H.influenzae(Ampi R/BL- 02 M.catarrhalis ( BL+) 70 75 M.catarrhalis ( BL-) 30
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Beta Lactamines
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Penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae
Penicillin-intermediate (MIC 0.12–1 µg/mL) Penicillin-resistant (MIC ³ 2 µg/mL) Rwanda 21.0% 0.0% Tunisia 24.0% 11.0% Algeria 11.4% 5.7% Senegal 2% 30% Ghana 17.0% 0.0% Egypt 29.1% 0.0% Zambia 14% 0.0% Zimbabwe 7% Botswana 25% 0.0% Ethiopia 17% 0.0% Kenya 41.2% 1.8% Namibia 21% 9% South Africa 20.9% 51.0% INSPIRATION , BASKETT
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Streptococcus pneumoniae
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S.pneumoniae ATB PSSP(68%) PISP(30%) PRSP(2%) AminoPeni S S(60%) R
AminoP+Inhib S(98%) CSP1,2,3 S(93%) Macrolides S(87%) Tetracycline R(72%) Vancomycin
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Macrolides
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Macrolide-resistant S. pneumoniae
Tunisia 28.0% Algeria 21.7% Egypt 2.5% Senegal 4% Erythromycin-resistant (MIC ³ 1 µg/mL) South Africa 52.7% INSPIRATION , BASKETT
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Haemophilus influenzae
Important pathogène dans IRA Plus de 30% -lactamase positive4 Haemophilus influenzae
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Haemophilus influenzae
β-lactams
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Haemophilus influenzae
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M. catarrhalis H. influenzae S. pneumoniae
Senegal. Antimicrobial Resistance Trends Among Respiratory Tract Pathogens Resistance mechanism: Beta-lactamase Altered PBPs M. catarrhalis H. influenzae S. pneumoniae 20/11/2018
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M.catarrhalis ATB BL+ ( 70%) BL-(30%) Aminopenicilline R S
AminoP+Inhib CEFADROXIL CSP2,3 Macrolides Tetracycline
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SOUCHES HOSPITALIERES
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Staphylocoques Streptocoques Enterocoques Entrobactéries Autres BGN
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INFECTIONS NOSOCOMIALES
Bactériémies : ……………………………15% Pneumonie post ventilation :…………… 21% Infection urinaire (UTI) : …………………38% Infection respiratoire basse : ……………..4% Infections gastro intestinales , cutanées, cardiovasculaires : ………………………10% Infections du site opératoire : …………..10% Infections respiratoires hautes : ………….2%
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INFECTIONS URINAIRES Enterobactéries : …………….50% GNNF : ……………………….35%
Enterocoques : ……………...10% Autres : ……………………….5%
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BACTERIEMIES NOSOCOMIALES
Enterobacteries : ………………..50% Enterocoques : ………………….11% Staphylococcus aureus : ………12% Staphylocoques CN : …………..10% Pseudomonas : ………………….11% Acinetobacter : …………………...5% Autres : ……………………………1%
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INFECTIONS DU SITE OPERATOIRE
S aureus : ………………………………20% Pseudomonas : ………………………..16% Staphylocoques CN : ………………….15% Enterobacteries : ……………………… 25 Enterocoques: ………………………….12 Autres BGN : …………………………...12
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SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES
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Staphylococcus aureus
ATB MehiR 43%) Methi S(57%) Aminopenicilline R S AminoP+Inhib CSP2,3 Macrolides Tetracycline Aminosides S/R
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Streptocoques ATB Enterococcus(84) Streptococcus(359) Aminopenicilline
AminoP+Inhib S(72%) CSP1,2,3 S( 76%) Macrolides Tetracycline
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Klebsiella pneumoniae
ATB Souches Klebsielles Béta-lactamines Aminosides Quinolones Cotrimoxazole Sauvages (12%) S R PHN ( 22%) MS BLSE (63%)
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Pseudomonas aeruginosa
ATB Souches Béta- lactamines Aminosides Quinolones Sulfa- triméto Sauvages (40%) R S Pénicillinase Haut niveau (28%) Céphalosporinase (16%) R/MS
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SOUCHES ENTEROPATHOGENES
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Données sur les bactéries entéropathogènes: Tendances et Antibiorésistance
Les données sur les les bactéries entéropathogènes proviennent du Centre National Sénégalais des Entérobactéries (CNSE) sis à l’Institut Pasteur de Dakar. Missions du CNSE: Assurer pour l’ensemble des structures sanitaires du Sénégal l’identification complète et l’antibiogramme des souches d’entérobactéries, en particulier les salmonelles et les shigelles, Suivre l’évolution épidémiologique des souches et de leur résistance aux antimicrobiens
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Salmonella: Entre 1999 et 2007, le CNSE a collecté 1426 souches de salmonelles dont 985 d’origine humaine et 441 d’origine alimentaire.Quatre nouveaux sérotypes ont été identifiés : Salmonella Keurmassar, Salmonella Ketiabargny, Salmonella Yombesali, Salmonella Yagounasally. Tous ces nouveaux sérotypes ont été isolés exclusivement de l’alimentation, à l’exception de Salmonella Keurmassar présent également dans des prélèvements d’origine humaine.
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Grande sensibilité des souches aux antibiotiques testés.
Cependant des résistances inquiétantes ont été notées chez les souches de Salmonella Agona, Kentucky et Keurmassar isolées d’aliments: production d’une BLSE : le typage moléculaire a révélé la circulation au Sénégal de BLSE de type CTX-M15, SHV-12 d’intégrons: éléments génétiques mobiles porteurs de facteurs de résistance et capables de les disséminer au sein du monde bactérien et portant des cassettes. Des intégrons de classe 1 ont été détectés chez S. Keurmassar avec des cassettes codant la résistance à la streptomycine (gènes de résistance aadA) et la cassette codant la codant la résistance à l’érythromycine (gène de résistance ereA2), une macrolide largement utilisée en antibioprophylaxie dans les élevages de poulets de chair au Sénégal.
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Shigella: Entre 1999 et 2007, le CNSE a reçu 538 souches de shigelles, toute d’origine humaine.La tendance au niveau des sérotypes montre un recul de flexneri . Le sérotype sonnei prend la place de leader. L’épidémiologie de la résistance aux antibiotiques est caractérisée par une résistance importante vis-à-vis des cyclines et du cotrimoxazole, pour l’ensemble des espèces et une circulation de souches avec une diminution de la sensibilité aux quinolones.
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