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Publié parMarie-Laure Éthier Modifié depuis plus de 6 années
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L’identification des micro-organismes par spectrométrie de masse type « MALDI-TOF »
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Matrix Time Assisted Of Laser Flight Desorption Ionization
Séparation différentielle d’ions en fonction de leur rapport m/z Obtention d’un spectre spécifique de l’échantillon analysé
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Les appareils disponibles sur le marché…
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Mode opératoire du dépôt…
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La matrice… c’est quoi… ?
UNE MOLECULE ACIDE ELLE CEDE UN PROTON
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Que se passe-t-il dans l’appareil…?
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Que se passe-t-il dans l’appareil…?
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L’acquisition du résultat sous forme de spectre
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Comparaison aux collections de spectres… détermination du score
< 1,7 : absence d’identification 1,7<score<2 : identification au genre ou plusieurs espèces possibles Analyses supplémentaires. 2 : identification de l’espèce.
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Identification d’une souche pathogène…
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Les avantages… RAPIDITE EVIDENTE
GAIN DE PLUSIEURS HEURES A PARTIR DE LA CULTURE SUR GELOSE réduction d’un facteur 55 ! Remarque: levures, moisissures, mycobactéries… protocole spécifique à cause de la composition pariétale : délai légèrement plus long à partir de la culture.
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Les avantages… COÛT REDUIT !
Réduction d’un facteur 5 à 10 pour les coûts par rapport aux analyses biochimiques conventionnelles, et d’un facteur 90 par rapport aux analyses de biologie moléculaire.
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Des difficultés d’identifications peuvent apparaître en cas :
Quelques inconvénients… Des difficultés d’identifications peuvent apparaître en cas : MAIS AUSSI…
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D’où la bonne qualité d’un geste technique simple…
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Quelques inconvénients…
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Les résultats de niveau de confiance moyen…
Expérience du technicien: contexte clinique (urine, selle?), caractère biochimique simple… (Shigella lac - / E.coli lac +)
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Les résultats de « pathogènes critiques »…
Expérience du technicien: sérotypage obligatoire… technique de base qui doit être maîtrisée !
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