Jour 3 : La numérisation des données sur la biodiversité.

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1 Jour 3 : La numérisation des données sur la biodiversité

2 Sommaire Linfrastructure informatique du GBIF Rôle et importance des nœuds GBIF (Mélianie) Présentation du nœud français

3 Qui suis-je? Delphine Gasc (gasc@gbif.fr) Ingénieur Bio-informatique Au GBIF depuis avril 2009

4 Linfrastructure informatique du GBIF

5 Base de données Collection Observation ET APRES?

6 DiGIR / BioCASe / TAPIR/ IPT occurrence record taxon concept indexing DB raw occurrence record extraction occurrence record taxon concept portal DB working copy raw occurrence record processing harvesting metadata logs Darwin Core ABCD UDDI names copy occurrence record taxon concept portal DB live system raw occurrence record swap Data Portal UI web services registration Provider domainInternet Internet / public GBIF / non-public MapServer status until summer 2009

7 Normaliser les données GBIF : Réseau mondial Besoin dun langage commun à toutes les données Adapter linformation au réseau Wrappers (IPT, Biocase, …) Standards (ABCD, Darwin Core)

8 Connecter les données Index : Annuaire des données Récupère les informations générales Connexion directe aux données

9 Diffuser les données Portail international Publication des données Géoréférencement http://data.gbif.org/

10 Le Portail GBIF

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12 Quelles informations? Données sur la présence despèces (spécimens ou observations) Noms Noms scientifiques & classification Noms vernaculaires

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22 Recherche filtrée Autre exemple : répartition géographique de Hirundo rustica (hirondelle de cheminée) à différentes périodes de l'année

23 Quelle utilisation? Prédire la distribution despèces selon divers scénarios de changement climatique, écologique, etc. Prévoir des sites pour la protection de la biodiversité, etc. Anticiper les régions nécessitant des actions précises (combattre les espèces invasives, mettre en place des mesures sanitaires, etc)

24 Le nœud GBIF France

25 Sommaire Historique Présentation de léquipe Objectifs Difficultés

26 Nœud GBIF France Mis en place en 2006 Situé au Musée dHistoire Naturelle de Paris 3 ème fournisseur en nombre doccurrences du GBIF

27 Léquipe du GBIF France Responsables : Eric Chenin et Régine Vignes Communication : Anne-Sophie Archambeau Technique et développement informatique : Delphine Gasc et Michael Akbaraly

28 Objectifs Connecter les données Identifier et contacter les fournisseurs de données du pays Développer des outils utiles à la communauté GBIF

29 Portail GBIF France