MASTER Bio-ingénieur : Chimie et bio-industries (Faculté AGRO)

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Jours des visites des groupes des promoteurs
(12h45 – 14 h) ELI/ELIM Je 14/11 S. Declerck & J. Mahillon Lu 18/11 P. Gerin & S. Agathos (local A+016) IMCN (local A+016, tour Boltzmann) Ve 15/11 Y. Dufrêne, Ch. Dupont & cie E. Gaigneaux, D. Debecker ISV/FYMO Me 13/11 M. Ghislain, M. Boutry & cie

Biologie Ingénierie

Ingénierie chimique Développement de (bio)catalyseurs,
conversion-valorisation & récupération de (bio)molécules importantes pour la chimie, la dépollution l ’eau, le sol ou l’air & la production d’énergie renouvelable Elaboration et caractérisation de (bio)surfaces à l’échelle du nanomètre, amélioration et mise en œuvre Chimie des flaveurs  identification, propriétés et améliorations des procédés : vin, chocolaterie, brasserie

Ingénierie chimique Techniques/Outils : Chromatographie GC & HPLC
Méthodologies sensorielles Spectroscopies & microscopies MS, RMN, AFM, XPS, Raman, IR,… Synthèse de matériaux organiques et inorganiques Cultures cellulaires Nanobiotechnologies et nanofabrication Réacteurs (bio)catalytiques

Ingénierie chimique Applications types:
Elimination (bio)catalytique des polluants de l’air et de l’eau Synthèse de molécules pour parfumerie & pharmacie Exploitation des (bio)ressources renouvelables d’énergie et de molécules Développement de biomatériaux Optimisation de l’utilisation de nouvelles variétés de houblon pour le développement d’arômes exotiques (dry hopping, refermentation ..) Développement d’aliments santé enrichis en polyphénols (chocolat, ..)

Ingénierie biologique
Génétique des bactéries opportunistes et pathogènes Etude des champignons filamenteux, levuriens et mycorhiziens à arbuscules Mécanismes cellulaires (transport, trafic intracellulaire, réponses aux contraintes) chez la levure et les plantes Ecologie microbienne, bioconversion microbienne et conception de bioprocédés

Applications types: Techniques/outils:
Détection de pathogènes alimentaires Production de protéines pharmacologiques en cultures cellulaires et de bio-effecteurs dans le contrôle des organismes pathogènes Biodégradation des toxines/polluants et bio-traitements Bioconversion de biomasse et résidus en produits utiles Techniques/outils: Biologie moléculaire et cellulaire, biochimie, microbiologie, physiologie, Génie génétique, bioréacteurs, mycothèque

Instituts des promoteurs « BIRC » ISV Institut des sciences de la vie ELI Earth & Life Institute IMCN Institut de la matière condensée et des nanosciences

Groupes et thèmes de recherche des promoteurs ELIM : Applied Microbiology BRASserie et industries alimentaires MICRObiologie GENIE biologique ELI Earth & Life Institute

Chimie des flaveurs INBR : Brasserie et industries alimentaires
S. COLLIN Croix du Sud – Bâtiment Mendel – Etage 2 Chimie des flaveurs Identification de composés organoleptiquement actifs par GC-olfactométrie, GC-MS, HPLC/MS/MS et analyse sensorielle (chocolat, vin, bière, miel, olives etc) Compréhension des mécanismes chimiques et biochimiques impliqués dans la production et la dégradation des arômes et des polyphénols Recherche des relations structure-propriétés olfactives

Chimie des flaveurs (suite)
INBR : Brasserie et industries alimentaires S. COLLIN Croix du Sud – Bâtiment Mendel – Etage 2 Chimie des flaveurs (suite) Contrôle du vieillissement des denrées et apport d’un effet santé par un enrichissement en polyphénols (flavonoïdes, resvératrol ..) Chimie brassicole Contrôle du vieillissement de la bière Qualités aromatiques (thiols polyfonctionnels) et antioxydantes du houblon Amélioration des procédés (refermentation en bouteille, dry hopping ..)

Ingénierie cellulaire et microbiologique
GENIE : Génie Biologique S. AGATHOS P. GERIN Croix du Sud – Bâtiment Mendel – Etage 0 Ingénierie cellulaire et microbiologique Conception de bioréacteurs et bioprocédés Bioconversions catalysées par des micro- organismes et des enzymes Bioconversion (fermentation) de biomasses, récupération de molécules “bioraffinées” pour la chimie verte et les énergies renouvelables: enzymes, caroténoïdes, éthanol, acides organiques, méthane,…

GENIE : Génie Biologique
S. AGATHOS P. GERIN Croix du Sud – Bâtiment Mendel – Etage 0 Biodégradation de molécules toxiques pour l’environnement Chimie verte et bioraffinage: Fonctionalisation biocatalysée de biopolymères Formation d’héterocycles via biocatalyse hétérogène Production des biomolécules par des algues Bioconversion de substrats en molécules de base pour la chimie Ecologie microbienne moléculaire et bioprospection dans des milieux complexes (sols, eaux, eaux usées, boues d’épuration, digestats) Traitement des eaux usées, des boues d’épuration et des résidus organiques grâce à des enzymes, des bactéries et des fungi Production de protéines recombinantes par des cellules animales

Mycologie MICRO : Microbiologie - Mycologie
S. DECLERCK Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Et 1 Mycologie Etude des champignons mycorhiziens: biodiversité, impact des changements climatiques, rôle dans la protection des plantes contre les stress biotiques & abiotiques, dialogue moléculaire hôte/champignon, applications agro-environnementales Identification / systématique / classification (taxonomie, phylogénie par voie classique et moléculaire, biogéographie) des levures, champignons filamenteux et mycorhiziens Diversité fongique dans les environnements naturels et anthropisés

Mycologie MICRO : Microbiologie - Mycologie
S. DECLERCK Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Et 1 Mycologie Développement de méthodes de détection in situ des mycètes (dans les environnement naturels, anthropisés, confinés) par des outils moléculaires (ex : pyroséquençage) Développement des méthodes de préservation des mycètes (organismes récalcitrants, consortia…) Caractérisation physiologiques (étude ciblée des propriétés spécifiques des organismes fongiques – ex. bioeffecteurs dans le contrôle des pathogènes…)

MICRO : Microbiologie - Bactériologie
J. MAHILLON Croix du Sud – Bâtiment Kellner – Et +1 Bactériologie et Génétique bactérienne Flexibilité génomique et virulence différentielle au sein du groupe Bacillus cereus: étude des phages, plasmides et gènes de virulence (toxines émétiques et diarrhéiques) Détection, caractérisation et typage moléculaire de bactéries opportunistes et pathogènes alimentaires: B. cereus et Listeria monocytogenes Biofilms de Staphylococcus epidermidis, B. cereus et Listeria spp.: formation, dynamique, contrôle, et lieu de transferts génétiques Archées dans les aliments: détection et caractérisation moléculaire Approches expérimentales Microbiologie alimentaire, biologie moléculaire, génétique bactérienne, génie génétique, écologie microbienne, laboratoire de biosécurité L2+

Groupes et thèmes de recherche des promoteurs MOST – MOlecules Solids & reactiviTy  Catalyse et chimie des solides inorganiques BSMA – Bio & Soft MAtter  Surfaces IMCN Institut de la matière condensée et des nanosciences

MOST : Catalyse & chimie des solides inorganiques
E. GAIGNEAUX, D. DEBECKER Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Etages 0 et 1 Mettre au point/optimiser des catalyseurs, en comprendre leur fonctionnement, pour :  protéger l’environnement: Détruire les polluants de l’air (aromatiques, dioxines, composés organiques volatils) Transformer le CO2 en molécules à + haute valeur  servir la chimie fine et la chimie bio-sourcée : Fabriquer des molécules utiles en parfumerie et pharmacie Fabriquer des molécules d’intérêt industriel à partir de biomasse (lactochimie et oléochimie)

MOST : Catalyse & chimie des solides inorganiques
E. GAIGNEAUX, D. DEBECKER Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Etages 0 et 1  développer des sources renouvelables d’énergie : Produire des bio-carburants (par exemple : DME) (à partir de biomasse / molécules bio-sourcées) Outils utilisés : Synthèse de matériaux inorganiques nanostructurés = catalyseurs hétérogènes et adsorbants cellulaires/enzymatiques Caractérisation physico-chimique spectroscopies: IR, Raman, XPS microscopies: e-, AFM-STM, etc Mesures de performances en réacteurs catalytiques

Nanomicrobiologie BSMA : groupe SURFACES
Y. DUFRENE Croix du Sud – Bâtiment Botzmann – Etage 0 Nanomicrobiologie Développement de nouveaux outils pour les nanotechnologies: nano-imagerie en temps réel de cellules vivantes, manipulation et reconnaissance de molécules uniques Propriétés des cellules microbiennes à l’échelle du nanomètre: mécanismes moléculaires de l’adhésion cellulaire, applications médicales: interactions pathogène-hôte et pathogène-médicament

Protéines et cellules aux interfaces
BSMA : groupe SURFACES Ch. DUPONT Croix du Sud – Bâtiment Botzmann – Etage 0 Protéines et cellules aux interfaces Elaboration de surfaces nanostructurées nanolithographies, couches minces de polymères Maîtrise de l’organisation des protéines adsorbées auto-assemblage, supports nanostructurés, imagerie à l’échelle du nanomètre Evaluation du comportement cellulaire sur les bio-interfaces élaborées cultures cellulaires, microscopie, activité métabolique des cellules

D’autres possibilités …
IMCN/MOST : Pr T. Leyssens  Cocristallisation comme moyen de purification (domaine pharmaceutique, en industrie)  Etude théorique/cinétique/mécanistique en catalyse homogène Pr M. Devillers  Chimie de coordination appliquée à la préparation + Pr Y. Garcia de matériaux inorganiques et hybrides fonctionnels + Pr S. Hermans (catalyseurs hétérogènes, conducteurs ioniques, pigments, + Pr O. Riant matériaux luminescents) IMCN/BSMA : Pr A. Delcorte  Analyse de surface par TOF-SIMS + Pr S. Demoustier + Pr A. Jonas + Pr K. Glinel + … Tout (co-)titutaire d’un cours obligatoire dans le programme BIRC peut être votre promoteur de mémoire

Groupes et thèmes de recherche des promoteurs ISV Institut des sciences de la vie Croix du Sud – Carnoy B et C Etage 3 FYMO  Physiologique moléculaire H. BATOKO, M. BOUTRY, F. CHAUMONT, M. GHISLAIN, P. MORSOMME

FYMO : Physiologie moléculaire
Comprendre des mécanismes biologiques chez les levures et les plantes : la première étape vers les applications Thèmes: Marc Boutry - Transporteurs de drogues multiples chez les plantes: caractérisation enzymatique et amélioration de la sécrétion de métabolites d’intérêt pharmacologique - Optimisation de la production de protéines (anticorps, immunotoxines, vaccins) dans des cellules végétales

François Chaumont Rôle physiologique des aquaporines chez le maïs : caractérisation moléculaire et biophysique dans des plantes dérégulées pour l’expression d’aquaporines Régulation du trafic subcellulaire : abondance des aquaporines dans les membranes cellulaires Henri Batoko Rôle de la protéine membranaire de plante TSPO dans la protection contre les stress: conditions d’expression, détoxification des porphyrines libres, dégradation et caractérisation des partenaires et ligands endogènes

Pierre Morsomme Etude d’un transporteur de Ca2+ chez la levure pour comprendre une maladie génétique humaine Trafic intracellulaire de protéines/lipides dans la levure Michel Ghislain Régulation de l’expression de transporteurs membranaires de levure, responsables de la résistance aux anti-fongiques: identification des transactivateurs et étude de la dégradation par le système ubiquitine-protéasome Approches spécifiques Expression hétérologue Purification de protéine, reconstitution membranaire, liposome Spectrométrie de masse, imagerie cellulaire (microscope confocal et sondes fluorescentes), génomique

Lints ARAEBUL AIALv Cera De Vuyst Remise de prix pour mémoires AGRO
Bioingénieurs à l’honneur - 12/12/13 (19h30) Lints ARAEBUL AIALv Cera De Vuyst

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