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Conférence du 7 juin 2005 Professeur Jean-François LEMELAND Chef de service du laboratoire de microbiologie du Centre Hospitalier Universitaire de Rouen
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Les mécanismes génétiques d’acquisition des facteurs de virulence et de résistance aux antibiotiques chez les bactéries Conséquences médicales et écologiques
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Mise sur le marché –Pénicilline (1942) –Méticilline (1961) –Ampicilline (1962) –Céphalosporine (1980 ) Résistance découverte –Staphylocoque doré (1943) –Staphylocoque doré (1962) –Entérobactéries (1964) –Entérobactéries (1981)
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PNEUMOCOQUES
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X AB 2 1 4 3 Excrétion par efflux actif Diminution de la pénétration Modification de la cible Inactivation enzymatique AB Mécanismes de résistance aux antibiotiques AB Mutation Acquisition de gènes AB
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Gènes de résistance aux antibiotiques Cassettes et intégrons Transposons Chromosomes et plasmides Transformation Transduction Conjugaison
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Origine des gènes de résistance Mutation : diminution pénétration, affinité pour la cible … (20%) Gènes présents chez bactéries produisant l’AB : enzymes inactivantes Gènes domestiques, dont rôle métabolique pas toujours déterminé : pompe à efflux et détoxification
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Cassette Élément mobile capable d’être intégré ou exisé par une intégrase –Un gène –Un site de recombinaison attC reconnu par l’intégrase
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Intégron Gène intI codant pour intégrase Site d’attachement attI Promoteurs P1 – P2…
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Nature et expression des cassettes Concerne de nombreux gènes de résistance Concerne de nombreuses espèces bactériennes
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Expression tributaire de la position par rapport au promoteur Réarrangement des cassettes par pression des antibiotiques
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Origine des intégrons Énigme Proviendraient de super-intégrons dans chromosomes contenant une centaine de cassettes, sans fonction connue (cadres ouverts de lecture)
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Transposon Segment d’ADN pouvant se déplacer Séquences d’insertion Capable de promouvoir leur transfert à partir d’un élément génétique (chromosome ou plasmide) = transposition
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Différences entre intégrons et transposons Pas de séquences inversées répétées aux extrémités des intégrons Intégrons incapables de se mobiliser
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capture des intégrons par les transposons mobilisation des gènes de résistance
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Plasmide Formation circulaire d’ADN extrachromosomique Très fréquent chez les bactéries
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Plasmide Gènes de réplication autonome Gènes de transfert : conjugaison Gènes de résistance, de virulence… Transposons
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Différences entre transposons et plasmides Transposons incapables de se répliquer de manière autonome Transposons incapables de s’exprimer et d’exister en dehors du chromosome où d’un plasmide
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En résumé Gènes de résistances situés sur des cassettes dans les intégrons, incapables de transposer Intégrons généralement portés par des plasmides Intégrons peuvent aussi être véhiculés par des transposons Conséquence : accumulation de gènes de résistance = multirésistance
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Transferts génétiques entre les bactéries Transformation Transduction Conjugaison
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Prescriptions inappropriées Mauvais choix de la molécule Posologies inadaptées Durées excessives ou insuffisantes
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Fautes majeures Ne pas prescrire d’antibiotiques lorsqu’ils sont nécessaires, tout autant que les prescrire par excès en cas de doute ou par sécurité, sans arguments clairement définis
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Virulence Îlots de pathogénicité Regroupement de 15 à 25 gènes concernés par activité de virulence Peu mobiles
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Anciennes maladies –Peste –Choléra –Diphtérie Nouvelles maladies –Légionellose –Maladie de Lyme –Helicobacter pylori –Escherichia coli O157 H7 –Streptocoques nécrosants
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Questions ? Les bactéries résistantes sont-elles plus virulentes ? Plutôt non, mais résistance augmente la mortalité Les bactéries virulentes sont-elles plus résistantes ? Plutôt non : méningite, typhoïde…
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« Les maladies infectieuses sont les compagnes fatales, constantes de notre vie… » « Il en naîtra de nouvelles : celles qui subsisteront ne se monteront plus sous les formes que nous leur connaissons aujourd’hui » Charles Nicolle, 1932
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