Article: Estimates of genetic and phenotypic parameters of some growth traits in Common African and Alpine crossbred goats. Duchêne Romain TP paraclinique.

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1 Article: Estimates of genetic and phenotypic parameters of some growth traits in Common African and Alpine crossbred goats. Duchêne Romain TP paraclinique de 2° doctorat Marichal Thomas Service de génétique quantitative Sizaire Benoît

2 1.Introduction Objectif: estimation de paramètres génétiques et phénotypiques (corrélations, héritabilité) de certains traits de croissance (PC, GQM) Objectif: estimation de paramètres génétiques et phénotypiques (corrélations, héritabilité) de certains traits de croissance (PC, GQM) Mesures provenant dun projet français afin daméliorer le potentiel génétique de la race caprine africaine commune Mesures provenant dun projet français afin daméliorer le potentiel génétique de la race caprine africaine commune

3 2. Matériel et méthode Espèce: caprine Espèce: caprine Race – effectif: Race – effectif: – race commune africaine (CA) 838 chevreaux – croisés entre race alpine française (AF) (16 géniteurs mâles de lignée pure) et race commune africaine (géniteurs femelles): 688 chevreaux

4 2. Matériel et méthode 1)16 boucs AFXchèvres CA (IA) (IA) 688 CA - AF 688 CA - AF 2) boucs CAXchèvres CA (aléatoire) (aléatoire) 838 CA 838 CA

5 2. Matériel et méthode Standardisation des conditions environnementales pour tous les animaux étudiés Standardisation des conditions environnementales pour tous les animaux étudiés Mesures sur les chevreaux: Mesures sur les chevreaux: –PC de la naissance à J 210 réparti en 8 classes PC 0 – PC 30 – PC 60 – PC 90 – PC 120 – PC 150 – PC 180 – PC 210 PC 0 – PC 30 – PC 60 – PC 90 – PC 120 – PC 150 – PC 180 – PC 210 –GQM de la naissance à J 210 réparti en 8 classes GQM 1 – GQM 2 – GQM 3 – GQM 4 – GQM 5 – GQM 6 – GQM 7 – GQM 8 GQM 1 – GQM 2 – GQM 3 – GQM 4 – GQM 5 – GQM 6 – GQM 7 – GQM 8

6 2. Matériel et méthode Ajustement des données Ajustement des données Utilisation des mesures sur les « croisés » afin destimer: Utilisation des mesures sur les « croisés » afin destimer: –Lhéritabilité des 16 paramètres (8-PC et 8- GQM) –La corrélation génétique –La corrélation phénotypique entre ces paramètres

7 2. Matériel et méthode Méthodes statistiques: Méthodes statistiques: –h²: paternal half sibs (PHS): demi-sœurs paternelles: modèle père h²= 4 sigma²s / sigma²t h²= 4 sigma²s / sigma²t sigma²s= variance entre pères sigma²s= variance entre pères Sigma²t = variance totale = variance intra-père + variance entre-père Sigma²t = variance totale = variance intra-père + variance entre-père –Corrélations: r (X,Y) = cov (x,y)/ (var(x) ¤ var(y)) 0,5 r (X,Y) = cov (x,y)/ (var(x) ¤ var(y)) 0,5

8 3. Résultats et discussion 1. Etude des effets 1. De la race du géniteur 2. Du genre des chevreaux 3. Du type de naissance des chevreaux 4. De lâge de la génitrice sur le PC (8 classes) et le GQM (8 classes) des chevreaux

9 Interprétation des moyennes et erreurs standards des PC en fonction de la race du géniteur, du genre, du type de naissance et de lâge de la mère.

10 3. Résultats et discussion PC: nous remarquons que: PC: nous remarquons que: –La race des progéniteurs (race AF > race CA) représente la principale source de variation, avec un avantage notable (P race CA) représente la principale source de variation, avec un avantage notable (P<0,001) pour la race AF de J60 à J210 –Le genre (mâle > femelle) est assez significatif (P femelle) est assez significatif (P<0.05) de J0 à J90 –Les naissances simples sont significativement avantagées (P<0.05) par rapport aux autres à J210 seulement –Lâge important de la génitrice (8 ou 9 ans) donne également un avantage significatif (P<0.05) aux chevreaux à partir de J120

11 Interprétation des moyennes et erreurs standards des GQM en fonction de la race du géniteur, du genre, du type de naissance et de lâge de la mère.

12 3. Résultats et discussion GQM: les mêmes constatations peuvent être faites avec les moyennes des GQM; la race des progéniteurs représente la principale source de variation avec un net avantage pour la race AF. GQM: les mêmes constatations peuvent être faites avec les moyennes des GQM; la race des progéniteurs représente la principale source de variation avec un net avantage pour la race AF.

13 3. Résultats et discussion Tableau résumant les corrélations génétiques et phénotypiques ainsi que les héritabilités des paramètres étudiés

14 3. Résultats et discussion 2. Estimation de lhéritabilité: - PC: les paramètres les plus héritables (0.68, 0.68 et 0.54) sont: PC0, PC30 et PC60 - GQM: les paramètres les plus héritables (0.45, 0.44 et 0.32) sont: GQM2, GQM3 et GQM 4 - Intérêt de faire de la sélection de masse sur le PC dans la période de J0 à J60

15 3. Résultats et discussion Tableau résumant les corrélations génétiques et phénotypiques ainsi que les héritabilités des paramètres étudiés

16 3. Résultats et discussion - ° Corrélations phénotypiques: - entre le PC 0 et les autres PC: positives et hautes (P<0.01) et diminution avec laugmentation de lâge - entre les PC et les GQM: positives et hautes ° Corrélations génétiques : - entre les PC et les GQM: positives et hautes SAUF: ° GQM 6 et PC de J0 à J90 ° GQM 7 et PC de J0 à J90

17 3. Résultats et discussion ---- La corrélation négative observée entre GQM 6-7 et le PC nous montre limportance deffectuer la sélection avant le sevrage ---- La corrélation négative observée entre GQM 6-7 et le PC nous montre limportance deffectuer la sélection avant le sevrage ---- ainsi, la corrélation génétique observée va permettre, en sélectionnant sur le poids au plus jeune âge, datteindre le poids de commercialisation dans un délai plus bref (pléiotrophie) ---- ainsi, la corrélation génétique observée va permettre, en sélectionnant sur le poids au plus jeune âge, datteindre le poids de commercialisation dans un délai plus bref (pléiotrophie)

18 4. Conclusion – intérêt dans la profession Les chevreaux croisés CA-AF présentent un avantage pondéral significatif par rapport à la race CA Les chevreaux croisés CA-AF présentent un avantage pondéral significatif par rapport à la race CA La sélection sur le PC va permettre une amélioration du GQM des chevreaux, au vu de la corrélation génétique positive entre ces paramètres. La sélection sur le PC va permettre une amélioration du GQM des chevreaux, au vu de la corrélation génétique positive entre ces paramètres.

19 5. Critique Pour chaque résultat obtenu, lauteur sappuie sur dautres études réalisés auparavant; démarche très scientifique. Pour chaque résultat obtenu, lauteur sappuie sur dautres études réalisés auparavant; démarche très scientifique. Les résultats, bien que non identiques, suivent malgré tout la même tendance; lauteur justifie ces écarts par lutilisation de méthodes statistiques différentes (ig régression de la descendance sur les parents vs PHS), les erreurs déchantillonnage, … Les résultats, bien que non identiques, suivent malgré tout la même tendance; lauteur justifie ces écarts par lutilisation de méthodes statistiques différentes (ig régression de la descendance sur les parents vs PHS), les erreurs déchantillonnage, … Les effectifs de départ étant relativement élevés, ils ne représentent pas une source de biais notable. Les effectifs de départ étant relativement élevés, ils ne représentent pas une source de biais notable.

20 6. Bibliographie Estimates of genetic and phenotypic parameters of some growth traits in Common African and Alpine crossbred goats; M. Mourad, M.R. Anous Estimates of genetic and phenotypic parameters of some growth traits in Common African and Alpine crossbred goats; M. Mourad, M.R. Anous Cours de génétique quantitative de 1° doctorat; J. Detilleux Cours de génétique quantitative de 1° doctorat; J. Detilleux Cours de statistique de 1° et 2° candidature; P. Leroy, F. Farnir Cours de statistique de 1° et 2° candidature; P. Leroy, F. Farnir