NF-kB : simulations stochastiques

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1 NF-kB : simulations stochastiques
Alain Lilienbaum UMR 7000 Groupe « Voies de signalisation du stress du cytosquelette » Faculté de médecine La Pitié - Salpétrière 105, bd. de l’hôpital PARIS

2 LE FACTEUR DE TRANSCRIPTION NF-kB
Signaux FACTEURS DE TRANSCRIPTION Start Stop Eléments de contrôle GENE A Transcription ARN messager Traduction A A A Protéines A A A A A

3 Rôles Biologiques du Facteur NF-kB
Réponse immunitaire Inflammations Survie face aux stress (oxydoreductions, ionisations,…) Traumatismes neurologiques, maladie d’Alzheimer, maladie de Parkinson, cancers, arthrites rhumatoïdes. - Plus d’une centaine de gènes « cibles » identifiés. - Recherche d’agents inhibiteurs spécifiques.

4 NF-kB Agents mitogènes Cytokines Facteurs de stress
Produits viraux et bactériens PMA, Facteurs de croissance … TNFa, IL1, IL2 … ROS, UV, RX Taxol … VIH, HTLV I EBV, CMV … NF-kB Immuno Récepteurs Cytokines, F.C. Adhérence cellulaire S Redox. Virus CMH, TCR IL2Ra … TNFa, IL2, IL6, IL8 … ELAM1 VCAM1 ICAM1 SOD NOS-i GST VIH CMV SV40

5 Mitogènes TGFb LPS T b R Cytokines PKC NAK PAK TAK NIK MEKK IKK NF-kB Gènes cibles

6 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

7 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB SIGNAUX Récepteurs Voies de
signalisation Gène A Gène B Gène C

8 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB SIGNAUX Récepteurs Voies de
signalisation Gène A Gène B Gène C

9 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

10 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB IkBa p50 p65 IkBb (p52, c-Rel, RelB) (IkBe, IkBg, Bcl3, p105, p100) p52

11 SITES DE FIXATION DE NF-kB
Immunoglobulines Igk : GGGACTTTCC c-myc : GGGAAAACCC TNFa : GGGAATTCAC IL8 : GGAATTTCCT

12 NF-kB actif (nucléaire)
0 0, , , ,0 2,5 temps (h)

13 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène IkB

14 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

15 RESEAUX DE GENES Le facteur NF-kB Récepteurs Gène A Gène B Gène C

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17 t < tmax t n (Réaction n) t = t + t Réaction n : (A + B -> AB)
Fonction Pseudo-aléatoire t = t + t Réaction n : (A + B -> AB) A = A - 1 B = B - 1 AB = AB + 1

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