LE DESEQUILIBRE DE LIAISON

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1 LE DESEQUILIBRE DE LIAISON

2 Si l'on considère deux loci, il faut pour étudier l'évolution simultanée des deux loci, introduire un nouveau concept, celui du déséquilibre de liaison , "linkage desequilibrium" ou "association génétique" ou encore "association allélique

3 Considérons que les deux loci étudiés sont di-alléliques : A et a sont les allèles du premier locus, pA et pa leurs fréquences géniques ; B et b les gènes du deuxième locus pB et pb leurs fréquences géniques.

4 Pour deux Gènes Si PAB est la fréquence des gamètes porteurs des gènes A et B, le déséquilibre de liaison est :  D = PAB - pA  pB Si D = 0, PAB = pA  pB Si D  0 On dit qu'il y a déséquilibre de liaison.

5 Si l’on considère 2 gènes et leurs allèles : 4 gamètes possibles
La relation peut prendre la forme D = PAB  pab - pAb  paB PAB, Pab, PAb, PaB sont alors les fréquences des 4 combinaisons gamétiques.

6 La valeur minimale ou maximale de D dépend de la fréquence des gènes.
Si D > 0, la valeur maximale de D est :  pB (1 - pA) si pA  pB  ou   pA (1 - pB) si pA  pB

7 Si D  0 la valeur maximale en valeur absolue est la plus petite des deux valeurs pA pB et pa pb  Notons que si D = - pA pB > PAB = 0 D peut être positif ou négatif, son intervalle de variation est : - 0,25  D  0,25

8 Soit les fréquences alléliques à deux loci
M = 0,6 a = 0,8 m = 0,4 4 possibilités Si équilibre de liaison PAM = 0.2  0.6 = 0.12 PAm = 0.2  0.4 = 0.08 PaM = 0.8  0.6 = 0.48 0.8  0.4 = 0.32 1.00

9 Dans une population donnée on peut observer
AM = 0.04 Am = 0.16 aM = 0.56 am = 0.24  entre les fréquences observées et calculées DL = F. observée – F. calculée AM ; D = 0.04 – 0.12 Am ; D = 0.16 – 0.08 aM ; D = 0.56 – 0.48 am ; D = 0.24 – 0.32

10 Si PAM = 0 , dans une autre population
le déséquilibre de liaison est ; |0.2x0.6| D = | 0.12 |