Travaux pratiques de mycologie

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1 Travaux pratiques de mycologie
Veronica RODRIGUEZ-NAVA – Aymeric MENARD – Frédéric LAURENT Patrick BOIRON Laboratoire de Mycologie Faculté de Pharmacie, Lyon, France

2 Classification Spores Asexuée Sexuée Zygospores Zygomycètes Endospores
Ascospores Ascomycètes Conidies Basidiospores Basidiomycètes Deutéromycètes

3 Champignons inférieurs
Classe des Zygomycètes

4 Les Zygomycètes Les champignons de la Classe des Zygomycètes sont caractérisés par : Un mycélium non cloisonné (= siphonné = cœnocytique) Une multiplication asexuée par endospores : sporocystospores Une reproduction sexuée : zygospore

5 Intérêts des Zygomycètes
Moisissures communes : agents de pourritures et d’altérations alimentaires (Mucor, Absidia, Rhizopus, Rhizomucor, …) Mycoses humaines, peu fréquentes mais graves : mucormycoses (Rhizopus, …) Industries agro-alimentaires : Fermentation de l’amidon en anaérobiose : alcool de riz, de pomme de terre, … (choum choum, whiskys, vodkas, schnaps, …) Affinage de certains fromages (Cantal), galettes de soja (Tempeh) Industries chimiques et pharmaceutiques : Production d’acides aminés, acide lactique, présure, vitamine A, … Bioconversion des stéroïdes

6 Absidia glauca Absidia Mucor Sporocyste Aspect macroscopique Apophyse
Columelle Mucor Sporocystophore

7 Zygorhynchus heterogamus
Suspenseurs

8 Les Rhizopus (non vu en TP)

9 Les Rhizopus (non vu en TP)
Cosmopolites et ubiquitaires Environ 12 espèces de Rhizopus Allergies de type I et III Mycoses : mucormycoses Industries agro-alimentaires (fromages, fermentations diverses), chimiques (alcool, acides organiques) et papetières

10 Les Mucor (non vu en TP)

11 Les Mucor (non vu en TP) Cosmopolites et ubiquitaires
Environ 50 espèces de Mucor Allergies de type I et III Mycoses (rares) : mucormycoses Industries agro-alimentaires (fromages)

12 Champignons supérieurs
Classe des Ascomycètes

13 Les Ascomycètes Les champignons de la Classe des Ascomycètes sont caractérisés par : Un mycélium cloisonné (= septé = articulé) Une multiplication asexuée par conidies : modes de conidiogénèse très variés Une reproduction sexuée : ascospores dans les asques

14 Intérêts des Aspergillacées
Les Aspergillus Moisissures très communes : bois, pain, confiture, fruits, … Biodétérioration : textiles, papiers, cuirs, matières plastiques, matériels électroniques et optiques, … Mycotoxicoses : aflatoxines, ochratoxine, … Mycoses souvent graves : API, aspergillome, ABPA, AAE, … Industrie chimique : acides (citrique, gluconique, oxalique, fumarique, gallique, …), dextranes, amylases, … Les Penicillium Industries agro-alimentaires : affinage de fromages (roqueforts, bleus, camemberts, …) Pourriture des fruits : agrumes, pommes Mycotoxicose : patuline Industrie pharmaceutique : antibiotique (pénicilline), antifongique (griséofulvine) Industrie chimique : acide citrique, … Mycose tropicale : pénicilliose à Penicillium marneffei

15 Aspects macroscopiques

16 Aspergillus flavus Phialoconidies Phialides Métules Vésicule
Conidiophore (stipe) Aspérités

17 Aspergillus ochraceus
Zones concentriques

18 Aspergillus niger (non vu en TP)

19 Aspergillus versicolor (non vu en TP)

20 Penicillium frequentans
Phialoconidies Phialides Conidiophore (stipe)

21 Complexité du conidiophore

22 Complexité du conidiophore
Penicillium

23 Chaetomium globosum Ascocarpe : périthèce Asques Ascospores

24 Les Chaetomium Cosmopolites et ubiquitaires, très communs
Environ 80 espèces de Chaetomium Intérêt industriel : production de cellulase Mycotoxines : chaetomine, sterigmatocystine chez quelques espèces de Chaetomium, chaetoglobosines chez Chaetomium globosum Mycoses (rares) : onychomycose Allergie de type I ? Phytopathogènes

25 Champignons supérieurs
« Classe » des Deutéromycètes

26 Aspergillus fumigatus (non vu en TP)

27 Aspergillus fumigatus
Un des 3 principaux agents responsables de mycoses profondes (avec Candida albicans et Cryptococcus neoformans) Responsable de 95 % des aspergilloses, notamment de l’aspergillose pulmonaire invasive (API), mais également d’aspergilloses allergiques (ABPA, AAE)

28 Fusarium oxysporum

29 Les Fusarium Cosmopolites et ubiquitaires, très communs
50 à 70 espèces de Fusarium Phytopathogènes Mycotoxines : trichothécènes, toxine T-2, zéaralénone (= toxine F-2), vomitoxine, déoxynivalénol, fumonisine, … Mycoses graves (kératites, endophthalmies, onychomycoses, mycétomes), notamment chez les patients immunodéprimés (fusariose profonde, résistante aux antifongiques) et chez les grands brûlés Allergies de type I Intérêt vétérinaire : zéaralénone (stimulant de croissance animale, anabolisant, contraception)

30 Alternaria alternata

31 Les Alternaria Cosmopolites et ubiquitaires, très communs
40 à 50 espèces d’Alternaria Phytopathogènes Allergies de type I et III Mycoses (rares) : lésions sous-cutanées, onychomycoses Mycotoxines : alternariol, alternariol monométhylether (AME), acide tenuazonic, altertoxines (mutagénique)

32 Stemphylium botryosum

33 Les Stemphylium Cosmopolites et ubiquitaires 6 espèces de Stemphylium
Phytopathogènes Allergies de type I Mycoses (très rares) : sinusites

34 Cladosporium herbarum

35 Les Cladosporium Cosmopolites et ubiquitaires, extrêmement communs
28 à 40 espèces de Cladosporium Phytopathogènes Allergies de type I et III Mycoses tropicales : chromoblastomycoses ( Cladiophialophora carrionii, C. bantiana) Mycotoxines : cladosporine, émodine (toxicité ?) Intérêt pharmaceutique : bioconversion de précurseurs stéroïdiens en progestérone et pregnenolone

36 Aureobasidium pullulans

37 Les Aureobasidium Cosmopolites et ubiquitaires
15 espèces d’Aureobasidium Phytopathogènes Allergies de types I et III Mycoses (rares) : lésions cutanées, kératites, abcès splénique Intérêt industriel (préparation de textiles) et agro-alimentaire (pullulane : polysaccharide biodégradable, utilisé pour la protection d’aliments) Anthracnose

38 Scopulariopsis brevicaulis

39 Les Scopulariopsis Mycoses (rares) : onychomycoses, lésions cutanées, mycétomes, sinusites, kératites, … Arsine (gaz mortel) à partir de l’arsenate des colorants de papiers muraux (historique)

40 Trichothecium roseum

41 Les Trichothecium 2 ou 3 espèces de Trichothecium ? Phytopathogène
Mycotoxines : trichothécine (toxicité ?) Parasite de macromycètes Nodule noir du prunier