Que valent les tests biologiques de mesure de l’incidence du VIH ?

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1 Que valent les tests biologiques de mesure de l’incidence du VIH ?
F Barin CNR VIH & Inserm U966, Université F Rabelais & CHU Bretonneau Tours, France

2 Tests d’identification des infections récentes: rationnel
Janssen et al., JAMA 1998

3 Tests d’identification des infections récentes: rationnel
Janssen et al., JAMA 1998 Définir un seuil de discrimination entre infection « récente » et infection « ancienne ». Identifier la durée de la « période d’infection récente ». Identifier sensibilité et spécificité. Traduire des résultats individuels en données d’incidence populationnelle.

4 Tests d’identification des infections récentes: pourquoi un test « maison »?
(ANRS AC23) “Détournement” de tests commerciaux (1st/2nd generation): désensibilisation (“detuned”) ou mesure d’avidité. Question: disponibilité à moyen/long terme? BED: Test de quantification des Ac anti-IDE (gp41) initialement développé de manière « académique » (CDC). But: Développer un test permettant de discriminer entre infection < 6 mois vs > 6 mois. Nécessite de quantifier des anticorps anti-VIH apparaissant avec une cinétique relativement “constante” chez tout patient infecté, indépendamment du sous-type viral.

5 Marqueurs virologiques
10 20 30 60 2 4 6 8 jours années ARN Ag p24 Ac anti-Env Ac anti-p24 Primo-infection Sida Ly CD4+/mm3 Barin & Simon, Virologie 2013

6 gp120 (GPSU) gp41 (GPTM) V3 IDE

7 TIR: EIA-RI (IDE-V3) gp120 gp41 V3 IDE Sens. : 87.0%
HIV-1M: RYLKDQQLLGIWGCSGKLIC HIV-1D: STLKDQQLLGIWGCSGRHIC A: RKSVHIGPGQAFY B: RKSIHIGPGRAFY C: RKSIRIGPGQTFY D: RQRTHIGPGQALY CRF01-AE: RTSITIGPGQVFY ,1 ,2 ,3 ,4 ,5 ,6 ,7 ,8 ,9 1 gp120 gp41 V3 IDE AIDS Sc ≤ 180 Sc > 180 chronic Sens. : 87.0% Spec. : 98.0% (chronic) 90.9% (AIDS) Barin et al., J clin Microbiol 2005

8 TIR: limites gp120 gp41 V3 IDE Sens. : 87.0% Spec. : 98.0% (chronic)
HIV-1M: RYLKDQQLLGIWGCSGKLIC HIV-1D: STLKDQQLLGIWGCSGRHIC A: RKSVHIGPGQAFY B: RKSIHIGPGRAFY C: RKSIRIGPGQTFY D: RQRTHIGPGQALY CRF01-AE: RTSITIGPGQVFY ,1 ,2 ,3 ,4 ,5 ,6 ,7 ,8 ,9 1 gp120 gp41 V3 IDE AIDS Sc ≤ 180 Sc > 180 chronic Sens. : 87.0% Spec. : 98.0% (chronic) 90.9% (AIDS) Barin et al., J clin Microbiol 2005

9 TIR: limites Validation rétrospective dans le cadre de la surveillance virologique liée à la DO ( ): Sensibilité: 88.2 Spécificité (AIDS): 85.3 Le Vu et al, AIDS 2009

10 TIR: limites (traitement précoce)
Cohorte Primo 106 sérums séquentiels de 46 pts non traités (NT) vs 385 sérums séquentiels de 78 pts traités lors du diagnostic de primo-infection ou séroconversion très récente (T) T Barin et al., J clin Microbiol 2005

11 TIR: limites (traitement « chronique »)
- 96 patients traités (HAART) à la phase « chronique » avec charge virale indétectable depuis au moins 3 ans (T) vs 150 patients (stade « chronique non-SIDA) avant initiation du Tx (Chr), 143 patients au stade SIDA, avant initiation du Tx (Aids). T Chr Aids Nb false-recent / Nb tested (%) 28/96 (29.2) 1/150 (0.7) 10/143 (7.0) Specificity 70.8 99.3 93.0 P < 0.001 Chaillon et al., Clin Vaccine Immunol 2012

12 TIR: limites (traitement « chronique »)
Douze des 28 échantillons « faux-récents » provenaient de patients classés « non-récents » 3 ans plus tôt. T Chr Aids Nb false-recent / Nb tested (%) 28/96 (29.2) 1/150 (0.7) 10/143 (7.0) Specificity 70.8 99.3 93.0 P < 0.001 Chaillon et al., Clin Vaccine Immunol 2012

13 TIR: limites (traitement « chronique »)
Les patients « faux-récents » (n=28) avaient été traités depuis plus longtemps que ceux classés correctement (médiane: 143 vs 120 mois; p=0.02). T Chr Aids Nb false-recent / Nb tested (%) 28/96 (29.2) 1/150 (0.7) 10/143 (7.0) Specificity 70.8 99.3 93.0 P < 0.001 Chaillon et al., Clin Vaccine Immunol 2012

14 Traduire en incidence: DDS (1992-2007)
Résultats du TIR selon l’intervalle entre le dernier don négatif et le premier don positif chez les donneurs de sang (n=238). Pillonel et al, Transfusion 2008, updated

15 Traduire en incidence: DDS (1992-2007)
Incidence (méthode classique) = Nb de séroconversions chez les DR/ somme des intervalless entre le premier et le dernier don pour tous les DR (périodes de 3 ans) Incidence (EIA-RI) = nri/(Nneg+nri)(T/365) x 105 according to Janssen et al., JAMA 1998. Pillonel et al, Transfusion 2008, updated

16 Traduire en incidence: données de la DO
Données de la DO VIH: 42,330 nouveaux diagnostics ( ). Estimation de l’incidence selon un modèle (stratified extrapolation approach) développé par Karon et al. (Stat. Med. 2008), et appliqué par S Le Vu (InVS). Période fenêtre: 180 jours (95% CI ). Taux de « faux récents »: 0.8 % (0-3.1) chez les pts chroniques « non-SIDA ». 5.6% ( ) chez les pts au stade SIDA. Le Vu et al, Lancet Infect Dis 2010

17 Population-based HIV-1 incidence in France, 2003-2008
Le Vu et al, Lancet Infect Dis 2010

18 Population-based HIV-1 incidence in France, 2003-2008
Estimated number of new HIV-1 infections by transmission group Le Vu et al, Lancet Infect Dis 2010

19 Applications: Prevagay Prévalence: 17.7% 126/157 connus HIV+s
Détection ARV G Peytavin Velter et al, AIDS & Behavior 2013 Le Vu et al, PLoS One 2012

20 Les tests disponibles en 2014
Kassanjee et al., AIDS 2014

21 Que valent les tests biologiques de mesure de l’incidence du VIH ?
Tests d’identification des infections récentes: Tests prédictifs. Performances variables des différents tests (seuil – MDRI). Performances variables selon la population (diversité génétique du VIH, diversité génétique de la population, …). Spécificité diminuée en cas d’immunodépression avancée. Spécificité diminuée en population traitée Traduire un taux d’infections récentes en estimation d’incidence: Nécessite de connaitre les performances du test dans la population à étudier. Nécessite d’appliquer les données obtenues selon des modèles validés. Dialogue nécessaire entre biologistes, biostatisticiens et épidémiologistes.

22 Dominique Costagliola
Sylvie Brunet Damien Thierry Antoine Chaillon Francis Barin CNR VIH Inserm UMR966 Université de Tours Louis Bernard Frédéric Bastides Guillaume Gras CHRU Tours Stéphane Le Vu Josiane Pillonel Françoise Cazein Florence Lot Yann Le Strat Roselyne Pinget Caroline S le JC Desenclos InVS, St Maurice Laurence Meyer Inserm U822 Le Kremlin-Bicêtre Dominique Costagliola Inserm U720 UPMC, Paris Syria Laperche INTS, Paris Remerciements: Biologistes, Cliniciens, Patients.