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Publié parYolande Gervais Modifié depuis plus de 9 années
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EGEE-II INFSO-RI-031688 Enabling Grids for E-sciencE www.eu-egee.org EGEE and gLite are registered trademarks Les sites de calcul EGEE en France David Bouvet Tutorial CGG 07-10/11/2006
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet2 Plan Sites français Site grille Site de calcul –infrastructure –aspects fonctionnels –ex. –préoccupations majeures –quelques éléments de solutions (retour d’exp. IN2P3-CC) Conclusions Liens utiles
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet3 Sites français ROC Français: IN2P3-CC IN2P3-CC Lyon (Centre de Calcul de l'IN2P3) IN2P3-CC IN2P3-LPC Clermont (Laboratoire de Physique Corpusculaire) IN2P3-LPC IN2P3-CPPM Marseille (Centre de Physique des Particules de Marseille) IN2P3-CPPM GRIF Ile de France (Grille de Recherche d’Ile de France) Site distribué sur les sites : DAPNIA (CEA/Saclay), IPNO (IN2P3, Orsay), LAL (IN2P3, Orsay), LLR (Ecole Polytechnique, Palaiseau) et LPNHE (IN2P3, Paris 6) GRIF CGG Massy (Compagnie Générale de Géophysique) CGG IPSL/IPGP Paris (Institut Pierre Simon Laplace/Institut de Physique du Globe de Paris) IPSL/IPGP IN2P3-LAPP Annecy (Laboratoire d'Annecy-Le-Vieux de Physique des Particules) IN2P3-LAPP IN2P3-SUBATECH Nantes (Laboratoire de physique SUBAtomique et des TECHnologies associées) IN2P3-SUBATECH IN2P3-IRES Strasbourg (Institut de Recherches Subatomiques) IN2P3-IRES AUVERGRID Clermont (site pour une grille régionale) AUVERGRID IN2P3-LPSC Grenoble (Laboratoire de Physique Subatomique et de Cosmologie) IN2P3-LPSC
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet4 Déployer un site grille… c’est mettre le doigt dans l’engrenage de la production [P. Girard 2005]
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet5 Site grille : un autre niveau de mutualisation des ressources Centre de calcul : –Supercalculateur / Fermes de calcul ensemble de “Worker Nodes” machines hétérogènes (Hardware, OS) –Grande capacité de stockage (disques, bandes) –Gestion de communauté d’utilisateurs via les comptes (groupes et utilisateurs) –Gestion experte de la production Grille de calcul : –Mutualisation des centres de ressources –Gestion de communautés via le concept de “Virtual Organization” –Minimisation du temps de latence des utilisateurs
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet6 Site grille : un autre niveau de mutualisation des ressources Centre de calcul :Grille de calcul : Ferme1Ferme2 Batch System Système de partage de fichiers WN … Stockage France Resource Broker(s) Catalogue de fichiers RC Italie RC … Stockage VO
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet7 Site de calcul : infrastructure Centre de ressources / Site (SA1) –fournit à la grille des ressources de calcul des ressources de stockage éventuellement des services/VO RC France Resource Broker Catalogue de fichiers RC Italie … Stockage VO Storage Element Computing Element RB BDII LFCUI VOMSFTS
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet8 Site de calcul : aspects fonctionnels Gestion des membres d’une VO –sur les noeuds de grille, “Mapping” des membres de la VO vers la notion d’utilisateurs des systèmes d’exploitation génération d’un “grid-mapfile” sur certains services de la grille configuration faite par le site sur le noeud pour mapper le “proxy” vers le compte fonction des gestion de “pool” de comptes: egeode001, egeode002… les différents groupes et rôles se traduisent par un mapping sur des pools/comptes différents tous les pools de la VO partage le même groupe local users VO1_User VO2_User Grid-mapfile SE CE RB ACL Proxy VO VOMS ACL1 ACL2 ACL3
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet9 Site de calcul : aspects fonctionnels Publication d’information sur la grille –chaque site publie Une description des ressources/services qu’il fournit par VO L’état actuel de ses ressources (CPU libres, espace de stockage...) Sur les RC, ce qu’une VO a installé (“Tags” des Software Managers) RC3RC2 RC1RB1 RB2LFC Système d’information (BDII) Site CC-IN2P3 VO1 VO2 VO3
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet10 Site de calcul (ex.) : IN2P3-CC VO Box VO LHC Site BDII Computing Element Computing Element Storage Element Storage Element VOMS 4 VOs LFC Central Biomed HPSS DCACHE Storage Element SRM Gridftp XFS Stockage BQS Anastasie WN Calcul LFC Local 4 VOs LHC FTS 4 VOs LHC MonBox 4 Sites Système d’informatio n de la grille VO Box VO LHC V OBox VO LHC VO Box VO LHC
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet11 Site de calcul : préoccupations majeures Services de grille critiques –indisponibilité des services de VO (VOMS, LFC, FTS, …) impossibilité pour la VO d’utiliser la grille –indisponibilité du système d’information du site (site BDII) disparition des services critiques du système d’information globale Sécurité –traçabilité de l’utilisation des nœuds grilles –trou de sécurité introduit par le M/W Gestion des données des VO –indisponibilité/perte des données applicatives (Storage Element) –indisponibilité/perte des données de service spécifiques aux VO : BD des membres d’une VO ou des catalogues de fichiers d’une VO Tags des VO enregistrés sur les CE (indiquant les softwares installés sur le site par la VO) software des VO installés sur les espaces partagés Mises à jour du Middleware/Changements de configuration –dysfonctionnement dû à de mauvaises configurations, des nouveaux bugs, etc. ex. : mauvaise publication d’un CE créant un « trou noir » sur la grille (7000 Jobs d’Atlas en 1 nuit en mai pour IN2P3-CC) –rupture de services –perturbation/rupture de la production locale
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet12 Site de calcul (ex. IN2P3-CC) : quelques éléments de solution (1) Disposer d’une infrastructure de test/validation –pour éprouver le M/W, son installation, mieux le comprendre et donc le maîtriser avant de le mettre en production utilisation de la technologie des machines virtuelles (5 serveurs VMWare avec 4 machines virtuelles) économique gain de temps grâce au clonage d’images de référence adaptée aux installations répétées évite l’intervention des administrateurs systèmes pour des réinstallation à répétition permet de disposer de services de grille hors production nécessaires aux tests d’autres noeuds.
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet13 Site de calcul (ex. IN2P3-CC) : quelques éléments de solution (2) Utiliser l’expertise locale et déléguer aux experts la part qui leur incombe –toutes nos BD sont en charge de l’équipe « Bases de Données » –l’installation du système et la gestion réseau des nœuds grille sont assurées par l’équipe « Systèmes et Réseaux » une grande partie des problèmes de sécurité est couverte par les experts en sécurité du CCIN2P3 l’environnement des nœuds de grille est cohérent avec les autres machines du parc on dispose des outils de surveillance matériel et systèmes pour les nœuds de la grille –le stockage/transfert de données est géré par l’équipe « Stockage » –le suivi des jobs « grille » est assuré par l’équipe « Production » –une partie du support aux utilisateurs grille est pris en charge par le « Support aux utilisateurs »
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet14 Site de calcul (ex. IN2P3-CC) : quelques éléments de solution (3) Communiquer des alias plutôt que des noms de machines pour les nœuds de la grille –quand le M/W le permet (pb avec les CE) –quand le nom d’un nœud entre dans la configuration d’autres nœuds de grille changement transparent de machine lors de panne ou de mise à jour de l’intergiciel L’utilisation d’une machine de rechange permet des mises à jour sans arrêt de service (BDII, CE) –le nœud de remplacement fraîchement mis à jour peut être largement testé avant son entrée en production –dans le cas d’un CE, on peut faire tourner 2 CE simultanément sans avoir à drainer le gestionnaire de jobs 1.mise en production du nouveau CE 2.fermeture de l’ancien CE (il n’accepte plus de nouveaux jobs) 3.sortie de l’ancien CE lorsque tous ses jobs sont finis
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet15 Site de calcul (ex. IN2P3-CC) : quelques éléments de solution (4) L’installation partagée des WN/UI sur AFS faire l’installation pour l’ensemble de la ferme sans altérer l’installation de chaque WN pour éviter de sortir les WN de production le temps de la mise à jour mise à jour de tous les WN en une fois durée: un drainage de la ferme (24 à 48h selon les jobs en machine) mise à jour par N lots de WN durée: N x drainage des lots de WN (24 à 48h selon les jobs en machine) de faire coexister différentes version de l’intergiciel pour les WN, mise en œuvre au niveau du CE d’un mécanisme de sélection de la version du M/W à utiliser pour un job changer de version à la volée par (re)configuration du CE GLITE3.0.0 GLITE3.0.4 CE WN CE WN AFS
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet16 Site de calcul (ex. IN2P3-CC) : quelques éléments de solution (5) Utilisation de système de « backup » pour les données contingentes –la plupart des logs des noeuds de grille est dupliquée sur une machine distante grâce au service « syslog ». Ils sont conservés 3 mois (durée définie par le projet) –les Tags des VO (sur les CE) sont sauvés régulièrement sur cette machine –les softwares de VO sont déposés sur des volumes sauvegardés d’AFS S’armer pour une surveillance active –NAGIOS (CA, CRL, site BDII, etc.) –LEMON (en cours de test) –outils « maison » ex. : surveillance de l’évolution du ratio entre le total des jobs de la grille et les jobs grille locaux. Permet de détecter des changements anormaux de fréquentation du site. Communiquer rapidement lors de la détection de problème –pour s’économiser le traitement de tickets d’incident –pour sortir de production si besoin est Collaborer avec d’autres sites pour répliquer les services critiques
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet17 Conclusions Déployer et gérer un site grille de production fait appel à plusieurs rôles –administration Réseaux et Systèmes, administration et exploitation de fermes de calcul, administration et exploitation de serveurs de stockages, support aux utilisateurs et aux VO, administration de base de données, expert « grille » Comprendre le middleware et son installation pour –l’adapter à son infrastructure –être réactif mais aussi proactif « Etre proactif, c’est faire des footings dès septembre pour perdre les kilos qu’on prendra aux fêtes de fin d’année. » [P. Girard, 2006] prévoir les pannes, les évolutions possibles, et s’affranchir tant que possible de dépendances externes collaborer avec d’autres sites pour garantir la pérennité des services critiques La stabilité du middleware s’est grandement améliorée –l’effet « production » contribue à cette stabilité la multiplication d’utilisateurs et de sites est la meilleure garantie d’une stabilité vite retrouvée la mise en place d’une infrastructure opérationnelle –elle repose encore sur une logique de « best effort » et de savoir-faire manque d’outils d’administrations (administrer n’est pas configurer) manque de documentation mais aussi trop d’information (mails, wikis, sites web, …) devrait s’améliorer avec le nouveau middleware, l’utilisation de standard, et la pression mise par les sites
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet18 Liens utiles COD operators –rotation sur les ROC pour fournir une équipe d’opérateurs de surveillance (CIC On Duty) User support : GGUS – https://gus.fzk.de/pages/home.phphttps://gus.fzk.de/pages/home.php Outils de monitoring –CIC portal https://cic.in2p3.fr https://cic.in2p3.fr point d’entrée sur les autres outils vue intégrée des autres outils à l’usage des COD opérateurs –Service Availability Monitoring (SAM) https://lcg-sam.cern.ch:8443/sam/sam.py https://lcg-sam.cern.ch:8443/sam/sam.py –Grid Operations Centre Core Database (GOCDB) https://goc.grid-support.ac.uk/gridsite/gocdb2 https://goc.grid-support.ac.uk/gridsite/gocdb2 –GIIS monitor (Gstat) http://goc.grid.sinica.edu.tw/gstat http://goc.grid.sinica.edu.tw/gstat –GOC monitoring tools http://goc.grid-support.ac.uk/gridsite/monitoring/ http://goc.grid-support.ac.uk/gridsite/monitoring/ –GOC job monitor http://gridportal.hep.ph.ic.ac.uk/rtm/ http://gridportal.hep.ph.ic.ac.uk/rtm/ Accounting –http://goc.grid- support.ac.uk/gridsite/accounting/index.htmlhttp://goc.grid- support.ac.uk/gridsite/accounting/index.html
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Enabling Grids for E-sciencE Tutorial CGG – 07-10/11/2006David Bouvet19 Merci
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