GB18 training sessions, Buenos Aires, Argentine Outils et ressources pour évaluer et améliorer l’aptitude des données à être utilisées Nicolas Noé

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1 GB18 training sessions, Buenos Aires, Argentine Outils et ressources pour évaluer et améliorer l’aptitude des données à être utilisées Nicolas Noé (niconoe@ulb.ac.be) Développeur – Plateforme Belge Biodiversité Global Biodiversity Information Facility (GBIF) Le 30 septembre 2011

2 Aperçu Outils pour: – Métadonnées – Données spatiales – Données tabulaires Autres ressources – Données – Documents

3 Outils Pour les métadonnées

4 Métadonnées et IPT (Dwc-A) http://code.google.com/p/gbif-providertoolkit/

5 Couverture géographique

6 Darwin Core Archive Validator http://tools.gbif.org/dwca-validator/

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8 Outils Pour les données spatiales

9 GeoLocate http://www.museum.tulane.edu/geolocate/ http://www.museum.tulane.edu/geolocate/ -1 à la fois ou par lot -Plusieurs fonds de carte -Correction (déplacement du marqueur) -Versions en ligne, native et collaborative

10 InfoXY http://splink.cria.org.br/infoxy?criaLANG=en http://splink.cria.org.br/infoxy?criaLANG=en

11 spOutlier http://splink.cria.org.br/outlier?&setlang=en http://splink.cria.org.br/outlier?&setlang=en Saisie lat / lon / altitude Données terrestres ou marines Carte en sortie Analyses statistiques

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13 Georeferencing Calculator Entrée: Coordonnées, offset, sources d’erreurs Sortie: Coordonnées finales Estimation de l’erreur

14 Diva-GIS http://www.diva-gis.org/ http://www.diva-gis.org/ SIG de base Gratuit Orienté biologie Vectorielle/bit map Compatible avec de nombreux format

15 Quantum GIS http://www.qgis.org http://www.qgis.org SIG généraliste Gratuit et Open- Source Compatible avec de nombreux formats / dbs / services Mac/Linux/Windo ws Vector/Raster Extensible

16 The R-project http://www.r-project.org http://www.r-project.org Environnement et language de programmation pour l’analyse statistique Permet l’analyse et la visualisation. S’intègre avec les SIG, les languages de programmation

17 Outils Pour les données tabulaires

18 Name Parser Atomisation des champs Noms en 3 parties Ignores variétés et autres subdivisions (en dessous de la sous-espèce)

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20 Name Finder http://tools.gbif.org/namefinder/ http://tools.gbif.org/namefinder/ Trouver les noms scientifiques mentionnés Entrée: Fichier URL Texte libre

21 Name Finder Sortie: Compteur Noms détectés Noms interprétés

22 Taxon Tagger Entrée: URL Fichier PDF Sortie: Nom scientifique Taxonomie de niv. supérieur

23 Checklist Bank Sortie: Sortie de plus haut niveau Entrée: Noms scientifiques

24 Darwin Test DARWIN TEST est une application pour tester et valider les enregistrements de données au format Darwin Core 1.2 / 1.4 et Darwin Core Archive Chaque test peut être activé ou non Extensible (nouveaux tests) Conversions de coordonnées (UTM, decimal degrees,...) Comparer les noms à des bases de données telles que Species2000 Détection des erreurs d’encodage Généralisation des données géographiques (données sensibles). Basé sur MS-Access Open Source Interface graphique

25 Cartes faciles ! Hébergement et MAJ online Geocode Fusion avec d’autres données Possibilité de faciliter la collaboration Google Fusion Tables

26 Langages dynamiques / scripting...et même SQL Ci-contre: geocoding Avec 5 ou 10 lignes de plus, tout devient possible

27 Google Refine Démonstration ! http://code.google.com/p/google-refine/ Vidéos, téléchargements… (en Anglais)

28 Autres ressources Données

29 OpenStreetMap ou "Wikipedia des cartes" Source de données réutilisables: License libre Exportable dans différents formats Négatif Qualité des données variable http://www.openstreetmap.org

30 Thesauri Checklists thématiques: o Poissons : FishbaseFishbase o Animaux: Index to Organism Name (ION)Index to Organism Name (ION) o Mammifères: Mammal Species of the World (MSW)Mammal Species of the World (MSW) o Bactéries: List of Bacteria with Standing in Nomenclature (LBSN)List of Bacteria with Standing in Nomenclature (LBSN) Codes pays o ISO 3166-1 ou ISO3166-2, disponible par exemple au format Access...

31 Autres ressources Documents

32 GBIF Position Paper on Future Directions and Recommendations for Enhancing Fitness-for-Use Across the GBIF Network http://www.gbif.org/orc/?doc_id=2777

33 Inventaire BDQ (GBIF Espagne) http://www.gbif.es/BDQ.php

34 GBIF Online Resource Centre http://www.gbif.org/orc/ Recherche et téléchargement Adéquation à l’usage Meilleures pratiques Manuels de formation

35 Questions Merci