Protéine.

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1 Protéine

2 TRANSCRIPTION TRADUCTION

3 Les protéines Essentielles pour la cellule Rôle structural
Role fonctionnel Mobililité cellulaire Transport moléculaire Métabolisme (enzyme = catalyse des réactions chimiques) Régulation,...

4 Les protéines sont des polymères d’acides aminés

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6 20 acides aminés naturels

7 Les acides aminés peuvent être classés selon différents critères physico-chimiques
degré d'hydrophobie (caractère aliphatique), charge, capacité à échanger des liaisons hydrogène,… relations physico-chimiques existant entre les 20 acides aminés naturels  1D  3D

8 Les propriétés structurales et fonctionnelles des protéines dérivent des propriétés chimiques de la chaîne polypeptidique Folding problem

9 linéaire Alpha Helix & Beta Strand globulaire

10 Repliement de la chaîne polypeptidique (fold)
Conformation native = conformation préférentielle stable

11 Organisation en domaines structuraux et fonctionnels
Taille des protéines : ~ 60 aa  aa moyenne: 300 aa Les chaînes polypetidiques de plus de 200 résidus peuvent se replier en deux ou plusieurs blocs = domaines N-term. C-term. Domaine 1 Domaine 2

12 Comparaison de séquences pour inférer des connaissances
% identité Identité de séquence = identité de structure 3D = identité de fonctions 100 90 80 70 Comparaison de séquences pour inférer des connaissances 60 50 40 30 Alignement de séquences (A. Viari) 20 10

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14 His Cys His Cys Exemple de motif: site de fixation d ’un ion (sphère grise) : résidus C C H H Les acides aminés constituant le motif ne sont pas contigus sur la séquence primaire

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18 Evènement de SPECIATION

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20 Evènement de DUPLICATION

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